Вплив бокових груп фенантридінових барвників на гетероасоціацію з антибіотиком дауноміцином та конкурентне зв'язування лігандів з олігомером ДНК

Автор(и)

  • О. Н. Веселков Кафедра фізики Севастопільського національного технічного університету Автор
  • А.О.Лантушенко Кафедра фізики Севастопільського національного технічного університету Автор
  • Сантьяго А. Єрнандес Департамент фізики і математики, університет м. Пуебла Автор
  • Д.Б.Девіс Департамент химії Беркбек коледжу Лондонського університету Автор

Ключові слова:

Фенантридіни, Азидо-аналогі, Дауноміцин, ЯМР спектроскопія, Гетероасоціація, Конкурентне зв'язування з ДНК

Анотація

Методом 'H ЯМР спектроскопії досліджено гетероасоціацію фенантридінових барвників, вміщуючих різик групи у бокових ланцюгах хромофору, з антрацикліновим антибіотиком дауноміцином (DAU) та їх конкурентне зв'язування з олігомером  ДНК 5'-d(TpGpCpA). При послідовному заміщенні 3,8 аміно-груп на азидо-групи спостерігається зменшення значень параметрів гетероасоціації азидо-аналогів бромистого етідію (ЕВ) - моноазиду (ЕМВ) и діазиду (EDC) етідія з DAU, що свідчить про зниження імовірності утворення міжмолекулярного водневого зв'язку між аміно-групами фенантридінового хромофора та 9МеСО групою DAU. Аналіз показав, що рівноважні процеси само асоціації, гетероасоціації та комплексоутворення лігандів з ДНК залежать від співвідношення концентрацій компонентів у змішаному розчині. Для встановлення молекулярного механізму комплексоутворення молекул в багатокомпонентному розчині, вміщуючому мутагени, ароматичні антибіотики і фрагменти ДНК, необхідно враховувати не тільки гетероасоціацію ароматичних молекул, але і конкуренцію між антибіотиком і мутагеном за місця посадки на олігонуклеотидну послідовність.

Завантажити

Дані для завантаження поки недоступні.

Біографії авторів

  • автор О. Н. Веселков, афіліація Кафедра фізики Севастопільського національного технічного університету

    Севастополь, 99053, Крим, Україна

  • автор А.О.Лантушенко, афіліація Кафедра фізики Севастопільського національного технічного університету

    Севастополь, 99053, Крим, Україна

  • автор Сантьяго А. Єрнандес, афіліація Департамент фізики і математики, університет м. Пуебла

    м. Пуебла. 72570, Мексика

  • автор Д.Б.Девіс , афіліація Департамент химії Беркбек коледжу Лондонського університету

    Лондон WCIH OOP, Великобританія

Посилання

Gale E.F., Cundliffe E, Reynolds P.E., Richmond M.H., Waring M.J. // The molecular basis London. 1981.500p.

Graves D.E., Velea L.M. // Current Org. Chem. 2000. V.4. P. 915-929.

Davies D.B., Veselkov D.A., Kodintsev V.V., Evstigneev M.P., Veselkov A.N. // Mol. Physics. 1971.

Davies D.B., Veselkov D.A., Djimant L.N.,Veselkov A.N. // Eur. Biophys. .J. 2001. V.30. P.354-366

Adel A.L., Dorr R.T., Liddil J.D. //Cancer Invest. 1993. V.11. P. 15-24.

Larsen R.W., Jasuja R., Hetzler R., Muraoka P.T., Andrada V.G., Jameson D.M. // Biophys.1994

Graves D.E.,.Watkins C.L., Yielding L.W.//Biochemistry 1981. V.20. P. 1887-1892.

Laugaa P., Delbarre A.. Le Pecq J-B.. Roques B.P. // Eur.J.Biochem. 1983. V.134. P.163-173

Feigon .J., W.Leupin., W.A.Denny and D.R.Kearns. //Nucl. Acids Res. 1982. V.10. P.749-761

Davies D.B., Djimant L.N., Veselkov A.N. // J. Chem. Soc. Faraday Trans. 1996. V.92. P 383-390

Veselkov A.N.. Lantushenko A.O.. Veselkov D.A., Davies D.B. // J. Struct. Chem. 2002.

V 43

Bresloff J.L., Crothers D.M. // Biochemistry. 1981. V.20. P. 3547-3553.

Graves D.E., Yielding L.W., Watkins C.L., Yielding K..L. // Biochim. Biophys. Acta. 1977. V 479. P. 98-104.

Huang Y.M., Phillips D R // Biophys. Chem. 1977 , V.6. P. 363-368.

Chaires J.B., Dattagupta N., Crothers D.M. // Biochemistry. 1982. V.21. P. 3927-3932.

Davies D.B., Veselkov D A., Veselkov A.N. //Mol.Physics. 1999. V.97. P. 439-451.

Davies D.B., Eaton R.J., Baranovsky S.F., Veselkov A.N. // J. Biomol. Str. Dyn. 2000 V.17

P 887-901.

Davies D.B., Veselkov D.A., Veselkov A.N.// Eur. Biophys. J. 2002. V.31, P. 153-162.

Giessner-Prettre C., Pullman B. // Quart. Rev. Biophys. 1987. V.20. P. l13-172

Davies D.B., Karawajew L., Veselkov A.N. // Biopolymers. 1996. V.38. P. 745-757.

Veselkov A.N., Evstigneev M.P., Veselkov D.A., Djimant L.N., Davies D.B // Biophys. Bull. Kharkov Univ , V.525. № 1(8). P. 18-26.

Ross P.D., Subramanian S. // Biochemstry 1981. V.20 P.3096-3102.

Завантаження

Опубліковано

2002-06-05

Номер

Розділ

Молекулярна біофізика

Як цитувати

Вплив бокових груп фенантридінових барвників на гетероасоціацію з антибіотиком дауноміцином та конкурентне зв’язування лігандів з олігомером ДНК. (2002). Біофізичний вісник, 2(11), 5-13. https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/18452