Енергія взаємодії ланцюгів ДНК в промоторах Е. Coli у зв”язку з їх функціональною активністю
Ключові слова:
промотори, ефективність промоторів, нуклеотідний склад, енергія взаємодії ланцюгів ДНК, фізичні властивості промоторівАнотація
Проведено розрахунки енергії взаємодії між комплементарними нуклеотидами в промоторі. Нами були розроблені методи графічного відображення енергетичних властивостей промоторів. З отриманих данних видно, що розподіл енергії по всій довжині промотора має 3 мінімуму з центрами на позиціях -35, -8 і +7 нуклеотидів щодо стартової ділянки транскрипції. Найбільш важлива і відрізняється від випадкової послідовності область промотора лежить на позиції -8 щодо стартової ділянки транскрипції. У блоці Прібнова і в -35 послідовності були виділені 4 групи промоторів з різними енергетичними властивостями. У блоці Прібнова для середніх показників в групі виявлена негативна кореляція між енергією взаємодії ланцюгів ДНК і активністю (силою) промотора і позитивна кореляція між цими показниками в -35 послідовності.
Завантажити
Завантаження
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
