Конкуренція двох типів зв’язування акрихіну з днк за даними поляризованої флуоресценції

Автор(и)

  • I. М. Voloshin Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України Автор
  • О. А. Ryazanova Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України Автор
  • V. N. Zozulya Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України Автор

Ключові слова:

акрихін, ДНК, зовнішнє зв’язування, інтеркаляція, кооперативне зв’язування, флуоресценція, поглинання

Анотація

Методами абсорбційної і поляризованої флуоресцентної спектроскопії досліджено зв’язування
акридинового барвника акрихіну (АХ) з ДНК із еритроцитів курчат. Виміри виконано у водних
буферних розчинах (pH 6,9) за умов різних концентрацій барвника ([АХ] = 10-6÷ 10-4 М) і іонної сили розчинів ([Na] = 10-3 ÷ 0.15 М) у широкому діапазоні співвідношень молярних концентрацій фосфатів і барвника (P/D). Встановлено, що мінімум на кривих флуоресцентного титрування, які характеризують залежність інтенсивності флуоресценції від P/D, є обумовленим конкуренцією двох типів зв’язування АХ з ДНК, що мають різні параметри випромінювання: (1) інтеркаляційного, який є домінуючим при високих P/D, і (2) зовнішнього електростатичного, яке домінує при низьких P/D і супроводжується утворенням нефлуоресціюючих асоциатів барвника на цукровофосфатному хребті ДНК. Встановлено абсорбційні і флуоресцентні характеристики цих комплексів. Наведено методику розрахунку внесків різних типів зв’язування у комплексоутворення в залежності від P/D. Показано, що у випадку електростатичної взваємодії розмір місця зв’язування в парах основ ДНК, які припадають на одну молекулу АХ, є у 8 разів меншим, ніж при інтеркаляції, що дозволяє зовнішньому зв’язуванню успішно конкурувати з більш сильним інтеркаляційним типом взаємодії.               

Завантажити

Дані для завантаження поки недоступні.

Біографії авторів

  • автор I. М. Voloshin, афіліація Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України

    пр. Леніна 47, 61103, Харків, e-mail: voloshin@ilt.kharkov.ua

  • автор О. А. Ryazanova, афіліація Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України

    пр. Леніна 47, 61103, Харків, e-mail: voloshin@ilt.kharkov.ua

  • автор V. N. Zozulya, афіліація Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України

    пр. Леніна 47, 61103, Харків, e-mail: voloshin@ilt.kharkov.ua

Завантаження

Номер

Розділ

Молекулярна біофізика

Статті цього автора (цих авторів), які найбільше читають