Міжвидова і внутрішньовидова молекулярно-генетична мінливість і диференціація у крапчастих ховрахів Spermophilus suslicus і S. odessanus (Rodentia, Sciuridae, Marmotini)
Анотація
Вивчено нуклеотидні послідовності контрольного регіону мітохондріальної ДНК 28 особин 2 видів крапчастих ховрахів з 12 точок з території України, Росії та Польщі, а також матеріал з ГенБанку NCBI. Відмінності між 36- і 34-хромосомними ховрахами за нуклеотидними замінами склали 4,4±0,5 %. Філогенетичне дерево відображає поділ на хромосомні форми і внутрішньовидову географічну диференціацію. Підтверджується роль Дніпра в ізоляції західної та східної форм крапчастого ховраха в ранньому голоцені і вплив гідрогеографічних бар'єрів у формуванні їх внутрішньовидової мінливості. Окреслено межі поширення трьох підвидів S. suslicus. Показано наявність двох генетично диференційованих форм S. odessanus в Дніпровсько-Бузькому межиріччі.
Завантаження
Посилання
Власов А., Брандлер О. Крапчатый суслик исчез в Курской области? // Степной бюллетень. – 2011. – №33. – С.35. /Vlasov A., Brandler O. Krapchatyy suslik ischez v Kurskoy oblasti? // Stepnoy byulleten'. – 2011. – №33. – S. 35./
Громов И.М., Бибиков Д.И., Калабухов Н.И. и др. Фауна СССР. Млекопитающие. Т.3, В.2. – М.–Л.: Наука, 1965. – 453с. /Gromov I.M., Bibikov D.I., Kalabukhov N.I. i dr. Fauna SSSR. Mlekopitayushchiye. T.3, V.2. – M.–L.: Nauka, 1965. – 453s./
Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. – СПб, 1995. – 522с. /Gromov I.M., Yerbayeva M.A. Mlekopitayushchiye fauny Rossii i sopredel'nykh territoriy. Zaytseobraznyye i gryzuny. – SPb, 1995. – 522s./
Ермаков О.А., Сурин В.Л., Титов С.В. и др. Изучение гибридизации четырех видов сусликов (Spermophilus: Rodentia, Sciuridae) молекулярно-генетическими методами // Генетика. – 2002. – Т.38, №7. – С. 950–964. /Yermakov O.A., Surin V.L., Titov S.V. i dr. Izucheniye gibridizatsii chetyrekh vidov suslikov (Spermophilus: Rodentia, Sciuridae) molekulyarno-geneticheskimi metodami // Genetika. – 2002. – T.38, №7. – S. 950–964./
Ермаков О.А., Сурин В.Л., Титов С.В. Генетическая изменчивость и дифференциация крапчатого суслика по данным секвенирования контрольного региона мтДНК // Известия ПГПУ им. В.Г.Белинского. – 2011. – №25. – С. 176–180. /Yermakov O.A., Surin V.L., Titov S.V. Geneticheskaya izmenchivost' i differentsiatsiya krapchatogo suslika po dannym sekvenirovaniya kontrol'nogo regiona mtDNK // Izvestiya PGPU im. V.G. Belinskogo. – 2011. – № 25. – S. 176–180./
Загороднюк I., Кондратенко O. Сучасне поширення і стан популяцій ховрахів (Spermophilus) на сході України // Теріофауна сходу України (Праці Теріологічної школи, випуск 7). – Луганськ, 2006. – C. 211–214. /Zagorodnyuk I., Kondratenko O. Suchasne poshirennya і stan populyatsіy khovrakhіv (Spermophilus) na skhodі Ukrayiny // Terіofauna skhodu Ukrayiny (Pratsi Terіologіchnoyi shkoly, vypusk 7) – Lugans'k, 2006. – S. 211–214./
Загороднюк И.В., Федорченко А.А. Аллопатрические виды среди грызунов группы Spermophilus suslicus (Mammalia) // Вестник зоологии. – 1995. – Т.29, № 5–6. – С. 49–58. /Zagorodnyuk I.V., Fedorchenko A.A. Allopatricheskiye vidy sredi gryzunov gruppy Spermophilus suslicus (Mammalia) // Vestnik zoologii. – 1995. – T.29, №5–6. – S. 49–58./
Киндюк Б.В. Исследование происхождения и развития речной сети Украинских Карпат // Культура народов Причерноморья. – 2003. – №43. – С. 26–30. /Kindyuk B.V. Issledovaniye proiskhozhdeniya i razvitiya rechnoy seti Ukrainskikh Karpat // Kul'tura narodov Prichernomor'ya. – 2003. – №43. – S. 26–30./
Кораблев В.П., Сузуки Х., Ляпунова Е.А. и др. Молекулярно-генетическое изучение хромосомных форм крапчатого суслика Spermophilus suslicus Guld., 1770 // VI съезд Териологического об-ва. Тез. докл. – Москва, 1999. – С. 125. /Korablev V.P., Suzuki Kh., Lyapunova Ye.A. i dr. Molekulyarno-geneticheskoye izucheniye khromosomnykh form krapchatogo suslika Spermophilus suslicus Guld., 1770 // VI s’yezd Teriologicheskogo ob-va. Tez. dokl. – Moskva, 1999. – S. 125./
Матросова В.А., Савинецкая Л.Е., Шекарова О.Н. и др. Внутри- и межпопуляционный полиморфизм контрольного региона митохондриальной ДНК у крапчатого суслика (Spermophilus suslicus) // Доклады Академии наук. – 2014. – Т.455, №6. – С. 721–726. /Matrosova V.A., Savinetskaya L.Ye., Shekarova O.N. i dr . Vnutri- i mezhpopulyatsionnyy polimorfizm kontrol'nogo regiona mitokhondrial'noy DNK u krapchatogo suslika (Spermophilus suslicus) // Doklady Akademii nauk. – 2014. – T.455, №6. – S. 721–726.
Огнев С.И. Звери СССР и прилежащих стран. Т.5. Грызуны. – М.-Л.: Изд-во АН СССР, 1947. – 809с. /Ognev S.I. Zveri SSSR i prilezhashchikh stran. T. 5. Gryzuny. – M.-L.: Izd-vo AN SSSR, 1947. – 809s./
Смирнова О.В., Турубанова С.А., Бобровский М.В. и др. Реконструкция истории лесного пояса Восточной Европы и проблема поддержания биологического разнообразия // Успехи современной биологии. – 2001. – Т.121, №2. – С. 144–159. /Smirnova O.V., Turubanova S.A., Bobrovskiy M.V. i dr. Rekonstruktsiya istorii lesnogo poyasa Vostochnoy Yevropy i problema podderzhaniya biologicheskogo raznoobraziya // Uspekhi sovremennoy biologii. – 2001. – T.121, №2. – S. 144–159./
Титов С.В. Современное распространение и изменение численности крапчатого суслика, Spermophilus suslicus, в восточной части ареала // Зоологический журнал. – 2001. – Т.80, №2. – С. 230–235. /Titov S.V. Sovremennoye rasprostraneniye i izmeneniye chislennosti krapchatogo suslika, Spermophilus suslicus, v vostochnoy chasti areala // Zoologicheskiy zhurnal. – 2001. – T.80, №2. – S. 230–235./
Фрисман Л.В., Кораблев В.П., Ляпунова Е.А. и др. Аллозимная дифференциация разнохромосомных форм крапчатого суслика (Spermophilus suslicus Guld, 1770, Rodentia) // Генетика. – 1999. – Т.35, №3. – С.378–384. /Frisman L.V., Korablev V.P., Lyapunova Ye.A. i dr. Allozimnaya differentsiatsiya raznokhromosomnykh form krapchatogo suslika (Spermophilus suslicus Guld, 1770, Rodentia) // Genetika. – 1999. – T. 35, №3. – S. 378–384./
Цвирка М.В., Кораблев В.П., Челомина Г.Н. Исследование генетической изменчивости крапчатого суслика Spermophilus suslicus Güld, 1770 (Rodentia, Sciuridae) // Териофауна России и сопредельных территорий: Мат. межд. совещ. – Москва, 2003. – С.376. /Tsvirka M.V., Korablev V.P., Chelomina G.N. Issledovaniye geneticheskoy izmenchivosti krapchatogo suslika Spermophilus suslicus Güld, 1770 (Rodentia, Sciuridae) // Teriofauna Rossii i sopredel'nykh territoriy: Mat. mezhd. soveshch. – Moskva, 2003. – S.376./
Шилова С.А., Неронов В.В., Шекарова О.Н., Савинецкая Л.Е. Динамика поселений крапчатого суслика (Spermophilus suslicus Guld., 1770) на северной границе ареала // Известия РАН. Сер. биологическая. – 2010. – №5. – С. 619–624. /Shilova S.A., Neronov V.V., Shekarova O.N., Savinetskaya L.Ye. Dinamika poseleniy krapchatogo suslika (Spermophilus suslicus Guld., 1770) na severnoy granitse areala // Izvestiya RAN. Ser. biologicheskaya. – 2010. – №5. – S. 619–624./
Aljanabi S.M., Martinez I. Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques // Nucl. Acids Res. – 1997. – Vol.25. – P. 4692–4693.
Bandelt H-J., Forster P., Röhl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Mol. Biol. Evol. – 1999. – Vol.16, No1. – P. 37–48.
Biedrzycka A., Radwan J. Population fragmentation and major histocompatibility complex variation in the spotted suslik, Spermophilus suslicus // Molecular Ecology. – 2008. – Vol.17. – P. 4801–4811.
Ermakov O.A., Simonov E., Surin V.L. et al. Implications of hybridization, NUMTs, and overlooked diversity for DNA barcoding of Eurasian ground squirrels // PLoS ONE. – 2015. – Vol.10 (1). – e0117201.
Ford C.E., Hamerton J.L. A colchicine, hypotonic citrate, squash sequence for mammalian chromosomes // Stain Technol. – 1956. – Vol.31, №6. – P. 247–251.
Kocher T.D., Thomas W.K., Meyer A. Dynamics of mitochondrial DNA evolution in animals: amplification and sequencing with conserved primers // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 1989. – Vol.86. – P. 6196–6200.
Tamura K., Stecher G., Peterson D. et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. // Molecular Biology and Evolution. – 2013. – Vol.30. – P. 2725–2729.
Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої її публікації на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License 4.0 International (CC BY 4.0), яка дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи.
