EFFECT OF Mg^2+ ON DOUBLE AND TRIPLE HELLX FORMATIONS BETWEEN POLY(dA) AND POLY(dT)

  • V. N. Zozulya Institute for Low Temperature Physics and Engineering, Ukrainian Academy of Sciences, Kharkov, 310164, Lenin Ave. 47, Ukraine
  • A. S. Shcherbakova Institute for Low Temperature Physics and Engineering, Ukrainian Academy of Sciences, Kharkov, 310164, Lenin Ave. 47, Ukraine
  • Yu. P. Blagoi Institute for Low Temperature Physics and Engineering, Ukrainian Academy of Sciences, Kharkov, 310164, Lenin Ave. 47, Ukraine

Анотація

The Mg2+ ion effect on conformational transitions in double- and triple-helical structures formed by poly(dA) with poly(dT) has been studied in 10 mM cacodylate buffer, pH 7, containing 0.1 M Na+. The investigations were carried out by the method of thermal denaturation using UV absorbance and Rayleigh light scattering detections of melting transitions. Temperatures of helix-to-coil transition of poIy(dA)-poly(dT) and triplex-to-duplex of poly(dA)-2poly(dT) increase linearly with log[Mg2+] and more quickly in the last case that results in superposition of these transitions at [Mg2+]>15 mM. At [Mg2+] > 20 mM during the melting of the both structures aggregation was observed, which arised, according to Bloomfield and co-workers, due to formation of cross-links by Mg2+ ions bridges between partially unplaited polymer strands and disappeared after the end of melting. It is established that at the presence of 0.1 M NaCl magnesium ions do not induce the partial formation of the triplex structure in poly(dA)poly(dT) (disproportionation) as is postulated by other authors in some papers.

KEY WORDS: polynucleotides, double and triple helices, magnesium ions, helix-to-coil transitions, Rayleigh scattering

 

Завантаження

##plugins.generic.usageStats.noStats##

Посилання

1. Duguid J.G., Bloomfield V.A., Benevids J.M. and Thomas G.J.Jr. //Biophys. J. 1995. V.69. P.2623-2640.


2. Hopkins H.P., Hamilton D.D., Wilson W.D. // J. Chem. Thermodynamics. 1993. V.25. P.111-126.


3. Sehlstedt U., Aich P., Bergman J., Vallberg H., Norden B. and Graslund A. // J. Mol. Biol. 1998. V.278. P.31-56.


4. Duguid J.G. and Bloomfleld V.A. // Biophys. J. 1995. V.69. P.2642-2648.


5. Shibata J.H. and Schurr J.M. // Biopolymers. 1981. V.20. P.525-549.


6. Crothers D.M. //Biopolymers. 1971. V.10. P.2147.


7. Anshelevich V.V., Vologodskii A.V., Lukashin A.V. and Frank-Kamenetskii M.D. // Biopolymers. 1984. V.23. P.39-58.

8. Pilch D., Brouseau R. and Shafer R.H. // NAR. 1990. V.18. P.5743-50.
Цитовано
Як цитувати
Zozulya, V. N., Shcherbakova, A. S., & Blagoi, Y. P. (1). EFFECT OF Mg^2+ ON DOUBLE AND TRIPLE HELLX FORMATIONS BETWEEN POLY(dA) AND POLY(dT). Біофізичний вісник, 3(5). вилучено із https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/2452
Номер
Том 3 № 5 (1999): Біофізичний вісник
Розділ
Молекулярна біофізика

Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:

  1. Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
  2. Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
  3. Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).