ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ И ТЕОРЕТИЧЕСКОЕ ИЗУЧЕНИЕ МЕЖМОЛЕКУЛЯРНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ В УЗНАЮЩЕМ КОМПЛЕКСЕ МЕТИЛУРАЦИЛА С АКРИЛАМИДОМ
Ключові слова:
масс-спектрометрия, ab initio расчеты
Анотація
Определены структурные и энергетические параметры межмолекулярных взаимодействий в модельном узнающем комплексе нуклеинового основания 1-метилурацил с боковыми радикалами аминокислот аспарагина и глутамина. Величина энтальпии образования комплекса АН, измеренная посредством метода температурно-зависимой ионизационно-полевой масс спектрометрии, составляет (- 40,6±4,2) кДж/моль и находится в хорошем согласии со значениями энергии взаимодействия в двух наиболее выгодных конфигурациях димеров, рассчитанных методами МР2 и DFT.
Завантаження
##plugins.generic.usageStats.noStats##
Посилання
1. Methods in Enzymology. Protein-DNA interactions. San Diego. Academic Press. 1998. V 208. p. 528.
2. G.G.Kneale. Methods in Molecular Biology. DNA-protein interaction. Ed.Totowa, NJ. The Humana Press. 1994. 148 p.
3. Saenger W., Jeffrey J. Hydrogen bonding in biological structures. Berlin. Springer. 1991.347p.
4. Веркин Б. И., Янсон И. К., Суходуб Л. Ф., Теплицкий А.Б. Взаимодействия биомолекул. Новые экспериментальные подходы и методы. Киев. Наукова Думка. 1985. 164 с.
5. Теплицкий А.Б., Галетич И.К., Суходуб Л.Ф. // Молекулярная биология. 1990.Т.35, N 5. с. 709- 710.
6: Poltev V.I., Shulyupina N.V., Bruskov V.I. et al. // Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 1991. V. 9, N1. P. 101-111.
7. Галетич И.К., Шелковский B.C., Косевич M.B., Благой Ю.П. // Сборник «Проблемы биологии и медицины». Харьков-Полтава. 1998. с. 75-88.
8. Sukhodub L.F. // Chem. Rev. 1987. V. 87, N3. P. 589-606.
9. Щелковский B.C. // Дис. Канд. физ. - мат.наук. 1985. Харьков. 172 с.
10. Король Э.Н., Лобанов В.В., Назаренко В.А., Покровский В.А. Физические основы полевой масс-спектрометрии. Киев. Наукова Думка. 1978. 195с.
11. Sukhodub L.F., Shelkovsky V.S., Wierzchowski K.L. //Biophys Chem.1984.V.19. P.191-200
12. Binkley J.S., Pople J.A. // Int. J. Quantum Chem. 1975. V.9. P.229.
13. Pople J.A., Binkley J.S., Seeger R. // Int. J. Quantum Chem. Quantum Chem. Symp. 1976. V.10, P.1
14. Becke A.D. // Phys. Rev. В 1988. V 38. P.3098.
15. Lee С, Yang W., Parr R.G. // Phys. Rev. В 1988. V.37. P.785.
16. Vosko S.H., Wilk L., Nusair M. // Can. J. Phys. 1980. V.58. P.553.
17. Frish M.J., Trucks G.W., Schlegel H.B. et. al. Gaussian 94, Revision E.2; Gaussian Inc. Pittsburgh. PA. 1994.
18. Смолянинова Т. И., Брусков В.И., Кашпарова E. B. // Молекулярная биология. 1985. Т. 19. N 4. с. 992-1000.
19. Helene С., Lancelot G. // Prog. Biophys. Molec. Biol. 1982. 39. P.1- 68.
20. Anderson J.E., Ptashne M., Harrison S.C.// Nature.- 1987.- V.326.- P. 846-852.
2. G.G.Kneale. Methods in Molecular Biology. DNA-protein interaction. Ed.Totowa, NJ. The Humana Press. 1994. 148 p.
3. Saenger W., Jeffrey J. Hydrogen bonding in biological structures. Berlin. Springer. 1991.347p.
4. Веркин Б. И., Янсон И. К., Суходуб Л. Ф., Теплицкий А.Б. Взаимодействия биомолекул. Новые экспериментальные подходы и методы. Киев. Наукова Думка. 1985. 164 с.
5. Теплицкий А.Б., Галетич И.К., Суходуб Л.Ф. // Молекулярная биология. 1990.Т.35, N 5. с. 709- 710.
6: Poltev V.I., Shulyupina N.V., Bruskov V.I. et al. // Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 1991. V. 9, N1. P. 101-111.
7. Галетич И.К., Шелковский B.C., Косевич M.B., Благой Ю.П. // Сборник «Проблемы биологии и медицины». Харьков-Полтава. 1998. с. 75-88.
8. Sukhodub L.F. // Chem. Rev. 1987. V. 87, N3. P. 589-606.
9. Щелковский B.C. // Дис. Канд. физ. - мат.наук. 1985. Харьков. 172 с.
10. Король Э.Н., Лобанов В.В., Назаренко В.А., Покровский В.А. Физические основы полевой масс-спектрометрии. Киев. Наукова Думка. 1978. 195с.
11. Sukhodub L.F., Shelkovsky V.S., Wierzchowski K.L. //Biophys Chem.1984.V.19. P.191-200
12. Binkley J.S., Pople J.A. // Int. J. Quantum Chem. 1975. V.9. P.229.
13. Pople J.A., Binkley J.S., Seeger R. // Int. J. Quantum Chem. Quantum Chem. Symp. 1976. V.10, P.1
14. Becke A.D. // Phys. Rev. В 1988. V 38. P.3098.
15. Lee С, Yang W., Parr R.G. // Phys. Rev. В 1988. V.37. P.785.
16. Vosko S.H., Wilk L., Nusair M. // Can. J. Phys. 1980. V.58. P.553.
17. Frish M.J., Trucks G.W., Schlegel H.B. et. al. Gaussian 94, Revision E.2; Gaussian Inc. Pittsburgh. PA. 1994.
18. Смолянинова Т. И., Брусков В.И., Кашпарова E. B. // Молекулярная биология. 1985. Т. 19. N 4. с. 992-1000.
19. Helene С., Lancelot G. // Prog. Biophys. Molec. Biol. 1982. 39. P.1- 68.
20. Anderson J.E., Ptashne M., Harrison S.C.// Nature.- 1987.- V.326.- P. 846-852.
Цитовано
Як цитувати
GaletichI. К., Stepanian, S. G., Shelkovsky, V. S., Kosevich, M. V., Blagoi, Y. P., & Adamovich, L. (1). ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ И ТЕОРЕТИЧЕСКОЕ ИЗУЧЕНИЕ МЕЖМОЛЕКУЛЯРНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ В УЗНАЮЩЕМ КОМПЛЕКСЕ МЕТИЛУРАЦИЛА С АКРИЛАМИДОМ. Біофізичний вісник, 1(1). вилучено із https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/1918
Розділ
Молекулярна біофізика
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
