Адаптивні властивості виділених в Україні вірусів грипу в умовах обмеженого використання противірусних препаратів
Анотація
Важливою проблемою залишається адаптація вірусів грипу до противірусних препаратів, а саме до інгібіторів нейрамінідази. В роботі було досліджено наявність точкових мутацій у гені нейрамінідази вірусів грипу, виділених в Україні в епідемічні сезони 2011–2012 рр. та 2012–2013 рр. Для цього секвенували гени вірусів грипу та провели генотиповий аналіз. При дослідженні амінокислотних послідовностей нейрамінідази вірусів грипу типу А(H3N2) та А(H1N1)pdm не виявили замін у відповідних позиціях, що свідчить, що українські ізоляти є чутливими до озелтамівіру, занамівіру та перамівіру. У вірусів грипу типу В не виявлено замін у позиціях, асоційованих із резистентністю до NAI.
Завантаження
Посилання
Ахматуллина Н.Б., Саятов М.Х. Биология вируса гриппа человека и животных. – Алма-Ата: Гылым, 1991. – 192с. /Akhmatullina N.B., Sayatov M.X. Biologiya virusa gripa cheloveka і zhivotnykh. – Alma-Ata: Gilim, 1991. – 192s./
Бутвиловский А.В. Барковский Е.В., Бутвиловский В.Э. Базисные методы молекулярной эволюции: учеб.-метод. пособие. – Минск: БГМУ, 2006. – 36с. /Butvilovskiy A.V., Barkovskiy Ye.V., Butvilovskiy V.Ye. Bazisnyye metody moleculyarnoy evolyutsii. – Minsk: BGMU, 2006. – 36s./
Дзюблик І.В., Широбоков В.П. Грип та його профілактика. – К., 2005. – 194с. /Dzyublik I.V., Shyrobokov V.P. Gryp ta yogo profilaktyka. – K., 2005. – 194s./
Chidlow G.R., Harnett G.B., Williams S.H. et al. The detection of oseltamivir-resistant pandemic influenza A/H1N1 2009 viruses using a real-time RT-PCR assay // J. Virol. Methods. – 2010. – Vol.169. – Р. 47–51.
Deyde V.M, Gubareva L.V. Influenza genome analysis using pyrosequencing method: current applications for a moving target // Expert Rev. Mol. Diagn. – 2009. – Vol.9. – P. 493–509.
Deyde V.M., Xu X., Bright R.A. et al. Surveillance of resistance to adamantanes among influenza A(H3N2) and A(H1N1) viruses isolated worldwide // J. Infect. Dis. – 2007. – Vol.196. – Р. 249–257.
European Centre for Disease Prevention and Control. Influenza virus characterisation Summary Europe, March 2012 http://ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/1204-TED-CNRL-report.pdf
European Centre for Disease Prevention and Control. Surveillance report. Influenza overview week 22/2012. http://ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/Forms/ECDC_DispForm.aspx?ID=899
Fauquet C.M., Mayo M.A., Maniloff J. et al. Virus Taxonomy VIIIth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses // Elsevier Academic Press. – 2005. – P.1162.
Jianpeng Xu, Davis C.T., Christman M.C. et al. Evolutionary history and phylodynamics of influenza A and B neuraminidase (NA) genes inferred from large-scale sequence analyses // PLoS One. – 2012. – Vol.7. – Issue 7:e38665. – P. 1–15. http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0038665
Lackenby A., Hungnes O., Dudman S.G. et al. Emergence of resistance to oseltamivir among influenza A(H1N1) viruses in Europe // EuroSurveill. – 2010. – Vol.15. – P. 1–3.
Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0 // Mol Biol Evol. – 2007. – Vol.24. – P. 1596–1599.
The Francis Crick institute. Advanced Sequencing. http://www.crick.ac.uk/research/science-technology-platforms/advanced-sequencing/
WHO. CDC protocol of real-time RT-PCR for swine influenza A(H1N1) revision 1. April 2009. http://www.who.int/csr/ resources/publications/swineflu/realtimeptpcr/en/index.html.
WHO influenza centre, London. Summary of NIMR results, 23–25 September 2013. http://www.crick.ac.uk/media/221859/nimr-report-sep2013final.pdf
Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої її публікації на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License 4.0 International (CC BY 4.0), яка дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи.
