Дослідження впливу ковалентного приєднаного феназинового барвника на перехід спіраль-клубок в змішаною системі poly (rA)-(dT)14
Анотація
Досліджено дію імідазо- -(4,5-d)-- феназин- N1-β-D -рібофуранозіда (Ргп), ковалентно приєднаного до 3 - кінця (dT)14 , на конформаційні переходи в змішаній дуплексній системі poly(rA)•(dT)14 . Виміри проведені в №-какоділатном буфері, рН6,9, з вмістом 0,1 М NaCl, при концентраціях полинуклеотидів 0,1 М NaCl пар основ. Комплексоутворення ро1у(гА) з (dT)14 )та (dT)14Pzn було вивчено методом термічної денатурації з реєстрацією кривих плавлення щодо змін УФ поглинання і інтенсивності флуоресценції приєднаного феназинового барвника. Встановлено, що ковалентне приєднання нуклеозідного похідного імідазофеназіна істотно підвищує термостабільність дуплексів, утворених (dT)14 с poly(rA), збільшуючи температуру конформаціонного переходу спіраль-клубок на 7 ° С, що викликано інтеркаляцією хромофора барвника між парами аденінових підстав. За допомогою моделі "двох станів" для досліджуваних систем визначени термодинамічні параметри переходу подвійна спіраль -клубок. Продемонстровано, що приєднання барвника призводить до зменшення ентальпії переходу, проте спостерігається виграш у вільній енергії комплексоутворення, ΔG, забезпечується зменшенням зміни ентропії.
Завантаження
Посилання
2. Cook P.D. // Anticancer Drug Des.-1991.- v.6, No.6.-p.585-607.
3. Milligan J.F., Matteucci M.D. and Martin J.C. // J. Medicinal Chem.-1993.-v.36.-p.1923-1937.
4. Helene C, Toulme J. // Biochim. Biophys. Acta.-1990.-v. 1049.- p.99-125.
5. Riordan M.L., Martin J.C. // Nature.- 1991.-v.350.-p.442-443.
6. Letsinger R.L., Schott М. Е. // J. Am. Chem. Soc-1981.- v.103, No. 24.- p.7394-7396.
7. Asseline U., Delarue M., Lancelot G., Toulme F., Thuong N.T., Montenay-Garestier T., Helene C. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.-1984.- v. 81, No 11.- p.3297-3301.
8. Dubey I.Ya. // Ukr. Bioorg. Acta.- 2006.-v. 1 .-p.42-59.
9. Shaw J.P., Kent К., Bird J., Fishback J., Froehler B. // Nucl. Acids Res.-1991.-v. 19, No.4.-p.747-750.
10. Makitruk V.L., Yarmoluk S.N., Shalamay A.S. and Alexeeva I.V. // Nucl. Acids Symp. Ser.-1991.-V.24.-P. 244.
11. Edmonds M., Winters M.A. // Prog. Nucl. Acid Res. Mol. Biol.-1976.- v.17.-p.149-179.
12. Ahlquist P., Kaesberg P. // Nucl.Acids Res.- 1979.-V.7, No.5. - p. 1195-1204.
13. Нурмухаметов P.H. Поглощение и люминесценция ароматических соединений.- М.: Химия, 1971.-216 с.
14. Zozulya V., Shcherbakova A., Dubey I. // J. Fluorescence.- 2000.-v.10, No.1.-p.49-53.
15. Froehler B.C., Ng P.G., and. Matteucci M.D. //Nucl. Acids Res.-1986.-v. 14.-p.5399-5407.
16. Макитрук В. Л., Шаламай A.C., Кондратюк И.В.// Биополимеры и клетка -1997-V.13, №6, р.453-459.
17. Серебряный С.Б., Юфа П.А. // Укр. Хим. Журн.-1963.-т. 29.-c. 322-329.
18. Thuong N.T., Asseline U., Roig V., Takasugi M., Helene С. // Proc. Natl. Acad Sei. USA.-1987.-V.84.-p.5129-5133.
19. Cassani G.R., Bollum F.J. // Biochemistry.- 1969.- v.8.-No 10.-p.3928-3936.
20. Zozulya V.N., Blagoi Yu.P., Lober G., Voloshin I., Winter S., Makitruk V., Shalamay A. // Biophys. Chem.-1997.-v.65.-p.55-63.
21. Zozulya V., Blagoi Yu., Dubey I., Fedoryak D., Makitruk V., Ryazanova O., Scherbakova A. // Biopolymers (Biospectroscopy).-2003.-v.72.-p.264-273.
22. Applequist J. and Damle V. //J. Am. Chem. Soc-1965.- v.87.-p. 1450-1458.
23. Martin F.H., Uhlenbeck O.C., Doty P. //J.Mol. Biol.- 1971.- v.57(2).-p.201-215.
24. Asseline U., Delarue M., Lancelot G., Toulme F., Thuong N.T., Montenay-Garrestier T., Helene C. // Proc. Natl. Acad Sei. USA.- 1984,-v. 81.-p.3297-3301.
25. Löber G., Kittler L. // Studia biophysica.-1978.-v.73, No.1 .-p.25-30.
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
