Застосування агрегатів ціанінових барвників для детекції нуклеїнових кислот

Автор(и)

  • G. Ya. Guralchuk Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України Автор
  • R. S. Grinev Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України Автор
  • I. K. Katrunov Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України Автор
  • A. V. Sorokin Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України Автор
  • S. L. Efimova Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України Автор
  • Yu. V. Malyukin Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України Автор
  • S. M. Yarmolyuk Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Автор

Ключові слова:

нуклеїнові кислоти, бороздкове зв'язування, J -агрегати, ціанінові барвники, флуоресцентні зонди

Анотація

За допомогою методів оптичної спектроскопії були досліджені особливості агрегації ціанінового барвника 3,3'-dimethyl-9-(2-thienyl)-thiacarbocyanine iodide (Cyan-βTh) в бінарному розчині ДМФА: водний буфер TRIS-HCl buffer (pH= 8) в присутності нуклеїнових кислот (ДНК і РНК). ). Було виявлено, що агрегати барвника взаємодіють з ДНК за типом бороздкового зв'язування, при цьому спектри поглинання і люмінесценції агрегатів мають складну структуру. Запропоновано «блокова» модель агрегації барвника Cyan-βTh на нуклеїнових кислотах, при цьому основним блоком є ​​димери барвника. Отримано криві загасання люмінесценції агрегатів і мономерів барвника, що підтверджують запропоновану модель. Смуги поглинання і люмінесценції агрегатів Cyan-βTh в присутності ДНК значно відрізняються від таких в присутності РНК, що дозволяє запропонувати даний барвник у якості специфічного флуоресцентного зонда для детекції НК.

Завантажити

Дані для завантаження поки недоступні.

Біографії авторів

  • автор G. Ya. Guralchuk, афіліація Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України

    пр. Леніна 60 , 61001 Харків, Україна

  • автор R. S. Grinev, афіліація Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України

    пр. Леніна 60 , 61001 Харків, Україна

  • автор I. K. Katrunov, афіліація Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України

    пр. Леніна 60 , 61001 Харків, Україна

  • автор A. V. Sorokin, афіліація Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України

    пр. Леніна 60 , 61001 Харків, Україна

  • автор S. L. Efimova, афіліація Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України

    пр. Леніна 60 , 61001 Харків, Україна

  • автор Yu. V. Malyukin, афіліація Інститут сцинтиляційних матеріалів НАН України

    пр. Леніна 60 , 61001 Харків, Україна

  • автор S. M. Yarmolyuk, афіліація Інститут молекулярної біології і генетики НАН України

    вул. Заболотного 150, 03143,  Київ. Україна

Завантаження

Опубліковано

2007-06-05

Номер

Розділ

Методи біофізичних досліджень

Статті цього автора (цих авторів), які найбільше читають