Вплив похідного актиноцину АСТ III на плавлення ДНК у складі комплексів ДНК - АСТ III при різних концентраціях ліганду
Ключові слова:
ДНК, похідне актиноцину, диференціальна скануюча калориметрія, спектрофотометрія, мультімодальне зв'язування, термодинамікаАнотація
На підставі аналізу спектрофотометричних концентраційних залежностей в системі тимусна ДНК похідне актиноцину Act III отримана інформація про типи комплексів і їх стехіометрії при іонної силі розчину 0.015 М Na +. Методом диференціальної скануючої калориметрії отримані термодинамічні параметри плавлення ДНК в складі цих комплексів. Показано, що в системі ДНК-Act III в залежності від співвідношення концентрацій ДНК і ліганда P / D утворюються два типи комплексів,які істотно розрізняються за термодинамічними параметрами і структурі. При низьких значеннях P / D Act III пов'язується переважно з сахарофосфатним остовом, утворюючи комплекси, неспецифічні до нуклеотидної послідовності. При високих значеннях P / D відбувається утворення комплексів по типу інтеркаляції, яке призводить до зміни структури GC-збагачених ділянок ДНК. В області середніх значень P / D, де співіснують обидва типи комплексів, в процесі плавлення відбувається перерозподіл лиганда, який призводить до збільшення концентрації Act III в складі комплексу по типу агрегації. Показано, що величини місць зв'язування, визначені методами спектрофотометрії і калориметрії, істотно відрізняються .
Завантажити
Посилання
Vardevanyan P.O., Antonyan A.P., Manukyan G.A., Karapetyan A.T. // Experimental and Molecular Medicine. 2001. Vol.33. No.4. P.205-208.
Barcelo F., Capo D., Portugal J. // Nucleic Acids Research. 2002. Vol.30. No.20. P. 4567-4573.
Barcelo P., Orliz-lombatdia M., Portugal J. // Biochimica et Biophysica Acta. 2001. Vol.1519. P.175-184.
Sovenyhazy K., Bolderon J., Petty J. // Nucleic Acids Research. 2003. Vol.31. No. 10. P. 2561-2569.
Карапетян А.Т., Пермогоров В.И., Франк-Каменетский М.Д., Лазуркин Ю.С. // Молекулярная биология. 1972. Т.6. Вып.6. С.867-874.
Borisova O.F., Shchyolkina A.K., Karapetyan A.T., Surovaya A.N. // Mol. Biology. 1998. Vol.32. No.5. P.718-724.
Snyder J.G., et al. // Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1989. Vol.86. P.3968-3972.
Yoo H., Rill R.L. // J.Mol.Recognit. 2001. 14. P.145-150.
Chen F.-M, et al. // BiophysJ. 2003. Vol.84. P.432-439.
Chin K.-H., et al. // Nucleic Acids Research. 2003. Vol.31. No.10. P. 2622-2629.
Круглова Е.Б., Гладковская Н.А. // "Вісник Харківського Університету" №637, 'Біофізичний Вісник". 2004. Вып. 1-2 (14).С.43-47
Anti-cancer Drug Design: Biological and Biophysical Aspects of Synthetic Phenoxazone Derivatives. Eds Veselkov A.N., Davies D.B. Sevastopol: SEVNTU Press. 2002. 259 р.
Круглова Е.Б., Гладковская Н.А., Малеев В.Я. // Биофизика. 2005. Т. 50. Вып.2. С. 253-264.
Круглова Е.Б., Малеев В.Я., Глибин Е.Н., Веселков А.Н. // 'Вісник Харківського Університету" №560,'Біофізичний Вісник". 2002. Вып.1 (10). С. 12-20.
Hinz H.-J., Schwarz F.P. // Pure Appl. Chem., Vol. 73, No. 4, pp. 745-759, 2001
Круглова Е.Б., Ермак Е.Л. // "Вісник Харківського Університету" №560, 'Біофізичний Вісник". 2003. Вып. 1(12). С. 64-69
Esposito D., Del Vicchio P., Barone G. // J.Am.Chem.Soc. 1997. Vol.119. No. 11. P.2606-2613.
Marky L.A., Blumenfeld K.S., Breslauer K.J. // Nucleic Acids Research. Vol. 11, No.9, 1983, 2857-2870.
Marky L.A., Snyder J.G., Breslauer K.J. // Nucleic Acids Research. 1983. Vol.11. No. 16. P.5701-5715.
Ахрем А.А., Ландо Д.Ю. //Молекулярная биология. 1981. Т. 15. №5. С.1083-1091.
Chaires J.B. // Archives of Biochemistry and Biophysics. 2006. 453. P.24-29.
Chaires J.B. // Biopolymers. 1998. Vol. 44. Issue 3. P.201-215.
Scott E.V., Jones R.L., Banville D.L., et al. // Biochemistry. 1988. Vol.27. No.3. P.915-923.
Scott E.Z., Zon G., Marzilli L.G., Wilson W.D. // Biochemistry. 1988. Vol.27. No.20. P.7940-7951.
Благой Ю.П., Галкин В.Л., Гладченко Г.О., Корнилова СВ., Сорокин В.А., Шкорбатов А.Г. Металлокомплексы нуклеиновых кислот в растворах. К. Наукова думка. 1991. 270с.
Березняк Е.Г., Круглова Е.Б. и др. II Биофизика. 2007. Т.52. Вып.5. С.812-821.
Ландо Д.Ю., Иванова М.А., Ахрем А.А. // Молекулярная биология. 1980. Т.14. Вып.6. С. 1281-1288.
Завантаження
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
