ВЛИЯНИЕ МОЧЕВИНЫ НА ПЕРЕХОД ДНК В КОМПАКТНОЕ СОСТОЯНИЕ ПРИ СВЯЗЫВАНИИ С ИОНАМИ Сu2+

  • Е. V. Hackl Institute for Low Temperature Physics and Engineering, National Academy of Sciences of Ukraine
  • S. V. Kornilova Institute for Low Temperature Physics and Engineering, National Academy of Sciences of Ukraine
  • Yu. P. Blagoi Institute for Low Temperature Physics and Engineering, National Academy of Sciences of Ukraine

Анотація

В работе методом ИК-спектроскопии изучено взаимодействие ионов Сu2+ с ДНК в водных растворах, содержащих добавки мочевины (0.17 * 5 М). Во всех исследованных растворах под влиянием ионов Сu2+ происходил переход ДНК в компактное состояние, причем, как и в водном растворе, этот переход носил кооперативный характер. Показано, что добавление мочевины к водному раствору ДНК понижает концентрацию ионов Сu2+, необходимую для индуцирования компактизации ДНК, что связано с усилением экранирующего действия противоионов за счет их дегидратации в присутствии мочевины. Вероятно, процесс перехода ДНК в компактное состояние под действием ионов меди определяется не только эффектами диэлектрической проницаемости раствора на связывание ионов Сu2+ с биополимером, но и эффектами сольватации, причем при небольших изменениях е эффекты сольватации могут преобладать.

Добавление мочевины к раствору ДНК также понижает кооперативность процесса компактизации под действием ионов Сu2+. Возможно, кооперативность перехода ДНК в компактное состояние хотя бы частично опосредована кооперативностью изменений структуры воды.

При увеличении концентрации ионов натрия в растворе переход ДНК в компактное состояние становится гораздо менее кооперативным и требует значительно большей концентрации ионов Сu2+, что может объясняться конкуренцией ионов Na+ и Сu2+ за места связывания на ДНК. Связывание ионов Сu2+ с ДНК определяет переход ДНК в компактное состояние даже в растворах с измененной структурой воды.

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: ДНК, ИК-спектроскопия, ионы меди, мочевина, конденсация ДНК.

Завантаження

##plugins.generic.usageStats.noStats##

Біографії авторів

Е. V. Hackl, Institute for Low Temperature Physics and Engineering, National Academy of Sciences of Ukraine

47 Lenin Ave., Kharkov 310164, Ukraine

S. V. Kornilova, Institute for Low Temperature Physics and Engineering, National Academy of Sciences of Ukraine

 47 Lenin Ave., Kharkov 310164

Yu. P. Blagoi, Institute for Low Temperature Physics and Engineering, National Academy of Sciences of Ukraine

 47 Lenin Ave., Kharkov 310164, Ukraine

Посилання

1. Хакл Е. В., Корнилова C.B., Благой Ю.П. // Біофізичний вісник. 1998. № 1. Ст. 62-70

2. Hackl Е., Kornilova S., Blagoi Yu. // Metal ions in biology and medicine. 1998. V. 5. P. 74-79

3. Hackl E., Kornilova S., Kapinos L.et.al. //J. Mol. Struct. 1997. V. 408/409. P.229-232

4. Хакл E.B., Корнилова С.В., Благой Ю.П. // Вестник проблем биологии и медицины 1998. N 8. С. 41-51

5. Структура и стабильность биологических макромолекул. - М.:Мир, 1973.- 220с.

6. Веселков А.Н. Влияние внешних факторов на конформацию молекулы нуклеиновой кислоты в растворе. Дис... д-р физ.-мат. наук, Севастополь. 1988. 463 с.

7. Schleich Т., Genzier R„ von Hippel P. // J. Amer. Soc. 1968. V. 90. P. 5954-5960

8. Самойлов О.Я. Структура водных растворов электролитов и гидратация ионов. М.: АН СССР, 1957.- 189 с.

9. Olins D., Bryan P.. Harrington R., et.al. //Nucleic Acids Res. 1977. V. 4(6). P. 1911-1931

10. Chan H.K., Au-Yeung K.L., Gonda I. // Pharm. Res. 1996. V. 13(5). P. 756-761

11. Бабаян Ю.С. // Молек. биол. 1988. T. 22. вып. 5. c.1204-1209

12. Klump H., Burkart W. // Biochim Biophys Acta. 1977. 475(4). P. 601-604

13. Бабаян Ю.С. Влияние мочевины на конформацию молекулы ДНК. Дис.канд. ф.-м. наук, Ереван,1980,120с.

14. Асланян В.М., Бабаян Ю.С, Арутюнян С.Г. // Биофизика. 1984. Т. 29. вып. 3. С. 372-376

15. Ling G.N.. Ochsenfeld М.М. // Physiol. Chem. Phys. Med. NMR. 1989. V. 21(1). P. 19-44

16. Rose С., Mandal A.B. // Int. J. Biol.Macromol. 1996. 18(1-2). P. 41-53

17. From N.B., Bowler B.E. // Biochemistry. 1998. 37(6). P. 1623-1631

18. Dotsch V., Wider G, Siegal G, Wuthrich K. // FEBS Lett. 1995. V. 372 (2-3). P. 288-290

19. Zama M., Olins D.E., Wilkinson-Singley E., Olins A.L. // Biochem Biophys Res Comm. 1978. 85(4). P. 1446-1452

20. Tirado-Rives J., Orozco M., Jorgensen W.L. // Biochemistry. 1997. 36(24). P. 7313-7329

21. Dotsch V., Wider G, Siegal G., Wuthrich K. // FEBS Lett. 1995. V. 366 (1). P. 6-10

22. Schellman J.A., Gassner N.C. // Biophys. Chem. 1996. 59(3). P. 259-275

23. Слоницкий С.В., Лаевский B.B., Фрисман Э.В. // Мол. биол. 1980. Т.14. вып. 4. С. 743-752

24. Ю.П. Благой, В.Л.Галкин. Г.О.Гладченко и др. Металлокомплексы нуклеиновых кислот в растворах. Киев: Наукова думка. 1991.- 272 с.

25. Кальвин H.H., Вельяминов С.Ю. // ЖПС. 1987. N 4. С.592-597

26. Бабушкин A.A., Бажулин П.А., Королев Ф.В. и др. Методы спектрального анализа. М., МГУ. 1962. 273 с.

27. Manning G. // Q Rev Biophys. 1978, V. 11(2). P. 179-246

28. Varani G, Della Torre L., Baldini G. // Biophys Chem. 1987. 28(3). P.175-181

29. Смольянинова Т.И., Брусков В.И., Кашпарова Е.В. // Мол. биол. 1985. Т. 19. вып. 4. С. 992-1000

30. Helene С., Lancelot G. // Prog. Biophys. Mol. Biol. 1982. V. 39(1). P. 1-68

31. Sorokin V.A., Blagoi Yu.P., Valeev V.A. et.al. // J. Inorg. Biochem. 1987. 30. N. 2. P. 87-101.

32. Braunlin W.H., Anderson C.F., Record M.T. Jr. // Biochemistry. 1987. V. 1. 26(24). P. 7724-7731.
Цитовано
Як цитувати
HacklЕ. V., Kornilova, S. V., & Blagoi, Y. P. (1). ВЛИЯНИЕ МОЧЕВИНЫ НА ПЕРЕХОД ДНК В КОМПАКТНОЕ СОСТОЯНИЕ ПРИ СВЯЗЫВАНИИ С ИОНАМИ Сu2+. Біофізичний вісник, 2(2). вилучено із https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/2448
Розділ
Молекулярна біофізика