Залежність фізичних властивостей нуклеотидів, що знаходяться у водному розчині, від їх положення в кодоні і ступеня детермінації

  • A. Yu. Berezhnoi Національний науковий центр "Харківський фізико-технічний інститут"
  • S. A. Duplii Харківський національний університет ім. В.Н. Каразіна
Ключові слова: дипольний момент, теплота утворювання, повна енергія, ДНК, кодон, ступінь детермінації, гідратація

Анотація

За допомогою комп'ютерного методу розрахунків параметрів молекул РМЗ розраховані такі властивості нуклеотидів як дипольний момент, теплота освіти і енергія найбільш стійкої їх конформації. При проведенні розрахунків передбачалося, що досліджуваний нуклеотид взаємодіє з шістьма найбільш близькими до нього молекулами води. Також брался до уваги вплив на досліджуваний нуклеотид сусідніх нуклеотидів при градієнті збіжності рівному 1. Отримані залежності вищеназваних властивостей від ступеня детермінації нуклеотиду і його положення в кодоні.

 

Завантаження

##plugins.generic.usageStats.noStats##

Біографії авторів

A. Yu. Berezhnoi, Національний науковий центр "Харківський фізико-технічний інститут"

вул. Академічна 1, Харків, 61108, Україна

S. A. Duplii, Харківський національний університет ім. В.Н. Каразіна

пл. Свободи, 4. Харків 61077, Україна

Посилання

Sjostorm M, Wold S. A multivariate study of the relationship between the genetic code and physical-chemical properties in amino acids. J. Mol. Evol. 1985;22:272.

Woese CR. Order in the genetic code. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1965;54:71-5.

Weinstein IB. Comparative studies of the genetic code. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1963;28:571-80.

Nirenberg M, Leder P, Bernfield M, Brimacombe R, Trupin J, Rottaman F, et al. RNA codewords and protein synthesis. VII. On the general nature of the RNA code. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1965;53:1161-8.

Goldberg AL, Wittes RE. Genetic code: aspects of organization. Science. 1966;153:420-4.

Volkenstein MV. The genetic coding of protein structure. Biochem. Biophys. Acta. 1966;119:421-4.

Crick FHC. The origin of the genetic code. J. molec. Biol. 1968;38:367-79.

Ycas M. The biological code. Amsterdam: North Holland; 1969.

Barricelli NA. On the origin and evolution of the genetic code. I-Wobbling and its potential significance. J. theor. Biol. 1977;67:85-109.

Ninio J. Molecular approaches to evolution. Princeton:Princeton University Press; 1983.

Bernandi G. The human genome: organization and evolutionary history. Annu. Rev. Genet. 1995;29:445-476.

Schneider B, Cohen DM, Schleifer L, Srinivasan AR, Olson WK, Berman HM. A systematic method for studying the spatial ddistribution of water molecules around nucleic acid bases. Biophys. J. 1993;59:2291-2303.

Опубліковано
2007-06-05
Цитовано
Як цитувати
Berezhnoi, A. Y., & Duplii, S. A. (2007). Залежність фізичних властивостей нуклеотидів, що знаходяться у водному розчині, від їх положення в кодоні і ступеня детермінації. Біофізичний вісник, 1(18), 29-47. вилучено із https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/12619
Розділ
Молекулярна біофізика