Конформаційна ізомерія пірамідинових нуклеозидов ізольованих в низькотемпературних інертних матрицях
Анотація
Комформаційні структури молекули 2-дезоксиуридину (dU) і тимідину (Т) були досліджені методом ИК-Фурье спектроскопії матричної ізоляції.В діапазоні 4000-200 см-1 отримані спектри нуклеозидів, ізольованих в низькотемпературних матрицях Аг. Методом HF/3-21G (p) проведені розрахунки коливальних спектрів, а методами HF/3-21G(p), HF/6-31G (d, p) і MP2/6-31G (d, p) проведені розрахунки щодо стабільності конформаційних ізомерів. Визначена реальна заселеність конформаційних ізомерів dU і T, зафіксованих в матричних образах. Показано, що суммарна заселеність основних анти-конформерів: а1, аО перевищує 70%. Рибозні кільця цих анти-конформерів знаходяться в конформації С2'-ендо, а рибозні кільця слабозаселених анти-конформерів: а2, аЗ мають конформацію СЗ'-ендо, стабілізовану внутрішньомолекулярними водородними зв'язками ОЗ'Н—05' і 05'Н—03' відповідно. Син-конформери 2-дезоксиуридину і тімідину s2 стабілізовані внутрішньомолекулярним водородним зв'язком 05'Н—02, а домінуючей конформацієй рибозного кольца є С2'-ендо.
Завантаження
Посилання
2. G.A. JefFrey. W. Saenger Hydrogen Bonding in Biological Structures / Springer- Verlag , Berlin, 1991, p. 563
3. S.N. Rao//'Nucleosides&Nucleotides, 1995, 14(6). p. 1179-1193
4. F. Seela, H. Debelak. H. Reuter, G. Kastner and I.A. Mikhailopulo //Tetrahedron 55. 1999. p. 1295-1308
5. N. Leulliot. M. Ghomi, G. Scalmani, G. Berthier. // J. Phys. Chem. A 1999, V. 103, p. 8716-8724.
6. N. Leulliot. M. Ghomi, H. Jobic. O. Bouloussa, V. Baumruk, C. Coulombeau // J.Phys.Chem. B 1999. 103, p. 10934-10944.
7. O.V. Shishkin, A. Pelmenschikov, D.M. Hovorun. J. Leszczynski //J. Mol.Struct. 526. 2000. p.329-341
8. Barnes A. J., // J.Mol. Struct. 113.(1984), p.161-174
9. S.A. Krasnokutski, A.Yu. Ivanov, V. Izvekov, G.G. Sheina and Yu.P. Blagoi // XXIV European Congress on Molecular Spectroscopy. Prague. Czech Repablic, 1998. p. 470.
10.S.A. Krasnokuski, A.Yu. Ivanov. V. Izvekov, G.G. Sheina, Yu.P. Blagoi //J. Mol.Struct. 482-483, (1998). p. 249-252.
11.A.Yu. Ivanov, A.M. Plokhotnichenko, E.D. Radchenko, G.G. Sheina, Yu.P. Blagoi, J.Mol. Struct. 372 (1995) p.91-100.
12.Yu. Ivanov, A.M. Plokhotnichenko, V. Izvekov. G.G. Sheina, Yu.P. Blagoi J. Mol.Struct. 408-409. 459 (1997).
13. M.W. Schmidt, K.K.Baldridge, J.A.Boats, S.T.Elbert, M.S.Gordon. J. H. Jensen. S. Koseki.,
N. Matsunaga, S.Su, T.L.Windus, M.Dupuis and J.A.Montgomeri. // J. of Computational Chemistry. Vol.14. No. l 1. (1993) p. 1347-1363
14.Alex A. Granovsky. http://classic.chem.msu.su/gran/gamess/index.html
15. Говорун Д.М., Міщук Я.Р., Кондратюк І.В., Желтовський М.В // Доповіді НАН України, 8. 1996. стор. 141-144
16. M.J. Nowak, L. Les and L. Adamowicz Trends in Physical Chemistry // 4, 1994, p. 137-168
17.M.J. Nowak, L. Lapinski, D.C. Bienko, D. Michalska // Spectrochimica acta A. 53. 1997, p. 855-865
18. Водородная связь. Под ред. Соколова Н.Д. / М., Наука, 1981, стр. 288
19. S.E. Barrows, F.J. Dulles, C.J. Cramer, A.D. French, D.G. Truhlar // Carb. Res. 276 (1995) p.219.
20.Kwiatkowski J.S., and Leszczynsky J. // Chem. Phys. Lett. 204.1993. p.430-434
21. M.J. Nowak , L.Lapinski, J. Fulara// Spectrochimica Acta, 45, A 2, (1989). p.229-242
22. Vranken H.., Smets J., Maes G., Lapinski L., Nowak M.J., and Adamovicz L. // Spectrochimica Acta, Vol 50A, N5, 1994. p. 875-889
23.Yamaguchi Y.. Frisch M., Gaw J., Schaefer III H.F., Binkley J.S. // J. Chem. Phys. 84 (4). 1986 p. 2262-2278
24. С. Глесстон. К. Лейдер. Г.Эйринг, Теория абсолютных скоростей реакций / М.: Издатинлит ,1948 - 321 с.
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
