Розрахунок відносної діелектричної проникності Родаміну 6G квантово-механічним методом

  • Юлія Рябенко Факультет радіофізики, біомедичної електроніки та комп'ютерних систем, Харківський національний університет імені В. Н. Каразіна, майдан Свободи, 4, м. Харків, 61022 Україна; Інститут фізичної хімії, Центр фотоніки Аббе, Йєнський університет ім. Фрідріха Шіллера, Альберт-Ейнштейн-Штрассе 9, 07745 Німеччина https://orcid.org/0000-0001-8682-8009
  • Сергій Шульга Факультет радіофізики, біомедичної електроніки та комп'ютерних систем, Харківський національний університет імені В. Н. Каразіна, майдан Свободи, 4, м. Харків, 61022 Україна https://orcid.org/0000-0002-9392-9366
  • Костянтин Білошенко Факультет радіофізики, біомедичної електроніки та комп'ютерних систем, Харківський національний університет імені В. Н. Каразіна, майдан Свободи, 4, м. Харків, 61022 Україна https://orcid.org/0000-0002-9387-3147
Ключові слова: метод DFT, Золоте правило Фермі, дельта-функція Дірака, люмінесценція, Родамін 6G, хвильова функція

Анотація

Актуальність. У статті описано квантово-механічной метод розрахунку діелектричної проникності органічних молекул на прикладі добре вивченої молекули Родаміну 6G. Вивчення оптичних властивостей великих органічних молекул вимагає не тільки експериментальних даних, а й використання розрахунків, отриманих як аналітичним, так і чисельним шляхом.

Мета. Методи розрахунку діелектричної проникності як феноменологічної характеристики зразка повинні бути перевірені на добре вивчених молекулах, щоб надалі застосовуватися до більш складних нелінійних структур. Однак інтегральні зміни хвильових функцій великих молекул необхідно апроксимувати.

Матеріал і методи. Чисельне моделювання в MATLAB було проведено для порівняння з даними Gaussian 09, які є точними для таких не великих молекул, як Rhodamine 6G. У MATLAB було розраховано значення діелектричної проникності для частотних областей, що відповідають поглинанню та флуоресценції, на основі золотого правила Фермі. Отже, будь-яку молекулу можна представити як складну квантовомеханічну систему. У Gaussian 09 був використаний метод DFT для визначення діелектричної проникності.

Результати. Золоте правило Фермі можна застосувати завдяки представленню молекули як складної квантовомеханічної системи. Запропоновані чисельні методи мінімізують похибку за допомогою дельта-функції Дірака. Згідно з нашою гіпотезою, сума хвильових функцій частинки в потенційній ямі та частинки в кільці дорівнює хвильовій функції всієї системи, що дає можливість досліджувати великі молекули. В результаті розрахунку для двох  довжин хвиль 337 та 573 нм, результати діелектричної проникності обчислені за допомогою запропонованого метода в МАТЛАБ дорівнювали 2,98 та 6,27, відповідно. Ці самі параметри обчислені за допомогою Gaussian 09 дорівнювали 2,85 та 6,23.

Висновок. Порівняння результатів показує високий ступінь відповідності між наборами даних. Отже, гіпотеза та вибір методу були вірними. Посилення люмінесценції можна досягти зміною часу релаксації збудженого стану. Плазмонні наноструктури із заздалегідь визначеними властивостями можуть керовано посилювати результуюче поле на квадрат модуля суперпозиції їх ближнього поля. Отже, умови для висококогерентного випромінювання з високою інтенсивністю та поляризацією можна передбачити та розрахувати до експериментів.

Завантаження

##plugins.generic.usageStats.noStats##

Посилання

Sabnis RW. Handbook of fluorescent dyes and probes: Sabnis/handbook of fluorescent dyes and probes. 1st ed. Nashville, TN: John Wiley & Sons; 2015.

Christie RM. Fluorescent dyes. Handbook of textile and industrial dyeing. 562–87; 2011.

Sauer M, Hofkens J, Enderlein J. Handbook of fluorescence spectroscopy and imaging: from ensemble to single molecules. John Wiley & Sons; 2010.

Zehentbauer FM, Moretto C, Stephen R, Thevar T, Gilchrist JR, Pokrajac D, et al. Fluorescence spectroscopy of Rhodamine 6G: concentration and solvent effects. Spectrochim Acta A Mol Biomol Spectrosc. 2014;121:147–51. http://doi.org/10.1016/j.saa.2013.10.062

Magde D, Wong R, Seybold PG. Fluorescence quantum yields and their relation to lifetimes of rhodamine 6G and fluorescein in nine solvents: improved absolute standards for quantum yields. Photochem Photobiol. 2002;75(4):327–34. http://doi.org/10.1562/0031-8655(2002)0750327fqyatr2.0.co2

Gavrilenko VI, Noginov MA. Ab initio study of optical properties of rhodamine 6G molecular dimers. J Chem Phys. 2006;124(4):044301. http://doi.org/10.1063/1.2158987

Chapman M, Euler WB. Rhodamine 6G structural changes in water/ethanol mixed solvent. J Fluores. 2018;28(6):1431–7. http://doi.org/10.1007/s10895-018-2318-0

On C, Tanyi EK, Harrison E, Noginov MA. Effect of molecular concentration on spectroscopic properties of poly(methyl methacrylate) thin films doped with rhodamine 6G dye. Opt Mater Express. 2017;7(12):4286. http://doi.org/10.1364/ome.7.004286

Novoa-Ortega E, Dubnicka M, Euler WB. Structure-Property Relationships on the Optical Properties of Rhodamine Thin Films. J Phys Chem C. 2020;124(29):16058–68. http://doi.org/10.1021/acs.jpcc.0c05139

Mullen M, Euler WB. The influence of interfacial effects on the photophysics of rhodamine 6G thin films on a poly(vinylidene fluoride) surface. Langmuir. 2017;33(9):2194–204. http://doi.org/10.1021/acs.langmuir.7b00144

Liu W-L, Bassett WP, Christensen JM, Dlott DD. Emission lifetimes of a fluorescent dye under shock compression. J Phys Chem A. 2015;119(44):10910–6. http://doi.org/10.1021/acs.jpca.5b09695

Popov P, Steinkerchner L, Mann EK. Molecular dynamics study of rhodamine 6G diffusion at n-decane–water interfaces. Physical Review E. 2015;91(5):053308. https://doi.org/10.1103/PhysRevE.91.053308

Brown KE, Fu Y, Shaw WL, Dlott DD. Time-resolved emission of dye probes in a shock-compressed polymer. J Appl Phys. 2012;112(10):103508. http://doi.org/10.1063/1.4765687

Curtis AD, Banishev AA, Shaw WL, Dlott DD. Laser-driven flyer plates for shock compression science: launch and target impact probed by photon Doppler velocimetry. Rev Sci Instrum. 2014;85(4):043908. http://doi.org/10.1063/1.4871361

Watanabe H. Hayazawa N, Inouye Y, Kawata S, DFT vibrational calculations of rhodamine 6G adsorbed on silver: analysis of tip-enhanced Raman spectroscopy. The Journal of Physical Chemistry B. 2005;109(11):5012–5020. https://doi.org/10.1021/jp045771u

Zhou P. Why the lowest electronic excitations of rhodamines are overestimated by time‐dependent density functional theory. International Journal of Quantum Chemistry. 2018; 118(23): e25780. https://doi.org/10.1002/qua.25780

Lower SK, El-Sayed MA. The triplet state and molecular electronic processes in organic molecules. Chemical Reviews 1966; 66(2): 199-241. https://doi.org/10.1021/cr60240a004

Pastore M, Fantacci S, De Angelis F. Modeling excited states and alignment of energy levels in dye-sensitized solar cells: successes, failures, and challenges. The Journal of Physical Chemistry C. 2013;117(8):3685-3700. https://doi.org/10.1021/jp3095227

Slanina T, Oberschmid T. Rhodamine 6g radical: A spectro (fluoro) electrochemical and transient spectroscopic study. ChemCatChem. 2018;10(18):4182–4190. https://doi.org/10.1002/cctc.201800971

Venkateswarlu P, George MC, Rao YV, Jagannath H, Chakrapani G, Miahnahri A. Transient excited singlet state absorption in Rhodamine 6G. Pramana. 1987;28:59–71. https://doi.org/10.1007/BF02846809

Jian W, Beloshenko KS, Makarovskiy M, Riabenko I, Shulga S, Prokhorenko S Resonance light absorption of granular aluminium and silver films placed on a rough sublayer of multilayered ZnS. Ukrainian journal of physical optics. 2019;(20):10–15. https://doi.org/10.3116/16091833/20/1/10/2019

Zheng Y, Beloshenko KS, Makarovskiy M, Guliyova Y, Shulga S, Wojnarowska R, et al. Study of plasma frequency for Al-In alloys with different concentrations. Ukrainian journal of physical optics. 2017;(18):225–231. https://doi.org/10.3116/16091833/18/4/225/2017

Fabian J, Hartmann H. Light absorption of organic colorants: theoretical treatment and empirical rules. Berlin‐Heidelberg‐New York: Springer‐Verlag. 1980. https://doi.org/10.1002/prac.19823240223

Berger R. Computational chemistry. Introduction to the theory and applications of molecular and quantum mechanics. By Errol G. lewars. Angew Chem Int Ed Engl. 2004;43(38):4979–80. http://doi.org/10.1002/anie.200485057

Nagakura, S., & Baba, H. Dipole moments and near ultraviolet absorption of some monosubstituted benzenes—The effect of solvents and hydrogen bonding. Journal of the American Chemical Society. 1952;74(22):5693-5698. https://doi.org/10.1021/ja01142a040

Afsar MN, Birch JR, Clarke RN, Chantry GW. The measurement of the properties of materials. Proceedings of the IEEE, 1986;74(1):183-199. https://doi.org/10.1109/PROC.1986.13432

Landau LD, Lifshitz EM, Pitaevskii LP. Electrodynamics of continuous media. 2nd ed. Oxford, England: Butterworth-Heinemann; 1984.

Engerholm GG, Luntz AC, Gwinn WD, Harris DO. Ring Puckering in Five‐Membered Rings. II. The Microwave Spectrum, Dipole Moment, and Barrier to Pseudorotation in Tetrahydrofuran. The Journal of Chemical Physics. 1969;50(6):2446-2457. https://doi.org/10.1063/1.1671401

Braak D, Mannhart J. Fermi’s golden rule and the second law of thermodynamics. Foundations of Physics, 2020;50(11): 1509-1540. https://doi.org/10.1007/s10701-020-00380-2

Adler SL. Quantum theory of the dielectric constant in real solids. Physical Review. 1962;126(2):413. https://doi.org/10.1103/PhysRev.126.413

Norambuena A, Tancara D, Coto R. Coding closed and open quantum systems in MATLAB: applications in quantum optics and condensed matter. European Journal of Physics, 2020 ;41(4): 045404. https://doi.org/10.1088/1361-6404/ab8360

Frisch MJ, Trucks GW, Schlegel HB, Scuseria GE, Robb MA, Cheeseman JR, et al. Gaussian 09, Revision D. 01, Gaussian, Inc., Wallingford CT [Internet]. [cited 2009] Available from: http://www.gaussian.com

Hoffmann, Roald. How chemistry and physics meet in the solid state. Angewandte Chemie International Edition in English 1987; 26(9): 846-878. https://doi.org/10.1002/anie.198708461

Shimomura O, Yampolsky I. Bioluminescence: Chemical principles and methods (third edition): Chemical Principles and Methods. Shimomura O, Yampolsky IV, editors, Singapore: World Scientific Publishing; 2019.

Kubo R, Toyozawa Y. Application of the method of generating function to radiative and non-radiative transitions of a trapped electron in a crystal. Progress of Theoretical Physics. 1955;13(2):160-182. https://doi.org/10.1143/PTP.13.160

Demtröder W. Laser spectroscopy: Vol. 2: Experimental techniques. 4th ed. Berlin, Germany: Springer; 2008.

Ageev LA, Miloslavsky VK, Elshhab HI, Blokha VB. Educational experiments and demonstrations in optics. Kharkiv: KhNU; 2000. 176–178 p. (In Russian).

Ejuh, GW, Abe MO, Nya FT, Ndjaka JMB. Prediction of electronic structure, dielectric and thermodynamical properties of flurbiprofen by density functional theory calculation. Karbala International Journal of Modern Science. 2018;4(1):12-20. https://doi.org/10.1016/j.kijoms.2017.10.001

Tang Z, Chang C, Bao F, Tian L, Liu H, Wang M, Zhu C, Xu J. Feasibility of Predicting Static Dielectric Constants of Polymer Materials: A Density Functional Theory Method. Polymers. 2021;13(2):284. https://doi.org/10.3390/polym13020284

Kreibig U, Vollmer M. Optical properties of metal clusters. 1995th ed. Berlin, Germany: Springer; 2013.

RCWA Solver Introduction – Ansys Optics [Internet]. [cited 2019, updated 2023] Available from: https://optics.ansys.com/hc/en-us/articles/4414575008787-RCWA-Solver-Introduction

Kitazawa T, Kitahara R, Yamagiwa T, Chakarothai J, Y. Hayashi and T. Kasuga. Basic Study on a Novel FDTD Method Implemented Frequecy Dispersion of PCB. 2021 IEEE International Joint EMC/SI/PI and EMC Europe Symposium, Raleigh. North Carolina, USA; 2021. p.580. https://doi.org/10.1109/EMC/SI/PI/EMCEurope52599.2021.9559370

Muller JM, Brunie N, Dinechin F, Jeannerod CP, Joldes M, Lefèvre V, et al. Handbook of floating-point arithmetic. Basel, Switzerland. Birkhäuser; 2018

Lax PD. Gibbs Phenomena. J Sci Comput 2006;28:445–449. https://doi.org/10.1007/s10915-006-9075-y

Опубліковано
2023-12-19
Цитовано
Як цитувати
Рябенко, Ю., Шульга, С., & Білошенко, К. (2023). Розрахунок відносної діелектричної проникності Родаміну 6G квантово-механічним методом. Біофізичний вісник, (50), 7-16. https://doi.org/10.26565/2075-3810-2023-50-01
Розділ
Молекулярна біофізика