ИЗУЧЕНИЕ ВЛИЯНИЯ ИОНОВ Сu2+ НА ДНК В ВОДНЫХ РАСТВОРАХ, СОДЕРЖАЩИХ 1,2-ПРОПАНДИОЛ И ГЛИЦЕРИН, МЕТОДОМ ИК-СПЕКТРОСКОПИИ
Анотація
В настоящей работе методом ИК спектроскопии изучено взаимодействие ионов Сu2+ с ДНК в водных растворах, содержащих малые (до 20 об %) добавки глицерина и 1,2-пропандиола, при 29 и 45°С. Показано, что ионы Сu2+ вызывают переход ДНК в компактную форму в водном и водно-глицериновом (пропандиоловом) растворах как при 29, так и при 45°С. Этот процесс носит кооперативный характер. Добавление 1,2-пропандиола к водному раствору ДНК увеличивает кооперативность перехода ДНК в компактную форму и уменьшает концентрацию ионов Сu2+ , необходимую для индуцирования этого процесса. Эффект 1,2-пропандиола монотонно увеличивается с ростом его объемной концентрации (в интервале концентраций 0-20 об %) при 29 и 45°С. Влияние глицерина на компактизацию ДНК носит немонотонный характер: малые (4 об %) добавки глицерина к водному раствору ДНК уменьшают кооперативность перехода ДНК в компактное состояние при 29°С. Сравнение влияния малых добавок 1,2-пропандиола и глицерина, для которых изменение диэлектрической проницаемости раствора практически одинаково, на Сu2+ -индуцированную конденсацию ДНК позволяет сделать вывод о том, что конденсация ДНК под влиянием ионов Сu2+ зависит не только от диэлектрической проницаемости, но и от структуры образующегося раствора.
Завантаження
Посилання
2. Murphy L.D., Zimmerman S.B. // Biophys Chem. 1995. V. 57 (1). P. 71-92.
3. Веселков АН. Влияние внешних факторов на конформацию молекулы нуклеиновой кислоты в растворе. Дис..д-р физ.-мат. наук.Севастополь. 1988. 463с.
4. Ахрем A.A., Егорова В.П., Егоров A.C. и др. // Биополимеры и клетка 1989. вып.5. N5. С. 44-48.
5. Благой Ю.П., Галкин В.Л.. Гладченко Г.О.и др. Металлокомплексы нуклеиновых кислот в растворах. Киев: Наукова думка. 1991. - 272 с.
6. Fischman Е. // Appl. Opt. 1962. N. 1. 493.
7. Малеев В.Я., Семенов М.А. //Биофизика 1971. Т. 16. вып. 3. С. 389-397.
8. Кальвин H.H., Вельяминов С. Ю. // ЖПС. 1987. N 4. С.592-597.
9. Бабушкин A. A., Бажулин П. А., Королев Ф. В. и др. Методы спектрального анализа. М., МГУ. 1962. 273 с.
10. Taillandier Е., Liquier J. // Methods in enzymol. 1990. V. 211. P. 307-335.
11. Ahmad R., Naoui М., Neault J.F. et.al. // J. Biomol. Struct. Dyn. 1996. 13(5). P. 795-802.
12. Kornilova S.. Hackl E., Kapinos L., et.al. // Acta Biochim. Polon.1998. V. 45. N 1. P. 107-117.
13. Arscott P.. Ma Ch., Wenner J., Bloomfield V.// Biopolymers 1995. V. 36. P. 345-364.
14. Pelta J., Livolant F., Sikorav J.-L. // J of Biological Chem. V. 271. N. 10. P. 5656-5662.
15. Bloomfield V. //Curr. Struct. Biol. 1996. V.6. P. 334-341.
16. Ma C., Bloomfield V.//Biophys. J. 1994. V.67. P. 1678-1681.
17. Benbasat J.A.// Biochemistry 1984. V. 23. P. 3609-3619.
18. Хакл E.B.. Корнилова СВ., Благой Ю.П. // Вестник проблем биологии и медицины 1998. N 8. С. 41-51.
19. Tajmir-Riahi Н.А., Ahmad R, Naoui M. // J Biomol Struct Dyn. 1993. V. 10 (5). P. 865-877.
20. Zundel G. Proton polarizability of hydrogen bonds. Series of lectures, Zalzburg. 1997. 250 p.
21. Maniatis Т., Venable J. Jr, Lerman L. // J Mol Biol. 1974. V. 84(1). P. 37-64.
22. Shibata J., Schurr J.//Biopolymers. 1981. V.20. P. 525-549.
23. Duguid J.G., Bloomfield V.A.//Biophys. J. 1995. V. 69. P. 2642-2648.
24. Семенов M.A. Гидратация и структурные переходы нуклеиновых кислот в конденсированном состоянии. Дис... доктора физ.-мат. наук. Харьков. 1988. 416 с.
25. Sorokin V., Blagoi Yu., Valeev V., et.al. // J. Inorg. Biochem.1987, V. 30(2). P. 87-99.
26. Manning G. // Q Rev. Biophys. 1978, V. 11(2). P. 179-246.
27. Wilson R.W., Bloomfield V.A.// Biochemistry 1979. V. 18(11). P. 2192-2196.
28. Хакл E.B., Корнилова С. В., Соловьева А. С. и др. // Проблемы криобиологии 1998., в печати.
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).