Вплив бокових груп фенантридінових барвників на гетероасоціацію з антибіотиком дауноміцином та конкурентне зв'язування лігандів з олігомером ДНК

  • О. Н. Веселков Кафедра фізики Севастопільського національного технічного університету
  • А.О.Лантушенко Кафедра фізики Севастопільського національного технічного університету
  • Сантьяго А. Єрнандес Департамент фізики і математики, університет м. Пуебла
  • Д.Б.Девіс Департамент химії Беркбек коледжу Лондонського університету
Ключові слова: Фенантридіни, Азидо-аналогі, Дауноміцин, ЯМР спектроскопія, Гетероасоціація, Конкурентне зв'язування з ДНК

Анотація

Методом 'H ЯМР спектроскопії досліджено гетероасоціацію фенантридінових барвників, вміщуючих різик групи у бокових ланцюгах хромофору, з антрацикліновим антибіотиком дауноміцином (DAU) та їх конкурентне зв'язування з олігомером  ДНК 5'-d(TpGpCpA). При послідовному заміщенні 3,8 аміно-груп на азидо-групи спостерігається зменшення значень параметрів гетероасоціації азидо-аналогів бромистого етідію (ЕВ) - моноазиду (ЕМВ) и діазиду (EDC) етідія з DAU, що свідчить про зниження імовірності утворення міжмолекулярного водневого зв'язку між аміно-групами фенантридінового хромофора та 9МеСО групою DAU. Аналіз показав, що рівноважні процеси само асоціації, гетероасоціації та комплексоутворення лігандів з ДНК залежать від співвідношення концентрацій компонентів у змішаному розчині. Для встановлення молекулярного механізму комплексоутворення молекул в багатокомпонентному розчині, вміщуючому мутагени, ароматичні антибіотики і фрагменти ДНК, необхідно враховувати не тільки гетероасоціацію ароматичних молекул, але і конкуренцію між антибіотиком і мутагеном за місця посадки на олігонуклеотидну послідовність.

Завантаження

##plugins.generic.usageStats.noStats##

Біографії авторів

О. Н. Веселков, Кафедра фізики Севастопільського національного технічного університету

Севастополь, 99053, Крим, Україна

А.О.Лантушенко, Кафедра фізики Севастопільського національного технічного університету

Севастополь, 99053, Крим, Україна

Сантьяго А. Єрнандес, Департамент фізики і математики, університет м. Пуебла

м. Пуебла. 72570, Мексика

Д.Б.Девіс , Департамент химії Беркбек коледжу Лондонського університету

Лондон WCIH OOP, Великобританія

Посилання

Gale E.F., Cundliffe E, Reynolds P.E., Richmond M.H., Waring M.J. // The molecular basis London. 1981.500p.

Graves D.E., Velea L.M. // Current Org. Chem. 2000. V.4. P. 915-929.

Davies D.B., Veselkov D.A., Kodintsev V.V., Evstigneev M.P., Veselkov A.N. // Mol. Physics. 1971.

Davies D.B., Veselkov D.A., Djimant L.N.,Veselkov A.N. // Eur. Biophys. .J. 2001. V.30. P.354-366

Adel A.L., Dorr R.T., Liddil J.D. //Cancer Invest. 1993. V.11. P. 15-24.

Larsen R.W., Jasuja R., Hetzler R., Muraoka P.T., Andrada V.G., Jameson D.M. // Biophys.1994

Graves D.E.,.Watkins C.L., Yielding L.W.//Biochemistry 1981. V.20. P. 1887-1892.

Laugaa P., Delbarre A.. Le Pecq J-B.. Roques B.P. // Eur.J.Biochem. 1983. V.134. P.163-173

Feigon .J., W.Leupin., W.A.Denny and D.R.Kearns. //Nucl. Acids Res. 1982. V.10. P.749-761

Davies D.B., Djimant L.N., Veselkov A.N. // J. Chem. Soc. Faraday Trans. 1996. V.92. P 383-390

Veselkov A.N.. Lantushenko A.O.. Veselkov D.A., Davies D.B. // J. Struct. Chem. 2002.

V 43

Bresloff J.L., Crothers D.M. // Biochemistry. 1981. V.20. P. 3547-3553.

Graves D.E., Yielding L.W., Watkins C.L., Yielding K..L. // Biochim. Biophys. Acta. 1977. V 479. P. 98-104.

Huang Y.M., Phillips D R // Biophys. Chem. 1977 , V.6. P. 363-368.

Chaires J.B., Dattagupta N., Crothers D.M. // Biochemistry. 1982. V.21. P. 3927-3932.

Davies D.B., Veselkov D A., Veselkov A.N. //Mol.Physics. 1999. V.97. P. 439-451.

Davies D.B., Eaton R.J., Baranovsky S.F., Veselkov A.N. // J. Biomol. Str. Dyn. 2000 V.17

P 887-901.

Davies D.B., Veselkov D.A., Veselkov A.N.// Eur. Biophys. J. 2002. V.31, P. 153-162.

Giessner-Prettre C., Pullman B. // Quart. Rev. Biophys. 1987. V.20. P. l13-172

Davies D.B., Karawajew L., Veselkov A.N. // Biopolymers. 1996. V.38. P. 745-757.

Veselkov A.N., Evstigneev M.P., Veselkov D.A., Djimant L.N., Davies D.B // Biophys. Bull. Kharkov Univ , V.525. № 1(8). P. 18-26.

Ross P.D., Subramanian S. // Biochemstry 1981. V.20 P.3096-3102.

Опубліковано
2002-06-05
Цитовано
Як цитувати
Веселков, О., Лантушенко, А., Єрнандес, С. А., & Девіс , Д. (2002). Вплив бокових груп фенантридінових барвників на гетероасоціацію з антибіотиком дауноміцином та конкурентне зв’язування лігандів з олігомером ДНК. Біофізичний вісник, 2(11), 5-13. вилучено із https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/18452
Розділ
Молекулярна біофізика