Вплив бокових груп фенантридінових барвників на гетероасоціацію з антибіотиком дауноміцином та конкурентне зв'язування лігандів з олігомером ДНК
Ключові слова:
Фенантридіни, Азидо-аналогі, Дауноміцин, ЯМР спектроскопія, Гетероасоціація, Конкурентне зв'язування з ДНКАнотація
Методом 'H ЯМР спектроскопії досліджено гетероасоціацію фенантридінових барвників, вміщуючих різик групи у бокових ланцюгах хромофору, з антрацикліновим антибіотиком дауноміцином (DAU) та їх конкурентне зв'язування з олігомером ДНК 5'-d(TpGpCpA). При послідовному заміщенні 3,8 аміно-груп на азидо-групи спостерігається зменшення значень параметрів гетероасоціації азидо-аналогів бромистого етідію (ЕВ) - моноазиду (ЕМВ) и діазиду (EDC) етідія з DAU, що свідчить про зниження імовірності утворення міжмолекулярного водневого зв'язку між аміно-групами фенантридінового хромофора та 9МеСО групою DAU. Аналіз показав, що рівноважні процеси само асоціації, гетероасоціації та комплексоутворення лігандів з ДНК залежать від співвідношення концентрацій компонентів у змішаному розчині. Для встановлення молекулярного механізму комплексоутворення молекул в багатокомпонентному розчині, вміщуючому мутагени, ароматичні антибіотики і фрагменти ДНК, необхідно враховувати не тільки гетероасоціацію ароматичних молекул, але і конкуренцію між антибіотиком і мутагеном за місця посадки на олігонуклеотидну послідовність.
Завантажити
Посилання
Gale E.F., Cundliffe E, Reynolds P.E., Richmond M.H., Waring M.J. // The molecular basis London. 1981.500p.
Graves D.E., Velea L.M. // Current Org. Chem. 2000. V.4. P. 915-929.
Davies D.B., Veselkov D.A., Kodintsev V.V., Evstigneev M.P., Veselkov A.N. // Mol. Physics. 1971.
Davies D.B., Veselkov D.A., Djimant L.N.,Veselkov A.N. // Eur. Biophys. .J. 2001. V.30. P.354-366
Adel A.L., Dorr R.T., Liddil J.D. //Cancer Invest. 1993. V.11. P. 15-24.
Larsen R.W., Jasuja R., Hetzler R., Muraoka P.T., Andrada V.G., Jameson D.M. // Biophys.1994
Graves D.E.,.Watkins C.L., Yielding L.W.//Biochemistry 1981. V.20. P. 1887-1892.
Laugaa P., Delbarre A.. Le Pecq J-B.. Roques B.P. // Eur.J.Biochem. 1983. V.134. P.163-173
Feigon .J., W.Leupin., W.A.Denny and D.R.Kearns. //Nucl. Acids Res. 1982. V.10. P.749-761
Davies D.B., Djimant L.N., Veselkov A.N. // J. Chem. Soc. Faraday Trans. 1996. V.92. P 383-390
Veselkov A.N.. Lantushenko A.O.. Veselkov D.A., Davies D.B. // J. Struct. Chem. 2002.
V 43
Bresloff J.L., Crothers D.M. // Biochemistry. 1981. V.20. P. 3547-3553.
Graves D.E., Yielding L.W., Watkins C.L., Yielding K..L. // Biochim. Biophys. Acta. 1977. V 479. P. 98-104.
Huang Y.M., Phillips D R // Biophys. Chem. 1977 , V.6. P. 363-368.
Chaires J.B., Dattagupta N., Crothers D.M. // Biochemistry. 1982. V.21. P. 3927-3932.
Davies D.B., Veselkov D A., Veselkov A.N. //Mol.Physics. 1999. V.97. P. 439-451.
Davies D.B., Eaton R.J., Baranovsky S.F., Veselkov A.N. // J. Biomol. Str. Dyn. 2000 V.17
P 887-901.
Davies D.B., Veselkov D.A., Veselkov A.N.// Eur. Biophys. J. 2002. V.31, P. 153-162.
Giessner-Prettre C., Pullman B. // Quart. Rev. Biophys. 1987. V.20. P. l13-172
Davies D.B., Karawajew L., Veselkov A.N. // Biopolymers. 1996. V.38. P. 745-757.
Veselkov A.N., Evstigneev M.P., Veselkov D.A., Djimant L.N., Davies D.B // Biophys. Bull. Kharkov Univ , V.525. № 1(8). P. 18-26.
Ross P.D., Subramanian S. // Biochemstry 1981. V.20 P.3096-3102.
Завантаження
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).