Електростатичний вклад в енергію комплексоутворення ароматичних антипухлинних антибіотиків з ДНК

Автор(и)

  • V. V. Kostjukov Севастопольський національний технічний університет image/svg+xml Автор
  • N. M. Khomutova Севастопольський національний технічний університет image/svg+xml Автор
  • M. P. Evstigneev Севастопольський національний технічний університет image/svg+xml Автор

Ключові слова:

ароматичні антипухлинні антибіотики, електростатичний внесок в енергію комплексоутворення, нелінійне рівняння Пуассона-Больцмана

Анотація

Проведено дослідження електростатичних взаємодій при комплексоутвореннї  актино-мицину D, дауноміцину, новангрона і ногаламіцина з олігонуклеотидними  дуплексами, які містять  від 4 до 16 пар основ. Виконано  аналіз основних складових електростатичної енергії. Вивчено вплив довжини подвійної спіралі ДНК на енергію електростатичних взаємодій. Показано, що результати розрахунків для дуплексів ДНК з 8 і більше парами підстав добре узгоджуються між собою. Встановлено кореляцію між змінами значень кута спірального обертання і електростатичних взаємодій при інтеркаляційному  розкручуванні  сайту вбудовування, а також подібне для всіх антибіотиків зміна електростатичної енергії взаємодій в дуплексі ДНК. У той же час, міжмолекулярні електростатичні взаємодії нейтральних молекул актиноміцину D і новантрону з олигомерами ДНК значно відрізняються від таких для зв'язування з ДНК позитивно заряджених дауноміцину і ногаламіцину. Показано, що, в цілому, електростатичні взаємодії перешкоджають комплексоутворенню  всіх чотирьох розглянутих антипухлинних антибіотиків з ДНК.

Завантажити

Дані для завантаження поки недоступні.

Біографії авторів

  • автор V. V. Kostjukov, афіліація Севастопольський національний технічний університет

    99053, Севастополь, Україна

  • автор N. M. Khomutova, афіліація Севастопольський національний технічний університет

    99053, Севастополь, Україна

  • автор M. P. Evstigneev, афіліація Севастопольський національний технічний університет

    99053, Севастополь, Україна

Завантаження

Опубліковано

2008-06-03

Номер

Розділ

Молекулярна біофізика

Статті цього автора (цих авторів), які найбільше читають