Визначення термодинамічних параметрів зв'язування іонів Мt 2+ з полинуклеотидами, що знаходяться в різних конформаціях, методом "фазових діаграм"
Анотація
Розраховано термодинамічні параметри зв'язування (константи асоціації - K, стехіометрії комплексів - n) трьох (polyU-polyA-polyU=A2U) -, двох (polyA-polyU=AU) - і однониткових (polyA, polyU) полинуклеотидов з іонами Ni 2+, а також ентальпії переходів ( Δ Н): A2U → AU+polyU (перехід 3 → 2) і AU → polyA+polyU (перехід 2 → 1) з використанням теорії "скріпок" і фазової діаграми комплексів A2U з цими іонами. За винятком взаємодії з AU, вплив іонів Ni 2+ на температури відповідних переходів в значній мірі визначається їх взаємодією з негативними зарядами на поверхні трьох- і одноланцюгових полінуклеотидів. Порівняння розрахункових даних з експериментальними виявило, що метод визначення K, n і ΔН, заснований на теоретичному аналізі фазових діаграм металокомплексів полинуклеотидов, є конкурентоспроможним прямому експериментальному визначенню цих параметрів.
Завантаження
Посилання
Дж. В. Мур, С. Рамамурти. Тяжёлые металлы в природных водах: контроль и оценка влияния, 1987,
Mосква, Мир, 288 с.
J. Durlach, M. Bara, A. Guiet-Bara. In: Metal Ions in Biological Systems; H. Sigel, A. Sigel, Eds.; Marcel
Dekker: New York 1990; vol.26, p.243.
M. A. Sirover, L. A. Loeb // Science., 1976, vol. 194, p. 1434-1436.
T. P. Coogan, D. M. Latta, R. J. Imbra, M. Costa // Biol. Trace Elem. Res., 1989, vol. 21, p.13-21.
H. Dally, A. Hartwig //Carcinogenesis, 1997, vol. 18, p.1021-1026.
A. Hartwig // Pure Appl. Chem., 2000, vol.72, p.1007-1014.
V. A. Sorokin, E. L. Usenko, V. A. Valeev // Int. Fed. Med. Biol. Engr. Proc., 2008, vol. 20, p.628-631.
K. Aoki, In: Nucleosides, nucleotides and metal ions // Metalloproteins: Chemical properties and biological
effects; S. Otsuka, T. Yamanaka, Eds; Elsevier: Amsterdam, Oxford, N.Y., Tokio,1988, p.457-490.
Ю. П. Благой, В. Л. Галкин, Г. О. Гладченко, С. В. Корнилова, В. А. Сорокин, А. Г. Шкорбатов
Металлокомплексы нуклеиновых кислот в растворах, 1991, Киев, Наукова Думка, 270 c.
H. Krakauer, J. M. Sturtevant // Biopolymers, 1968, vol. 6, p. 491 – 512.
G. E. Plum, D. S. Pilch, S. C. Singleton, K. J. Breslauer // Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 1995, vol.
, p. 319 – 350.
V. A. Sorokin, V. A. Valeev, G. O. Gladchenko, M. V. Degtyar, V. A. Karachevtsev, Yu. P. Blagoi //
Int.J.Biol.Macromol., 2003, vol. 31, p. 223-233.
Т. Е. Шуп. Решение инженерных задач на ЭВМ, 1982, Москва, Мир, 235 c.
R. M. Clement, J. Sturm, M. Daune // Biopolymers,1973, vol.12, p.405-421.
M. Daune // Studia biophys., 1970, vol. 24/25, p.287-297.
J. Reuben, E. J. Gabbay // Biochemistry, 1975, vol.14, p.1230-1235.
A. R. Mathieson, J. Y. Olayemi //Archiv. Biochem.Biophys.,1975, vol. 169, p.237-243.
В. А. Сорокин, В. А. Валеев, Е. Л. Усенко // Биополимеры и клетка, 2008, т. 24, c.158-170.
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
