Спектроскопічне та калориметричне дослідження системи флавін-мононуклеотид – ДНК
Ключові слова:
флавін-мононуклеотид, ДНК, калориметрія, спектрофотометрія, параметри зв'язування
Анотація
Методами диференційної скануючої калориметрії, спектрофотометрії та флюоресцентної спектроскопії проведено дослідження взаємодії флавін-мононуклеотида (ФМН) з ДНК. Показано, що термодинамічні параметри плавлення вільної ДНК практично не відрізняються від параметрів плавлення ДНК у суміші з ФМН. Константу зв'язування ФМН з ДНК розраховано з спектрофотометричних даних. Величина константи становить приблизно 50 М-1, що на декілька порядків нижче, ніж константи зв'язування біологічно активних лігандів з ДНК та константи гетероасоціації лігандів з ФМН.
Завантаження
##plugins.generic.usageStats.noStats##
Посилання
1. L. Vergani, M. Barile, C. Angelini, A.B. Burlina, L. Nijtmans, M.P. Freda, C. Brizio, E. Zerbetto, F. Dabbeni -Sala. Riboflavin therapy. Biochemical heterogeneity in two adult lipid storage myopathies// Brain. - 1999. - Vol. 122. - №. 12. – Р. 2401-2411.
2. M.P. Evstigneev, Yu.V. Mykhina, D.B. Davies. Complexation of daunomycin with a DNA oligomer in the presence of an aromatic vitamin (B2) determined by NMR spectroscopy// Biophys. Chemist. – 2005. - V. 118. - P. 118–127.
3. M.P. Evstigneev, Yu.V. Mukhina, D.B. Davies. 1H NMR study of thehetero-association of flavin-mononucleotide with mutagenic dyes: ethidium bromide and proflavine// Mol. Phys. – 2006. – V. 104. – P. 647–654.
4. A.N. Veselkov, M.P. Evstigneev, A.O. Rozvadovska, Yu.V. Mukhina, D.B.Davies. A structural and thermodynamic analysis of novatrone and flavin mononucleotide heteroassociation in aqueous solution by 1H NMR spectroscopy// Russ. J. Bioorgan. Chem. – 2005.-V. 31.- P. 453–459.
5. A.N. Veselkov, M.P. Evstigneev, A.O. Rozvadovskaya, Yu.V. Mukhina, K.A. Rybakova, D.B. Davies, 1H NMR analysis of the complex formation of aromatic molecules of antibiotic and vitamin in aqueous solution: Heteroassociation of actinomycin D and flavin mononucleotide// Biophysics. -2005.-V. 50. - P. 20–27.
6. D.J. Patel, A.K. Suri. Structure, recognition and discrimination in RNA aptamer complexes with cofactors, amino acids, drugs and aminoglycoside antibiotics // J.Biotechnol. - 2000. - V. 74(1). - P. 39-60.
7. M.P. Evstigneev, Yu.V. Mukhina, D.B. Davies. Complexation of daunomycin with a DNA oligomer in the presence of an aromatic vitamin (B2) determined by NMR spectroscopy// Biophys. Chemist. -2005.-V. 118.-P. 118–127.
8. N. Dardare, M.S. Platz. Binding Affinities of Commonly Employed Sensitizers of Viral Inactivation// Photochemistry and Photobiology. – 2002. - V. 75(6). - P. 561–564.
9. K. Kuratomi, Y. Kobayashi. Studies on the interactions between DNA and flavins// Biochem. Biophys. Acta.- 1977. –V. 476.- P. 207–217.
10. Е.Г. Березняк, Н.А. Гладковская, Е.В. Духопельников, A.C. Хребтова, А.В. Зинченко. Особенности взаимодействия профлавина с ДНК при различных соотношениях их концентраций// Биофизика. -2009. – T. 54. - В.5. - C. 805-812.
11. F. Barcelо, D. Capо, J. Portugal. Thermodynamic characterization of the multivalent binding of chartreusin to DNA// Nucleic Acids Research. – 2002. - Vol. 30. - №. 20. - Р. 4567-4573.
12. H. Grajek, I. Gryczynski, P. Bojarski, Z. Gryczynski, Sh. Bharill, L. Kułak. Flavin mononucleotide fluorescence intensity decay in concentrated aqueous solutions// Chemical Physics Letters. – 2007. – V. 439. - Р. 151–156.
13. J. T. M. Kennis, S. Crosson, M. Gauden, I. H. M. van Stokkum, K. Moffat, R. van Grondelle Primary Reactions of the LOV2 Domain of Phototropin, a Plant Blue-Light Photoreceptor// Biochemistry. - 2003. - V. 42 (12). – Р. 3385-3392.
14. А.Т. Карапетян, П.О. Вардеванян, М.Д. Франк-Каменецкий. Влияние концентрации ионов на теплоту перехода спираль-клубок ДНК// Биополимеры и клетка.- 1989. - Т.5. - № 5. - С. 31-37.
15. A.T. Karapetian, P.O. Vardevanian, M.D. Frank-Kamentskii. Enthalpy of Helix-Coil Transition of DNA Depence on Na+ Concentration and GC Content// J. Biomol. Struct. Dyn. – 1990. - V. 8(1). - P. 131-138.
16. J.D.McGhee, P.H. von Hippel. Theoretical aspects of DNA-Protein interactions: Cooperative and non-cooperative binding of large ligands to a one-dimensional homogeneous lattice// J. Mol. Biol. - 1974. – V. 86. - P. 469-489.
17. J.B. Chaires. Energetics of drug-DNA interactions// Biopolymers.- 1997. – V. 44(3). - P. 201-15.
18. L.-P. Lin, L.-S. Huang, C.-W. Lin, C.-K. Lee, J.-L. Chen, S.-. Hsu, Sh. Lin. Determination of Binding Constant of DNA-binding Drug to Target DNA by Surface Plasmon Resonance Biosensor Technology// Current Drug Targets - Immune, Endocrine & Metabolic Disorders. - 2005. - V. 5. - P. 61-72.
2. M.P. Evstigneev, Yu.V. Mykhina, D.B. Davies. Complexation of daunomycin with a DNA oligomer in the presence of an aromatic vitamin (B2) determined by NMR spectroscopy// Biophys. Chemist. – 2005. - V. 118. - P. 118–127.
3. M.P. Evstigneev, Yu.V. Mukhina, D.B. Davies. 1H NMR study of thehetero-association of flavin-mononucleotide with mutagenic dyes: ethidium bromide and proflavine// Mol. Phys. – 2006. – V. 104. – P. 647–654.
4. A.N. Veselkov, M.P. Evstigneev, A.O. Rozvadovska, Yu.V. Mukhina, D.B.Davies. A structural and thermodynamic analysis of novatrone and flavin mononucleotide heteroassociation in aqueous solution by 1H NMR spectroscopy// Russ. J. Bioorgan. Chem. – 2005.-V. 31.- P. 453–459.
5. A.N. Veselkov, M.P. Evstigneev, A.O. Rozvadovskaya, Yu.V. Mukhina, K.A. Rybakova, D.B. Davies, 1H NMR analysis of the complex formation of aromatic molecules of antibiotic and vitamin in aqueous solution: Heteroassociation of actinomycin D and flavin mononucleotide// Biophysics. -2005.-V. 50. - P. 20–27.
6. D.J. Patel, A.K. Suri. Structure, recognition and discrimination in RNA aptamer complexes with cofactors, amino acids, drugs and aminoglycoside antibiotics // J.Biotechnol. - 2000. - V. 74(1). - P. 39-60.
7. M.P. Evstigneev, Yu.V. Mukhina, D.B. Davies. Complexation of daunomycin with a DNA oligomer in the presence of an aromatic vitamin (B2) determined by NMR spectroscopy// Biophys. Chemist. -2005.-V. 118.-P. 118–127.
8. N. Dardare, M.S. Platz. Binding Affinities of Commonly Employed Sensitizers of Viral Inactivation// Photochemistry and Photobiology. – 2002. - V. 75(6). - P. 561–564.
9. K. Kuratomi, Y. Kobayashi. Studies on the interactions between DNA and flavins// Biochem. Biophys. Acta.- 1977. –V. 476.- P. 207–217.
10. Е.Г. Березняк, Н.А. Гладковская, Е.В. Духопельников, A.C. Хребтова, А.В. Зинченко. Особенности взаимодействия профлавина с ДНК при различных соотношениях их концентраций// Биофизика. -2009. – T. 54. - В.5. - C. 805-812.
11. F. Barcelо, D. Capо, J. Portugal. Thermodynamic characterization of the multivalent binding of chartreusin to DNA// Nucleic Acids Research. – 2002. - Vol. 30. - №. 20. - Р. 4567-4573.
12. H. Grajek, I. Gryczynski, P. Bojarski, Z. Gryczynski, Sh. Bharill, L. Kułak. Flavin mononucleotide fluorescence intensity decay in concentrated aqueous solutions// Chemical Physics Letters. – 2007. – V. 439. - Р. 151–156.
13. J. T. M. Kennis, S. Crosson, M. Gauden, I. H. M. van Stokkum, K. Moffat, R. van Grondelle Primary Reactions of the LOV2 Domain of Phototropin, a Plant Blue-Light Photoreceptor// Biochemistry. - 2003. - V. 42 (12). – Р. 3385-3392.
14. А.Т. Карапетян, П.О. Вардеванян, М.Д. Франк-Каменецкий. Влияние концентрации ионов на теплоту перехода спираль-клубок ДНК// Биополимеры и клетка.- 1989. - Т.5. - № 5. - С. 31-37.
15. A.T. Karapetian, P.O. Vardevanian, M.D. Frank-Kamentskii. Enthalpy of Helix-Coil Transition of DNA Depence on Na+ Concentration and GC Content// J. Biomol. Struct. Dyn. – 1990. - V. 8(1). - P. 131-138.
16. J.D.McGhee, P.H. von Hippel. Theoretical aspects of DNA-Protein interactions: Cooperative and non-cooperative binding of large ligands to a one-dimensional homogeneous lattice// J. Mol. Biol. - 1974. – V. 86. - P. 469-489.
17. J.B. Chaires. Energetics of drug-DNA interactions// Biopolymers.- 1997. – V. 44(3). - P. 201-15.
18. L.-P. Lin, L.-S. Huang, C.-W. Lin, C.-K. Lee, J.-L. Chen, S.-. Hsu, Sh. Lin. Determination of Binding Constant of DNA-binding Drug to Target DNA by Surface Plasmon Resonance Biosensor Technology// Current Drug Targets - Immune, Endocrine & Metabolic Disorders. - 2005. - V. 5. - P. 61-72.
Цитовано
Як цитувати
Bereznyak, E. G., Gladkovskaya, N. A., Dukhopelnikov, E. V., Khrebtova, A. S., & Zinchenko, A. V. (1). Спектроскопічне та калориметричне дослідження системи флавін-мононуклеотид – ДНК. Біофізичний вісник, 1(24). вилучено із https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/3865
Розділ
Молекулярна біофізика
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
