Physical mechanisms of interaction of actinocin derivatives with DNA. 7. Piezogravimetric study of DNA complexes with actinocin derivatives
Abstract
The hydration isotherms of thymus DNA, actinomycin derivatives with a different number of methylene groups in side chains, and their complexes are received by a quartz crystal microbalance. It is found that the sorption ability of water molecules for complexes is less than for free DNA and depends on the length of side methylene chains: complexes with longer side chains of ligand adsorb a smaller number of water molecules. Experimental hydration isotherms were compared with model isotherms obtained by the modified D'Arsi-Watt equation. It allows us to determine the dependence of the constant of water-binding with complexes on the length of methylene chains. It is found that the binding constants for complexes are greater than ones for free DNA. The heats of water adsorption on DNA and its complexes at a different level of adsorption are calculated. It is shown that the interaction with water molecules gives an appreciable contribution (50-60 %) to the stabilization energy of DNA in complexes.
Downloads
References
2. Семенов М. А., Сагайдакова Н.Н., Больбух Т.В. и др. // Вісн.ХДУ №497. Біофізичний вісник. 2000. Вип.2(7). С. 16-23
3. Семенов М. А., Круглова Е.Б., Духопельников Е. В.., Больбух Т. В., Малеев В.Я. // Вісн.ХДУ №528. Біофізичний вісник. 2001. Вип.2 (9). С.33-39
4. Березняк Е. Г., Семенов М. А.., Больбух Т. В., Духопельников Е.В. и др. // Вісн.ХДУ. Біофізичний вісник 2002 (в печати)
5. Семенов М. А., Больбух Т.В., Березняк Е.Г., Зинченко А.В., Малеев В.Я. // Вісн.ХДУ №528. Біофізичний вісник. 2001. Вип.2(9). С.40-44
6. Semenov M.A., Bereznyak E.G. //Comments Mol. Cel.Biophys. 2000. V.1O. №1. P.I-23
7. Berman H. M., Stallinges W., Corell H.L. and Glusker J.P. // Biopolymers. 1979. V. 18. P.2405-2429
8. Dongherty G. // Analytical Biochemistry. 1981 V. 115, P52-57
9. Семенов М. А., Больбух Т.В. // Биополимеры и клетка. 1987. Т.З. №5. С.234-240
10. Зенгер В. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот. М.: Мир. 1987. 584 с.
11. Neidle S., Berman H.M., Shich H.S. //Nature. 1980. V.288. P. 129-133
12. Семенов М.А., Малеев В. Я., Глибин Е.Н., Круглова Е.Б., Гасан А. И., Больбух Т. В., Березняк Е. Г., Шесгопалова А.В. Физические явления в твердых телах. Материалы 5-й международной конференции. Харьков. 2001. с 74
13. Больбух Т.В., Семенов М.А., Малеев В.Я., Сечкин В.В. Использование метода кварцевого резонатора для получения изотерм гидратации полинуклеотидов// Харьков. 1983. Препринт ИРЭ АН УССР. №228
14. Semenov M.A., Starikov E.B. and Bolbukh T.V. // Studia biophysika. 1988. V.123., №3. P. 217-224
15. Кривцова М. А., Морошкина Е.Б., Глибин Е.Н., Фрисман Э.В. // Мол.биология. 1982. Т.16. Вып. 1. С.149-155
16. Глибин Е.Н., Цукерман В.Б., Гинзбург О.Ф. //ЖОрХ. 1981. Т. 17. Вып.З. С.657-663
17. Гинзбург О.Ф., Глибин Е.Н., Коршунова З. И., Кривцова М. А., Яворская Н. П., Софивина З.П., Цимбалова С.С. // А.с.№677293 (СССР). 1992. БИ. №15
18. Спирин А.С. // Биохимия. 1958. Т.23. С.656-662
19. Gascoyne P.R.C., Pethig P. // J. Chem. Soc. Faradey Trans. 1977. V.l. P. 171-180
20. Герасимов Я. И., Древинг В.П., Еремин.Е.Н. и др. Курс физ-химии. М-Л.: Химия. 1964. 452с.
21. Химмельблау Д: Прикладное нелинейное программирование. М.: Мир. 1975. 534 с.
22. Стариков Е.Б., Больбух Т.В., Семенов М.А. Изучение изотерм гидратации нуклеиновых кислот // Харьков. 1987. Препринт ИРЭ АН УССР. №359
23.Fаlк М., Нагtmап К.А.//J.Аmег. Сhem.Soc. 1962. V.84. №20. Р.3843-3845
Authors who publish with this journal agree to the following terms:
- Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.
- Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.
- Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
