Особливості первинної структури червоних флуоресцентних білків, що змінюють спектри флуоресценції з часом

Автор(и)

  • F. V. Subach Медичний коледж ім. А.Ейнштейна Автор
  • K. S. Morozova Медичний коледж ім. А.Ейнштейна Автор
  • O. M. Subach Медичний коледж ім. А.Ейнштейна Автор
  • V. V. Verkhusha Медичний коледж ім. А.Ейнштейна Автор
  • N. I. Bulankina Харківський національний університет ім. В.Н. Каразіна Автор
  • M. V. Goenaga Харківський національний університет ім. В.Н. Каразіна Автор

Ключові слова:

флуоресцентний білок, мутагенез, хромофор, флуоресценція

Анотація

За допомогою направленого сайт-специфічного та випадкового мутагенезу мономірного червоного флуоресцентного білка mCherry було створено три мутантних білка, названних флуоресцентними таймерами (ФТ), які, на відміну від вихідного білка, змінюють з часом флуоресценцію з блакитної на червону, та визначені їх первинні структури. Вилучені мутантні білки відрізняються один від одного швидкостями зміни спектрів флуоресценції - великою (ВФТ), середньою (СФТ) та малою (МФТ). У порівнянні з вихідним mCherry ВФТ має 5 амінокислотних заміщень. Серед них заміщення Ліз→Aрг, Лей→Tрп, Aлa→Сер в позиціях 69, 84 и 224 знаходяться в середині білкової молекули, а Глу→Ліз, Сер→Tре в позициях 34 та 151 - на її зовнішній поверхні В амінокислотній послідовності СФТ знайдено 9 заміщень. Ліз→Aрг, Лей→Tpп, Meт→Iлей, Лей→Meт в позиціях 69, 84, 152 і 205 - внутрішні, а Aсн→Aсп, Tре→Сер, Глн→Ліз, Тир→Цис, Aрг→Гіс в позиціях 23, 43, 194, 221 і 227- зовнішні. МФТ має тільки 4
мутації, з яких три: Ліз→Aрг, Лей→Tрп, Aлa→Вал в позиціях 69, 84 та 179 знаходяться у внутрішньому просторі молекули і одна, в позиції 30, Глу→Вал – на ії поверхні. Розглянута структурная роль знайдених зовнішніх та внутрішнніх амінокислотних заміщень у формуваннні флуоресцентних особливостей ВФТ, СФТ і МФТ, які відрізняють їх як від mCherry, так і один від одного.

Завантажити

Дані для завантаження поки недоступні.

Біографії авторів

  • автор F. V. Subach, афіліація Медичний коледж ім. А.Ейнштейна

    1300 Моррис Парк авеню, Нью-Йорк, 10461, США

    vverkhus@aecom.yu.edu

  • автор K. S. Morozova, афіліація Медичний коледж ім. А.Ейнштейна

    1300 Морріс Парк авеню, Нью-Йорк, 10461, США

    epersky@list.ru

  • автор O. M. Subach, афіліація Медичний коледж ім. А.Ейнштейна

    1300 Морріс Парк авеню, Нью-Йорк, 10461, США

    vverkhus@aecom.yu.edu

  • автор V. V. Verkhusha, афіліація Медичний коледж ім. А.Ейнштейна

    1300 Морріс Парк авеню, Нью-Йорк, 10461, США

    vverkhus@aecom.yu.edu

  • автор N. I. Bulankina, афіліація Харківський національний університет ім. В.Н. Каразіна

    майдан Свободи 4, Харків, 61077, Україна

    epersky@list.ru

  • автор M. V. Goenaga, афіліація Харківський національний університет ім. В.Н. Каразіна

    майдан Свободи 4, Харків, 61077, Україна

    vverkhus@aecom.yu.edu, epersky@list.ru

Завантаження

Опубліковано

2009-06-05

Номер

Розділ

Молекулярна біофізика

Статті цього автора (цих авторів), які найбільше читають