Валентные колебания карбонильных групп в Раман спектрах коллагена и poly (Gly-Pro-Pro): расчет и эксперимент

  • O. P. Boryskina Institute for Radiophysics and Electronics of NASU
  • T. V. Bolbukh Institute for Radiophysics and Electronics of NASU
  • M. A. Semenov Institute for Radiophysics and Electronics of NASU

Анотація

Получены Раман спектры политрипептида poly(Gly-Pro-Pro) и коллагена I типа в растворах оксида дейтерия. Частоты валентных карбонильных колебаний типа А рассчитаны согласно модели слабо связанных осциляторов, в рамках теории возмущений для полипептидных структур с учетом динамических резонансных взаимодействий диполей перехода. Рассчитанные частоты удовлетворительно согласуются с экспериментальными частотами полосы Амид I в Раман спектрах.

Завантаження

Дані завантаження ще не доступні.

Біографії авторів

O. P. Boryskina, Institute for Radiophysics and Electronics of NASU

12 Acad. Proscura Str., Kharkov 61085, Ukraine

T. V. Bolbukh, Institute for Radiophysics and Electronics of NASU

12 Acad. Proscura Str., Kharkov 61085, Ukraine

M. A. Semenov, Institute for Radiophysics and Electronics of NASU

12 Acad. Proscura Str., Kharkov 61085, Ukraine

Посилання

Gribov LA, Teoriia infrakrasnykh spektrov polimerov. M.:Nauka; 1977. (in Russian)

Eliot A. Infrakrasnye spektry i struktura polimerov. M.:Mir; 1972. (in Russian)

Miyazawa TJ. Pertubation treatment of the characteristic vibrations of polypeptide chains in various configurations. J. Chem. Phys. 1960;32:1647-52.

Chirgadze YuN, Nevskaya NA. Infrared Spectra and resonance interactions of Amide-I vibration of the antiparallel-chain pleated sheet. Biopolymers. 1976;15:607-25.

Chirgadze YaN, Nevskay NA. Infarared spectra and resonance interactions of Amide-I vibration of the parallel-chain pleated sheet. Biopolymers. 1976;15:627-36.

Nevskaya NA. Chirgadze YuN. Infrared spectra and resonance interactions of Amide-l and II vibrations a-helix. Biopolymers. 1976;15:637-48.

Moore WH, Krimm S. Vibrational analysis of peptides, polypeptides and proteins. I. Polyglycine I. Biopolymers. 1976;15:2439-64.

Moore WH, Krimm S. Vibrational analysis of peptides, polypeptides and proteins. II. β-Poly(L-alanine) and β-Poly (L-alanilglycine). Biopolymers. 1976;15:2465-83.

Melezhik EP,Semenov MA. Rezonansnye vzaimodeistviia karbonilnykh kolebanii v kollagenovykh strukturakh. Biofizicheskii vestnik. 2003;606(13):62-8. (in Russian)

Melezhik EP, Semenov MA, Ivanov AIu. Issledovanie tonkoi struktury polos Amid I IK-Fure spektra kollagena. Biofizicheskii vestnik. 2005;665(15):35-42. (in Russian)

Kramer RZ, Bella J, Mayville P, Brodsky B, Berman HM. Sequence dependent conformational variations of collagen triple-helical structure. Nature Structural Biology. 1999;6(5):454-7.

Emsley J, Knight CG, Farndale RW, Barmes MJ, Liddington RC. Structural basis of collagen recognition by integrin a2b1. Cell. 2000;100:47-56.

Parker FS. Application of Infrared, Raman and resonance Raman spectroscopy in biochemistry. New York: Plemun Press; 1983. 550p.

Lazarev YA, Grishkovsky BA, Khromova TB, Lazareva AV, Grechishko VS. Bound water in the collagen-like triple-helical structure. Biopolymers. 1992;32(2):189-95.
Опубліковано
2019-04-12
Цитовано
0 статей
Як цитувати
Boryskina, O., Bolbukh, T., & Semenov, M. (2019). Валентные колебания карбонильных групп в Раман спектрах коллагена и poly (Gly-Pro-Pro): расчет и эксперимент. Біофізичний вісник, 2(16), 5-9. Retrieved із https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/13285
Розділ
Молекулярна біофізика