Одночасний докінг противірусних агентів та ціанінових барвників з білками

  • Ольга Житняківська Кафедра медичної фізики та біомедичних нанотехнологій, Харківський національний університет імені В.Н. Каразіна, Харків, Україна https://orcid.org/0000-0002-2068-5823
  • Уляна Тарабара Кафедра медичної фізики та біомедичних нанотехнологій, Харківський національний університет імені В.Н. Каразіна, Харків, Україна https://orcid.org/0000-0002-7677-0779
  • Катерина Вус Кафедра медичної фізики та біомедичних нанотехнологій, Харківський національний університет імені В.Н. Каразіна, Харків, Україна https://orcid.org/0000-0003-4738-4016
  • Валерія Трусова Кафедра медичної фізики та біомедичних нанотехнологій, Харківський національний університет імені В.Н. Каразіна, Харків, Україна https://orcid.org/0000-0002-7087-071X
  • Галина Горбенко Кафедра медичної фізики та біомедичних нанотехнологій, Харківський національний університет імені В.Н. Каразіна, Харків, Україна https://orcid.org/0000-0002-0954-5053
Ключові слова: противірусні агенти, білкові наночастинки, наноносії ліків, ціанінові барвники, молекулярний докінг

Анотація

Білкові наночастинки наразі розглядаються як перспективні біосумісні та біодеградовні системи для цілеспрямованої доставки фармакологічних агентів різних класів. Перед створенням наносіїв ліків такого типу доцільно здійснити оцінку спорідненості лікарських препаратів до білків та охарактеризувати можливі способи взаємодії з використанням комп’ютерних підходів, зокрема, методу молекулярного докінгу. Дане дослідження було проведене з метою оцінки можливості створення білкових наночастинок, навантажених противірусними препаратами та ціаніновими барвниками у якості візуалізуючих агентів. Компоненти досліджуваних систем були представлені ендогенними функціональними білками цитохромом с, сироватковим альбуміном, лізоцимом та інсуліном; противірусними агентами фавіпіравіром, молнупірівіром, нірматрелвіром і рітонавіром; моно- та гептаметиновими ціаніновими барвниками. З використанням методу одночасного молекулярного докінгу багатьох лігандів було продемонстровано, що: i) лікарські препарати та барвники займають різні центри зв’язування  на білковій молекулі; ii) гептаметини AK7-5 та AK7-6 мають найвищу спорідненість до білків; iii) серед досліджених систем найміцніші комплекси утворюються між  гептаметиновими барвниками та сироватковим альбуміном. В цілому, отримані результати свідчать про те, що наночастинки на основі альбуміну, функціоналізовані гептаметиновими ціаніновими барвниками, можуть бути застосовані для таргетної доставки  досліджуваних противірусних агентів.

Завантаження

##plugins.generic.usageStats.noStats##

Посилання

A. Sultana, M. Zare, V. Thomas, T.S. Kumar, S. Ramakrishna, Med. Drug Discov. 15, 100134 (2022). https://doi.org/10.1016/j.medidd.2022.100134

T. Fazal, B.N. Murtaza, M. Shah, S. Iqbal, M. Rehman, F. Jaberf, A.A. Dera, et al., RSC Adv. 13, 23087-23121 (2023). https://doi.org/10.1039/D3RA03369D

J.A. Finbloom, C. Huynh, X. Huang, and T.A. Desai, Nature Reviews Bioengineering, 1, 139–152 (2023). https://doi.org/10.1038/s44222-022-00010-8

E. Kianfar, J. Nanobiotechnol. 19, 159 (2021). https://doi.org/10.1186/s12951-021-00896-3

A.L. Martínez-López, C. Pangua, C. Reboredo, R. Campión, J. Morales-Gracia, and J.M. Irache, Int. J. Pharm. 581, 119289 (2020). https://doi.org/10.1016/j.ijpharm.2020.119289

A. Jain, S.K. Singh, S.K. Arya, S.C. Kundu, and S. Kapoor, ACS Biomater. Sci. Eng. 4, 3939–3961 (2018). https://doi.org/10.1021/acsbiomaterials.8b01098

E. Miele, G.P. Spinelli, E. Miele, F. Tomao, S. Tomao, Int. J. Nanomedicine 4, 99–105 (2009). https://doi.org/10.2147/ijn.s3061

J.A. Carvalho, A.S. Abreu, V.T. Ferreira, E.P. Gonçalves, A.C. Tedesco, J.G. Pinto, J. Ferreira-Strixino, et al., J. Biomater. Sci. Polym. Ed. 29, 1287–301 (2018). https://doi.org/10.1080/09205063.2018.1456027

S. Hong, D.W. Choi, H.N. Kim, C.G. Park, W. Lee, and H.H. Park, Pharmaceutics, 12, 604 (2020). https://doi.org/10.3390/pharmaceutics12070604

V.M. Trusova, O.A. Zhytniakivska, U.K. Tarabara, K.A. Vus, and G.P. Gorbenko, J. Pharm. Biomed. Anal. 233, 115448 (2023). https://doi.org/10.1016/j.jpba.2023.115448

P. Csizmadia, in: Proceedings of ECSOC-3, the third international electronic conference on synthetic organic chemistry, (1999), pp. 367-369. https://doi.org/10.3390/ECSOC-3-01775

M.D. Hanwell, D.E. Curtis, D.C. Lonie, T. Vandermeersch, E. Zurek, and G.R. Hutchison, J. Cheminform. 4, 17 (2012). https://doi.org/10.1186/1758-2946-4-17

E. Pettersen, T. Goddard, C. Huang, G. Couch, D. Greenblatt, E. Meng, T. Ferrin, J. Comput. Chem. 25, 1605–1612(2004). https://doi.org/10.1002/jcc.20084

D. Schneidman-Duhovny, Y. Inbar, R. Nussinov, and H.J. Wolfson, Nucl. Acids. Res. 33, W363 (2005). https://doi.org/10.1093/nar/gki481

M.F. Adasme, K.L. Linnemann, S.N. Bolz, F. Kaiser, S. Salentin, V.J. Haupt, and M. Schroeder, Nucl. Acids. Res. 49, W530 W534 (2021). https://doi.org/10.1093/nar/gkab294

E.F. Pettersen, T.D. Goddard, C.C. Huang, G.S. Couch, D.M. Greenblatt, E.C. Meng, and T.E. Ferrin, J. Comput. Chem. 25, 1605 (2004). https://doi.org/10.1002/jcc.20084

Опубліковано
2023-09-04
Цитовано
Як цитувати
Житняківська, О., Тарабара, У., Вус, К., Трусова, В., & Горбенко, Г. (2023). Одночасний докінг противірусних агентів та ціанінових барвників з білками. Східно-європейський фізичний журнал, (3), 585-591. https://doi.org/10.26565/2312-4334-2023-3-69

Найбільш популярні статті цього автора (авторів)

<< < 1 2