Аналіз впливу мутацій в гені LMNA на просторову структуру ламіну А і характер його взаємодії з емерином і SREBP1
Анотація
Моделювання структури імуноглобулін-подібного домену мутантних форм ламіну виявило помітні зміни геометрії поліпептидного остову даної частини молекули тільки при мутації R527C. Експонування заряджених амінокислот і профіль гідрофобності більш виражено змінювалися, відповідно, при мутаціях G465D і R482L, що супроводжувалося значними змінами спорідненості до емерину і SREBP1. Тільки для мутації R482L відмічено підвищення спорідненості до обох білкiв-партнерiв, у той час як для інших мутантних білків спорідненість підвищувалася до SREBP1 і знижувалася до емерину.
Завантаження
Посилання
Bruston F., Delbarre E., Ostlund C. et al. Loss of a DNA binding site within the tail of prelamin A contributes to altered heterochromatin anchorage by progerin // FEBS Lett. – 2010. – Vol.584 (14). – P. 2999–3004.
Clements L., Manilal S., Love D., Morris G. Direct interaction between emerin and lamin A // Biochem. Biophys. Res. Commun. – 2000. – Vol.267. – P. 709–714.
Dechat T., Adam S., Taimen P. et al. Nuclear Lamins // Cold Spring Harb. Perspect. Biol. – 2010. – Vol.2 (11). – P. 1–22.
Guelen L., Pagie L., Brasset E. et al. Domain organization of human chromosomes revealed by mapping of nuclear lamina interactions // Nature. – 2008. – Vol.453 (7197). – P. 948–951.
Lloyd D., Trembath R., Shackleton S. A novel interaction between lamin A and SREBP1: implications for partial lipodystrophy and other laminopathies // Hum. Mol. Genet. – 2002. – Vol.11. – P. 769–777.
Mattout A., Goldberg M., Tzur Y. et al. Specific and conserved sequences in D. melanogaster and C. elegans lamins and histone H2A mediate the attachment of lamins to chromosomes // J. Cell. Sci. – 2007. – Vol.120. – P. 77–85.
Ritchie D.W., Venkatraman V. Ultra-fast FFT protein docking on graphics processors // Bioinformatics. – 2010. – Vol.26. – P. 2398–2405.
Sakaki M., Koike H., Takahashi N. et al. Interaction between emerin and nuclear lamins // J. Biochem. – 2001. – Vol.129. – P. 321–327.
Szczerbal I., Foster H.A., Bridger J.M. The spatial repositioning of adipogenesis genes is correlated with their expression status in a porcine mesenchymal stem cell adipogenesis model system // Chromosoma. – 2009. – Vol.118 (5). – P. 647–663.
Zhang Y., Skolnick J. TM-align: a protein structure alignment algorithm based on the TM-score // Nucleic Acids Res. – 2005. – Vol.33 (7). – P. 2302–2309.
Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої її публікації на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License 4.0 International (CC BY 4.0), яка дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи.
