Спектроскопічне дослідження зв’язування метилового ефіру феофорбіду-а з cинтетичними полінуклеотидами і ДНК
Анотація
Вивчено зв’язування метилового ефіру феофорбіду-а (Mepheo-a) з синтетичними двонитковими
полінуклеотидами poly(A)poly(U), poly(G)poly(C), чотирьохнитковими poly(G), і нативною ДНК.
Виміри проведено у водних буферних розчинах pH6,9 за умов низької іонної сили (2 мM Na+) у
широкому діапазоні співвідношень молярних концентрацій фосфатів і барвника (P/D) методами
абсорбційної та поляризованої флуоресцентної спектроскопії. Визначено абсорбційні і флуоресцентні характеристики комплексів біополімерів з барвником. Встановлено, що для комплексів нейтрального Mepheo-a з чотирьохнитковим poly(G) спостерігаються значні спектральні зміни: а саме, гіпохромізм поглинання, батохромний зсув смуги Соре у спектрі поглинання (~ 26 нм), батохромний зсув максимуму флуоресценції (~ 9 нм) і 50-кратне підвищення інтенсивності флуоресценції. На відміну від цього, зв’язування Mepheo-a з двонитковими полінуклеотидами poly(A)poly(U), poly(G)poly(C) і тимусною ДНК супроводжується більш слабким спектральним зсувом смуг поглинання і флуоресценції, а також зростанням інтенсивності флуоресценції не більш ніж у 4 рази. Такі спектральні зміни і високе
значення ступеня поляризації флуоресценції (0,26) свідчать про інтеркаляцію хромофора барвника
у чотирьохниткову полінуклеотидну структуру. Незначне збільшення ступеня поляризації
флуоресценції барвника (0,12) і більш слабкі спектральні зсуви свідчать про інший тип комплексоутворення, а саме про вбудовування MePheo-а в борозенку подвійної спіралі, припустимо у вигляді димерів. Значна зміна флуоресцентних характеристик MeРheo-a при зв’язуванні з чотирьохнитковим полінуклеотидом poly(G) робить це похідне перспективним для використання в якості флуоресцентного зонда G-квадруплексної структури.
Завантаження
Посилання
Owens J.W., Smith R., Robinson R. and Robins M. // Inorg. Chim. Acta.– 1998.– v. 279.– p. 226–231.
Dougherty T.Jr., Gomer C.J., Henderson B.W., et al. // J. Natl. Cancer Inst.– 1998.– v. 90.– p. 889– 905.
Ricchelli F. // J. Photochem. Photobiol. B: Biol. – 1995.– v. 29.– p. 109–111.
Willstatter R. and Stoll A. Untersuchungen über Chlorophyll. Methoden und Ergebnisse. – Berlin: Springer, 1913.
Röder B. // J. Photochem. Photobiol. B: Biol. – 1990. – v.5. – p. 519-521.
Röder B. // Lasers Med. Sci.– 1990.– v.5.– p.99-106.
Roeder B. Pheophorbides. – Photodynamic Tumor Therapy: 2nd and 3rd Generation Photosensitizers. (J.G. Moser, Ed.) .– Amsterdam: Harwood Academic Publishers. – 1998.– p. 35-42.
Hajri A., Wack S. et al. // Photochem. Photobiol.– 2002.– v.75.– p.140-148.
MacDonald I.J. and Dougherty T.Jr. // J. Porphyrins Phthalocyanines.– 2001.- v. 5.– p.105-129.
Krasnovsky A. Jr. et al. // J. Photochem Photobiol. B: Biol.– 1990.– v.5.– p. 245-254.
Roeder B. Photobiophysical parameters. – Photodynamic Tumor Therapy: 2nd and 3rd Generation Photosensitizers. (J.G. Moser, Ed.). – Amsterdam: Harwood Academic Publishers. – 1998.– p. 9-19.
Tanielian C., Kobayashi M., Wolf C. // J. Biomed. Opt. – 2001. – v. 6. – p. 252-256.
Eichwurzel I., Stiel H., Roeder B. // J. Photochem. Photobiol. B.: Biol. – 2000.– v.54.– p.194-200.
Kobayashi M., Koyama S., Nakazato M., Miyoshi N., Wolf C., Daikuzono N., Tanielian C., Sasaki M., Komiyama M. // J. Clin. Laser. Med. Surg.– 1994.–v.12. – p. 133-138.
Ryazanova O.A., Voloshin I.M., Dubey I.Ya., Dubey L.V., Zozulya V.N. // Annals of the New York Academy of Sciences.– 2008.– v.1130.– p. 293-299.
Ryazanova O.A., Voloshin I.M., Dubey I.Ya., Dubey L.V. and Zozulya V.N. // IFMBE Proceedings.– 2008.- v.20.- p. 397-400.
Wongsinkongman P., Brossi A., Wang H.-K., Bastow K.F., Lee K.-H. // Bioorganic & Medicinal Chemistry.– 2002.– v.10.– p.583-591.
Zozulya V., Blagoi Yu., Lober G., Voloshin I. et al. // Biophys. Chem. –1997-v.65, p. 55-63.
Lakowicz, J.R. 1999. Principles of Fluorescent Spectroscopy 2nd ed. Kluwer Academic/Plenum Press. New York.
Spikes, J.D. & Bommer, J.C. 1991. Chlorophyll and related pigments as photosensitizers in biology and medicine. In Chlorophylls. H. Scheer, Ed.: 1181-1204. CRC Press, Boca Raton, Florida, USA.
Rabinowitch E. // Rewiew of modern physics.–1944.– v. 16(3-4).– p. 226-235.
Röder, B. // J. Photochem. Photobiol, B: Biol.– 1987.– v.1.– p.103-113.
Mansouri S., Fery-Forgues S., Meunier B., Paillous N. // J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2 .– 1996.– v.8.– p. 1649-1654.
Mergny J., Phan A., Lacroix L. // FEBS Letters.– 1998.– v.435.- p.74-78.
Löber G., Kittler L. // Studia biophysica.–1978.– v.73(1).– p.25-30.
Seidel C., Schulz A., and Sauer M. // J. Phys. Chem.- 1996.- v.100.– p.5541-555.
Taima H., Yoshioka N., Inoue H. // Org. Biomol. Chem. – 2009.–v. 7.– p. 1176-1183.
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
