Аналіз тонкої CpG структури послідовностей ДНК

Автор(и)

Ключові слова:

метилювання ДНК, CpG сайти, метилцитозин, ізохори, гістонові білки, CG острівці, інтрон, екзон

Анотація

Запропоновано методи опису розподілу CpG сайтів у послідовностях ДНК за допомогою числових характеристик та графічно. Нормалізація кривої графіка на довжину послідовності дозволяє порівнювати послідовності за характером накопичення CpG і класифікувати їх на зразок накопичення, а не тільки за частотою зустрічальності. За допомогою введених числових характеристик та принципу подібності показано існування відмінностей у накопиченні CpG сайтів у ДНК генів організмів, що відрізняються за еволюційним станом та наявністю системи метилювання ДНК. Для видів, у яких метилювання ДНК не має регуляторного значення в процесах імпринтингу та клітинної пам'яті, характерний випадковий розподіл CpG сайтів.

Завантажити

Дані для завантаження поки недоступні.

Біографії авторів

  • автор Д. Р. Дуплій, афіліація Харківський національний університет імені В.Н. Каразіна

     пл. Свободи, 4, 61077, Харків , Україна

  • автор Ю. Г. Шкорбатов, афіліація Харківський національний університет імені В.Н. Каразіна

    пл. Свободи, 4, 61077, Харків , Україна

Завантаження

Опубліковано

2003-06-05

Номер

Розділ

Молекулярна біофізика