Додаток для симуляції осмотичної поведінки поодинокого еритроциту
Ключові слова:
еритроцит, моделювання, прикладне програмне забезпечення
Анотація
Описано створений додаток для симуляції релаксації осмотичного стану поодинокого еритроциту.
Програма розраховує зміни мембранного потенціалу, об'єму еритроцита, водного потоку і
концентрацій проникаючих іонів у відповідь на зміни складу оточення клітини, дозволяє
проводити симуляцію загибелі еритроцита in silico.
Завантаження
##plugins.generic.usageStats.noStats##
Посилання
1. Systems biology: from yesterday's concepts to tomorrow's discoveries / A.R. Carvunis, E.Gomez, N.Thierry-Mieg, L.Trilling L // Vidal M.Med. Sci. (Paris). – 2009. – V. 25, N. 6-7. – P. 578-584.
2. Weston A.D. Systems biology, proteomics, and the future of health care: toward predictive, preventative, and personalized medicine / A.D. Weston, L. Hood // J. Proteome Res. – 2004. – V. 3, N 2. – P. 179-196.
3. sbml.org
4. Wang D. Single cell analysis: the new frontier in 'omics' / D. Wang, S. Bodovitz // Trends Biotechnol. – 2010. – V. 28, N 6. – P. 281-290.
5. Ideker T. Boosting signal-to-noise in complex biology: prior knowledge is power / T.Ideker, J. Dutkowski, L. Hood // Cell. – 2011. – V. 144, N 6. – P. 860-863.
6. Distributions of rheological parameters in populations of human erythrocytes / I.L. Lisovskaya, E.S. Shurkhina, E.E. Yakovenko, [et al.] // Biorheology. – 1999. – V. 36, N 4. – P. 299-309.
7. Kak reguliruetsja ob#jom jeritrocita, ili chto mogut i chego ne mogut matematicheskie modeli v biologii / F.I. Ataullahanov, N.O. Korunova, I.S. Spiridonov, [i dr.] // Biologicheskie membrany. – 2009. – T. 26, № 3. - S. 163-179.
8. Dynamic simulation of the human red blood cell metabolic network / N. Jamshidi, J.S. Edwards, T. Fahland, [et al.] // Bioinformatics. – 2001. – V. 17, №3. – P. 286-297.
9. Description and analysis of metabolic connectivity and dynamics in the human red blood cell / K. Kauffman, J.D. Pajerowski, N. Jamshidi, [et al.] // Biophysical Journal. – 2002. – V. 83. – P. 646-662.
10. Lew V.L. Volume, pH, and ion-content regulation in human red cells: analysis of transient behavior with an integrated model / V.L. Lew, R.M. Bookchin // J. Membr. Biol. – 1986. – V. 92. – P. 57–74.
11. Matematicheskaja model' reguljacii ob#ema jeritrocitov / I.A. Moroz, F.I. Ataullahanov, A.B. Kijatkin, [i dr.] // Biologicheskie membrany. – 1989. – T. 6. – S. 409-419.
12. Jamshidi N. Systems biology of the human red blood cell / N. Jamshidi, B.Ø. Palsson // Blood Cells Mol Dis. – 2006. V. 36, N 2. – P. 239-247.
2. Weston A.D. Systems biology, proteomics, and the future of health care: toward predictive, preventative, and personalized medicine / A.D. Weston, L. Hood // J. Proteome Res. – 2004. – V. 3, N 2. – P. 179-196.
3. sbml.org
4. Wang D. Single cell analysis: the new frontier in 'omics' / D. Wang, S. Bodovitz // Trends Biotechnol. – 2010. – V. 28, N 6. – P. 281-290.
5. Ideker T. Boosting signal-to-noise in complex biology: prior knowledge is power / T.Ideker, J. Dutkowski, L. Hood // Cell. – 2011. – V. 144, N 6. – P. 860-863.
6. Distributions of rheological parameters in populations of human erythrocytes / I.L. Lisovskaya, E.S. Shurkhina, E.E. Yakovenko, [et al.] // Biorheology. – 1999. – V. 36, N 4. – P. 299-309.
7. Kak reguliruetsja ob#jom jeritrocita, ili chto mogut i chego ne mogut matematicheskie modeli v biologii / F.I. Ataullahanov, N.O. Korunova, I.S. Spiridonov, [i dr.] // Biologicheskie membrany. – 2009. – T. 26, № 3. - S. 163-179.
8. Dynamic simulation of the human red blood cell metabolic network / N. Jamshidi, J.S. Edwards, T. Fahland, [et al.] // Bioinformatics. – 2001. – V. 17, №3. – P. 286-297.
9. Description and analysis of metabolic connectivity and dynamics in the human red blood cell / K. Kauffman, J.D. Pajerowski, N. Jamshidi, [et al.] // Biophysical Journal. – 2002. – V. 83. – P. 646-662.
10. Lew V.L. Volume, pH, and ion-content regulation in human red cells: analysis of transient behavior with an integrated model / V.L. Lew, R.M. Bookchin // J. Membr. Biol. – 1986. – V. 92. – P. 57–74.
11. Matematicheskaja model' reguljacii ob#ema jeritrocitov / I.A. Moroz, F.I. Ataullahanov, A.B. Kijatkin, [i dr.] // Biologicheskie membrany. – 1989. – T. 6. – S. 409-419.
12. Jamshidi N. Systems biology of the human red blood cell / N. Jamshidi, B.Ø. Palsson // Blood Cells Mol Dis. – 2006. V. 36, N 2. – P. 239-247.
Цитовано
Як цитувати
Shevchenko, E. E., & Berest, V. P. (1). Додаток для симуляції осмотичної поведінки поодинокого еритроциту. Біофізичний вісник, 2(27). вилучено із https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/2544
Розділ
Методи біофізичних досліджень
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
