Водорості в базі даних світових колекцій живих культур WDCM CCINFO
Ключові слова:
водорості, культивування, бази даних, WDCM CCINFO
Анотація
Аналізували, як представлені водорості у світових колекціях живих культур за базою даних WDCM CCINFO. Виявлено недоліки бази: наявні порожні, помилкові і повторні записи, не всі колекції представлені у зведеному каталозі. Поточна 6 версія бази містить 2307 видів водоростей (близько 5% відомого природного різноманіття) і 142 внутрішньовидових таксони, живі культури яких підтримуються в 12 колекціях; 293 культури не визначені до виду. Більше половини культур в найбільших світових колекціях є унікальними і не дублюються в інших колекціях. Таксономічне різноманіття водоростей відображено в культурі нерівномірно: слабко представлені Діатомові, Бурі, Червоні і Динофітові водорості; найкраще представлені в культурі Зелені водорості. Пропонується враховувати дані аутекології при виділенні водоростей в культуру для розширення і оновлення фондів колекцій.
Завантаження
##plugins.generic.usageStats.noStats##
Посилання
Горбулин О.С. Эколого-биологические характеристики Cryptophyta флоры Украины // Вісник Харківського національного університету імені В.Н.Каразіна. Серія: Біологія. – 2011б. – №13. – С. 47–56. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskiye kharakteristiki Cryptophyta flory Ukrainy // Vіsnyk Kharkіvs'kogo natsіonal'nogo unіversytetu іmenі V.N.Karazіna. Seriya: Bіologіya. – 2011b. – №13. – S. 47–56./
Горбулин О.С. Эколого-биологические характеристики представителей Ulotrichales, Oedogoniales, Cladophorales континентальных водоемов Украины // Вісник Харківського національного університету імені В.Н.Каразіна. Серія: Біологія. – 2014a. – №20. – С. 242–249. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskiye kharakteristiki predstaviteley Ulotrichales, Oedogoniales, Cladophorales kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Vіsnyk Kharkіvs'kogo natsіonal'nogo unіversytetu іmenі V.N. Karazіna. Seriya: Bіologіya. – 2014a. – №20. – S. 242–249./
Горбулин О.С. Эколого-биологическая характеристика Chrysophyta континентальных водоёмов Украины // Гидробиологический журнал. – 2013. – Т.49, №3. – С. 3–12. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskaya kharakteristika Chrysophyta kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Gidrobiologicheskiy zhurnal. – 2013. – T.49, №3. – S. 3–12./
Горбулин О.С. Эколого-биологические характеристики Xanthophyta континентальных водоемов Украины // Вісник Харківського національного університету імені В.Н.Каразіна. Серія: Біологія. – 2012. – №15. – С. 50–66. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskiye kharakteristiki Xanthophyta kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Vіsnyk Kharkіvs'kogo natsіonal'nogo unіversytetu іmenі V.N.Karazіna. Seriya: Bіologіya. – 2012. – №15. – S. 50–66./
Горбулин О.С. Эколого-биологические характеристики Dinophyta флоры континентальных водоемов Украины // Вісник Харківського національного університету імені В.Н.Каразіна. Серія: Біологія. – 2011а. – №14. – С. 43–58. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskiye kharakteristiki Dinophyta flory kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Vіsnyk Kharkіvs'kogo natsіonal'nogo unіversytetu іmenі V.N. Karazіna. Seriya: Bіologіya. – 2011а. – №14. – S. 43–58./
Горбулин О.С. Видовое разнообразие и аутэкология Euglenophyta континентальных водоемов Украины // Фиторазнообразие Восточной Европы. – 2014б. – Т.8, №3. – С. 4–44. /Gorbulin O.S. Vidovoye raznoobraziye i autekologiya Euglenophyta kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Fitoraznoobraziye Vostochnoy Yevropy. – 2014b. – T.8, №3. – S. 4–44./
Горбулин О.С. Эколого-биологические характеристики Cyanoprokaryota (Cyanophyta) континентальных водоемов Украины // Альгология. – 2014в. – Т.24, №2.– С. 163–181. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskiye kharakteristiki Cyanoprokaryota (Cyanophyta) kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Al'gologiya. – 2014v. – T.24, №2.– S. 163–181./
Charrier B., Rolland E., Gupta V., Reddy C.R.K. Production of genetically and developmentally modified seaweeds: exploiting the potential of artificial selection techniques // Frontiers in Plant Science. – 2015. – Vol.6, Article 127. (http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2015.00127)
Chepurnov V.A., Mann D.G., Sabbe K., Vyverman W. Experimental studies on sexual reproduction in diatoms // International review of cytology. – 2004. – Vol.237. – P. 91–154.
Clay B., Kugrens P. Systematics of the enigmatic kathablepharids, including EM characterization of the type species, Kathablepharis phoenikoston, and new observations on K. remigera comb. nov // Protist. – 1999. – Vol.150, №1. – P. 43–59.
Cock J.M., Coelho S.M. Algal models in plant biology // Journal of Experimental Botany. – 2011. – Vol.62, №8. – P. 2425–2430.
Dawyndt P., Vancanneyt M., De Meyer H., Swings J. Knowledge accumulation and resolution of data inconsistencies during the integration of microbial information sources // IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering. – 2005. – Vol.17, №8. – P. 1111–1126.
Ellegaard M., Godhe A., Härnström K., McQuoid M. The species concept in a marine diatom: LSU rDNA–based phylogenetic differentiation in Skeletonema marinoi/dohrnii (Bacillariophyceae) is not reflected in morphology // Phycologia. – 2008. – Vol.47, №2. – P. 156–167.
Gorbulin O.S. Ecological and biological characteristics of the green flagellates (Phytomonadina) of the continental waters of Ukraine // The Journal of V.N.Karazin Kharkov National University. Series “Biology”. 2012. – №1035. – Iss.16. – P. 63–76.
Guiry M.D. How many species of algae are there? // Journal of Phycology. – 2012. – Vol.48, №5. – P. 1057–1063.
Guiry M.D., Guiry G.M. AlgaeBase. World-wide electronic publication. – National University of Ireland, Galway, 2015. (http://www.algaebase.org)
Hohmann-Marriott M.F., Blankenship R.E. Evolution of photosynthesis // Annual review of plant biology. – 2011. – Vol.62. – P. 515–548.
KEGG. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (www.genome.jp/kegg/)
NCBI. National Centre for Biotechnology Information (www.ncbi.nlm.nih.gov)
NCBI Taxonomy database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy)
Sekimoto H., Sone Y., Fujii T. Biochemical, physiological, and molecular analysis of sexual isolation in the species complex Closterium peracerosum-strigosum-littorale (Chlorophyta) // Journal of Phycology. – 1995. – Vol.31, №4. – P. 611–615.
Starr R.C., Zeikus J.A. UTEX – the culture collection of algae at the University of Texas at Austin 1993 list of cultures // Journal of Phycology. – 1993. – Vol.29, №s2. – P. 1–106.
Sun Q., Liu L., Wu, L. et al. Web resources for microbial data // Genomics, proteomics & bioinformatics. – 2015. – Vol.13, №1. – P. 69–72.
Vasilenko A., Ozerskaya S., Stupar O. Current WFCC CC catalogues as a starting ground for networking efforts // WFCC Newsletter. – 2011. – №50. – P. 5–15.
WDCM CCINFO. World Data Centre for Microorganisms, Culture Collections Information Worldwide. – 2014. (http://www.wfcc.info/ccinfo/)
Wijffels R.H., Kruse O., Hellingwerf K.J. Potential of industrial biotechnology with cyanobacteria and eukaryotic microalgae // Current Opinion in Biotechnology. – 2013. – Vol.24, №3. – P. 405–413.
Горбулин О.С. Эколого-биологические характеристики представителей Ulotrichales, Oedogoniales, Cladophorales континентальных водоемов Украины // Вісник Харківського національного університету імені В.Н.Каразіна. Серія: Біологія. – 2014a. – №20. – С. 242–249. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskiye kharakteristiki predstaviteley Ulotrichales, Oedogoniales, Cladophorales kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Vіsnyk Kharkіvs'kogo natsіonal'nogo unіversytetu іmenі V.N. Karazіna. Seriya: Bіologіya. – 2014a. – №20. – S. 242–249./
Горбулин О.С. Эколого-биологическая характеристика Chrysophyta континентальных водоёмов Украины // Гидробиологический журнал. – 2013. – Т.49, №3. – С. 3–12. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskaya kharakteristika Chrysophyta kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Gidrobiologicheskiy zhurnal. – 2013. – T.49, №3. – S. 3–12./
Горбулин О.С. Эколого-биологические характеристики Xanthophyta континентальных водоемов Украины // Вісник Харківського національного університету імені В.Н.Каразіна. Серія: Біологія. – 2012. – №15. – С. 50–66. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskiye kharakteristiki Xanthophyta kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Vіsnyk Kharkіvs'kogo natsіonal'nogo unіversytetu іmenі V.N.Karazіna. Seriya: Bіologіya. – 2012. – №15. – S. 50–66./
Горбулин О.С. Эколого-биологические характеристики Dinophyta флоры континентальных водоемов Украины // Вісник Харківського національного університету імені В.Н.Каразіна. Серія: Біологія. – 2011а. – №14. – С. 43–58. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskiye kharakteristiki Dinophyta flory kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Vіsnyk Kharkіvs'kogo natsіonal'nogo unіversytetu іmenі V.N. Karazіna. Seriya: Bіologіya. – 2011а. – №14. – S. 43–58./
Горбулин О.С. Видовое разнообразие и аутэкология Euglenophyta континентальных водоемов Украины // Фиторазнообразие Восточной Европы. – 2014б. – Т.8, №3. – С. 4–44. /Gorbulin O.S. Vidovoye raznoobraziye i autekologiya Euglenophyta kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Fitoraznoobraziye Vostochnoy Yevropy. – 2014b. – T.8, №3. – S. 4–44./
Горбулин О.С. Эколого-биологические характеристики Cyanoprokaryota (Cyanophyta) континентальных водоемов Украины // Альгология. – 2014в. – Т.24, №2.– С. 163–181. /Gorbulin O.S. Ekologo-biologicheskiye kharakteristiki Cyanoprokaryota (Cyanophyta) kontinental'nykh vodoyemov Ukrainy // Al'gologiya. – 2014v. – T.24, №2.– S. 163–181./
Charrier B., Rolland E., Gupta V., Reddy C.R.K. Production of genetically and developmentally modified seaweeds: exploiting the potential of artificial selection techniques // Frontiers in Plant Science. – 2015. – Vol.6, Article 127. (http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2015.00127)
Chepurnov V.A., Mann D.G., Sabbe K., Vyverman W. Experimental studies on sexual reproduction in diatoms // International review of cytology. – 2004. – Vol.237. – P. 91–154.
Clay B., Kugrens P. Systematics of the enigmatic kathablepharids, including EM characterization of the type species, Kathablepharis phoenikoston, and new observations on K. remigera comb. nov // Protist. – 1999. – Vol.150, №1. – P. 43–59.
Cock J.M., Coelho S.M. Algal models in plant biology // Journal of Experimental Botany. – 2011. – Vol.62, №8. – P. 2425–2430.
Dawyndt P., Vancanneyt M., De Meyer H., Swings J. Knowledge accumulation and resolution of data inconsistencies during the integration of microbial information sources // IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering. – 2005. – Vol.17, №8. – P. 1111–1126.
Ellegaard M., Godhe A., Härnström K., McQuoid M. The species concept in a marine diatom: LSU rDNA–based phylogenetic differentiation in Skeletonema marinoi/dohrnii (Bacillariophyceae) is not reflected in morphology // Phycologia. – 2008. – Vol.47, №2. – P. 156–167.
Gorbulin O.S. Ecological and biological characteristics of the green flagellates (Phytomonadina) of the continental waters of Ukraine // The Journal of V.N.Karazin Kharkov National University. Series “Biology”. 2012. – №1035. – Iss.16. – P. 63–76.
Guiry M.D. How many species of algae are there? // Journal of Phycology. – 2012. – Vol.48, №5. – P. 1057–1063.
Guiry M.D., Guiry G.M. AlgaeBase. World-wide electronic publication. – National University of Ireland, Galway, 2015. (http://www.algaebase.org)
Hohmann-Marriott M.F., Blankenship R.E. Evolution of photosynthesis // Annual review of plant biology. – 2011. – Vol.62. – P. 515–548.
KEGG. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (www.genome.jp/kegg/)
NCBI. National Centre for Biotechnology Information (www.ncbi.nlm.nih.gov)
NCBI Taxonomy database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy)
Sekimoto H., Sone Y., Fujii T. Biochemical, physiological, and molecular analysis of sexual isolation in the species complex Closterium peracerosum-strigosum-littorale (Chlorophyta) // Journal of Phycology. – 1995. – Vol.31, №4. – P. 611–615.
Starr R.C., Zeikus J.A. UTEX – the culture collection of algae at the University of Texas at Austin 1993 list of cultures // Journal of Phycology. – 1993. – Vol.29, №s2. – P. 1–106.
Sun Q., Liu L., Wu, L. et al. Web resources for microbial data // Genomics, proteomics & bioinformatics. – 2015. – Vol.13, №1. – P. 69–72.
Vasilenko A., Ozerskaya S., Stupar O. Current WFCC CC catalogues as a starting ground for networking efforts // WFCC Newsletter. – 2011. – №50. – P. 5–15.
WDCM CCINFO. World Data Centre for Microorganisms, Culture Collections Information Worldwide. – 2014. (http://www.wfcc.info/ccinfo/)
Wijffels R.H., Kruse O., Hellingwerf K.J. Potential of industrial biotechnology with cyanobacteria and eukaryotic microalgae // Current Opinion in Biotechnology. – 2013. – Vol.24, №3. – P. 405–413.
Цитовано
Як цитувати
Комариста, В. П., Горбулін, О. С., & Догадіна, Т. В. (1). Водорості в базі даних світових колекцій живих культур WDCM CCINFO. Вісник Харківського національного університету імені В. Н. Каразіна. Серія «Біологія», 25, 57-63. вилучено із https://periodicals.karazin.ua/biology/article/view/5516
Номер
Розділ
БОТАНІКА ТА ЕКОЛОГІЯ РОСЛИН
Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої її публікації на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License 4.0 International (CC BY 4.0), яка дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи.
