HYDRATION AND STABILITY OF NUCLEIC ACIDS WITH DIFFERENT AT- AND GC - COMPOSITION IN CONDENSED STATE
Keywords:
IR-spectroscopy
Abstract
In the suggested review the results of the investigation of influence of water on structure and stability of nucleic acids (NA) are generalized on the basis of literature dates and our method of studies of peculiarity hydration of NA with different nucleotide composition in the system NA-water with variable water content. An analysis showed that contribution of the water molecules in total energy of stabilization of helical structure of nucleic acids is up to 70-75% and contribution of H-bonds of Watson-Crick pairs in this energy does not exceed 25%. These results allowed to bring out effect of other factors except influence of water on formation and stabilization of DNA hydration shell.
Downloads
Download data is not yet available.
References
1. Rein R. Intermolecular Interactions. From Dinamics to Biopolymers (Pullman B,Ed), New York, Brisbane, Toronto, p.414-488(1978)
2. Малеев В.Я, Семенов M.A., Гасан А.И., Кашпур В.А.//Биофизика.1993.Т.38.С.768-790
3. Eisenhaber F., Tumanyan V.U. and Abagyan R.A.//Biopolymers. 1990. V.30,p.563-578
4. Теплухин A.B., Журкин В.Б, Джерниган Р., Полтев В.И.// Мол.биология. 1996. Т.ЗО.С.121-135
5. Данилов В.И., Желтовский Н.В., Слюсарчук О.Н, Альдерфер Дж.Л.// Биополимеры и клетка.- 1997. - Т.13.№1. - С.46-54
6. Semenov М. А., Bolbukh T.V. and Maleev V.Ya.//J.MoI.Struct. 1997.408/409,p.213-217
7. Семенов М. А, Больбух Т.В, Малеев В.Я.// Биофизика. 1985.Т.30.С.571-577
8. Семенов М.А, Малеев В.Я, Березняк Е.Г, Гасан А.И, Больбух Т.В.// Мол.биология. 1991.Т.25.С.1626-1634
9. Семенов М. А, Матвеев ДА, Больбух Т.В, Малеев В.Я.// Биофизика. 1994.Т.39.С.628-636
10. Семенов М.А, Больбух Т.В, Гасан А.И, Малеев В.Я.//Биофизика. 1996.Т.41 .С. 1007-1015
11. Семенов М.А, Гасан А.И, Больбух Т.В, Малеев В.Я.//Биофизика. 1997.Т.42.С.591-598
12. Bolbukh T.V, Starikov Е.В. and Semenov М.А.// Studia Biophysika. 1985.V. 108,p. 199-207
13.Gasan A.I, Maleev V.Ya. and Semenov M.A.// Studia Biophysika. 1990.V. 130.p. 171-178
14. Arnott S, Chandrasekaran R, Hall I.H. and |Pnigjaner L.C.// Nucleic Res.1983.V.11, p.4141-4155
15. Skuratovskii I.Ya. Instituto Jun March de Estudious e Investigasiones, Centro de Reuniones
Internationales Sobre Biología, Madrid, p.91 (1991)
16. Chuprina V.P.// Nucl.As.Res.1987.V.15,p.293-305
17. Lu K.C, Prohofsky E.W. and Zandt V.// Biopolymers. 1977.V. 16,p.2491 -2505
18. Alexeev D.G., Lipanov A.A. and Skuratovskii I.Ya.// Nature. 1987.V.325,p.821 -823
19. Park H, Arnott S, Chandrasekaran R. and Millane R.P.//J.Mol.Biol,1987.V.325,p.513-523
20.Semenov M.A. and Bolbukh T.V.// Studia Biophysika. 1984.V. 102,p,215-220
21.Иогансен A.B, Розенберг М.Ш. //Опт. спектрос. 1978. Т.44. С.87-92
22.Семенов M.A. Дисс.докт.физ.-мат.наук, M. МГУ, 1990
23.Bolbukh T.V, Semenov M.A, Starikov E.B. and Maleev V.Ya. Proc.Third European Conference on Spectr.Biol.Mol., Boogna, Italy, р.185-188(1989)
24.Saenger W, Hunter W.N. and Kennard O.// Nature. 1986. V.324, p.385-388
25. Семенов M.A, Малеев В.Я.// Биофизика. 1986.T.31. C.764-767
26.Neumann E. and Ackermann Th.// J.Phys. Chem. 1969. V.73, p.2170-2172
27. Хинц Г.И. Биохимическая термодинамика, под ред. М. Джоунс. М. Мир, 1982. 440 с
28. Зайцев М.А, Филимонов В.В.//Биофизика. 1990. Т.35. С.53-57
29.Klump Н. and Ackermann T.//Biopolymers. 1971 V. 10, р. 513-522
30. Андроникашвили А. Л, Мгеладзе Г.Н, Меноселидзе Д.Р. 6-я Всесоюзная конференция по
калориметрии. Тбилиси. 1973.С.496-500
31. Сухоруков Б.И, Семенов М.А, Малеев В.Я, Шабарчина Л.И.// Биофизика. 1979. Т.24. С.611-619
32. Семенов М.А, Сухоруков Б.И, Малеев В.Я, Шабарчина Л.И.// Биофизика. 1979.Т24. С.210-216
2. Малеев В.Я, Семенов M.A., Гасан А.И., Кашпур В.А.//Биофизика.1993.Т.38.С.768-790
3. Eisenhaber F., Tumanyan V.U. and Abagyan R.A.//Biopolymers. 1990. V.30,p.563-578
4. Теплухин A.B., Журкин В.Б, Джерниган Р., Полтев В.И.// Мол.биология. 1996. Т.ЗО.С.121-135
5. Данилов В.И., Желтовский Н.В., Слюсарчук О.Н, Альдерфер Дж.Л.// Биополимеры и клетка.- 1997. - Т.13.№1. - С.46-54
6. Semenov М. А., Bolbukh T.V. and Maleev V.Ya.//J.MoI.Struct. 1997.408/409,p.213-217
7. Семенов М. А, Больбух Т.В, Малеев В.Я.// Биофизика. 1985.Т.30.С.571-577
8. Семенов М.А, Малеев В.Я, Березняк Е.Г, Гасан А.И, Больбух Т.В.// Мол.биология. 1991.Т.25.С.1626-1634
9. Семенов М. А, Матвеев ДА, Больбух Т.В, Малеев В.Я.// Биофизика. 1994.Т.39.С.628-636
10. Семенов М.А, Больбух Т.В, Гасан А.И, Малеев В.Я.//Биофизика. 1996.Т.41 .С. 1007-1015
11. Семенов М.А, Гасан А.И, Больбух Т.В, Малеев В.Я.//Биофизика. 1997.Т.42.С.591-598
12. Bolbukh T.V, Starikov Е.В. and Semenov М.А.// Studia Biophysika. 1985.V. 108,p. 199-207
13.Gasan A.I, Maleev V.Ya. and Semenov M.A.// Studia Biophysika. 1990.V. 130.p. 171-178
14. Arnott S, Chandrasekaran R, Hall I.H. and |Pnigjaner L.C.// Nucleic Res.1983.V.11, p.4141-4155
15. Skuratovskii I.Ya. Instituto Jun March de Estudious e Investigasiones, Centro de Reuniones
Internationales Sobre Biología, Madrid, p.91 (1991)
16. Chuprina V.P.// Nucl.As.Res.1987.V.15,p.293-305
17. Lu K.C, Prohofsky E.W. and Zandt V.// Biopolymers. 1977.V. 16,p.2491 -2505
18. Alexeev D.G., Lipanov A.A. and Skuratovskii I.Ya.// Nature. 1987.V.325,p.821 -823
19. Park H, Arnott S, Chandrasekaran R. and Millane R.P.//J.Mol.Biol,1987.V.325,p.513-523
20.Semenov M.A. and Bolbukh T.V.// Studia Biophysika. 1984.V. 102,p,215-220
21.Иогансен A.B, Розенберг М.Ш. //Опт. спектрос. 1978. Т.44. С.87-92
22.Семенов M.A. Дисс.докт.физ.-мат.наук, M. МГУ, 1990
23.Bolbukh T.V, Semenov M.A, Starikov E.B. and Maleev V.Ya. Proc.Third European Conference on Spectr.Biol.Mol., Boogna, Italy, р.185-188(1989)
24.Saenger W, Hunter W.N. and Kennard O.// Nature. 1986. V.324, p.385-388
25. Семенов M.A, Малеев В.Я.// Биофизика. 1986.T.31. C.764-767
26.Neumann E. and Ackermann Th.// J.Phys. Chem. 1969. V.73, p.2170-2172
27. Хинц Г.И. Биохимическая термодинамика, под ред. М. Джоунс. М. Мир, 1982. 440 с
28. Зайцев М.А, Филимонов В.В.//Биофизика. 1990. Т.35. С.53-57
29.Klump Н. and Ackermann T.//Biopolymers. 1971 V. 10, р. 513-522
30. Андроникашвили А. Л, Мгеладзе Г.Н, Меноселидзе Д.Р. 6-я Всесоюзная конференция по
калориметрии. Тбилиси. 1973.С.496-500
31. Сухоруков Б.И, Семенов М.А, Малеев В.Я, Шабарчина Л.И.// Биофизика. 1979. Т.24. С.611-619
32. Семенов М.А, Сухоруков Б.И, Малеев В.Я, Шабарчина Л.И.// Биофизика. 1979.Т24. С.210-216
Cited
How to Cite
Bereznyak, E. G., Semenov, M. A., & Bolbukh, T. V. (1). HYDRATION AND STABILITY OF NUCLEIC ACIDS WITH DIFFERENT AT- AND GC - COMPOSITION IN CONDENSED STATE. Biophysical Bulletin, 1(1). Retrieved from https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/1618
Section
Molecular biophysics
Authors who publish with this journal agree to the following terms:
- Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.
- Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.
- Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
