КОЛЕБАТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ УОТСОН-КРИКОВСКОЙ ПАРЫ АДЕНИН-УРАЦИЛ. НЕЭМПИРИЧЕСКОЕ КВАНТОВОХИМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ.

  • С. Г. Степаньян Физико- технический институт низких температур HAH Украины Харьков, пр. Ленина 47, 61164.

Abstract

Впервые проведены расчеты колебательных спектров Уотсон-Криковской пары аденин-урацил методом DFT/B3LYP/6-31++G** учитывающим эффекты электронной корреляции. Проведен полный анализ фундаментальных колебаний и определены силовые поля мономерных молекул и димера. Установлены спектральные проявления Н-связывания в паре аденин-урацил. Рассчитанные методами МР2 и DFT с расширенным базисным набором и с учетом поправок на энергию нулевых колебаний энергии образования пары A-U составляют -47.8 и —46.0 кДж/моль соответственно и находятся в хорошем согласии с экспериментом.

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: аденин-урацил, квантовохимические ab initio расчеты, колебательные спектры, молекулярные параметры.

Downloads

Download data is not yet available.

References

1. Радченко Е.Д., Плохотниченко A.M., Шеина Г.Г., Благой Ю.П. // Биофизика. 1984. Т. 29. С. 553.


2. Stepanian S.G., Sheina G.G., Radchenko E.D., Blagoi Yu.P. // J. Molec. Struct. 1985. V. 131. P. 333.


3. Sheina G.G., Radchenko E.D., Stepanian S.G., Blagoi Yu.P. // Studia Biophys. 1986. V. 114. P. 123.

4. Novak M.J., Lapinski L., Kwiatkowski J.S. // Chem. Phys. Lett. 1989. V. 157. P. 14.


5. Novak M.J., Lapinski L., Kwiatkowski J.S. et al. // Spectrochimica Acta. 1991. V. 47A, N 1. P. 87-103.

6. Радченко Е.Д., Плохотниченко A.M., Шеина Г.Г., Благой Ю.П. // Биофизика. 1983. Т. 28. С. 980.

7. Szczesniak М., Novak M.J., Rostkowska Н. et al. // J. Am. Chem. Soc. 1983. V. 105. P. 5969.

8. Chin S., Scott., Szczepaniak K., Person W.B. // J. Am. Chem. Soc. 1984. V. 106. P. 3415.

9 Barnes A.J., Stuckey M.A., Le Gall L. // Spectrochimica Acta. 1984. V, 40A. P. 419.

10. Graindourze M., Smets J., Zeegers-Huyskens Th., Maes G. // J. Molec. Struct. 1990. V. 222. P. 345.

11. Les A., Adamowicz L., Novak M.J., Lapinski L. // Spectrochimica Acta. 1992. V. 48A. P. 1385.

12. Novak M.J. // J. Molec. Struct. 1989. V. 193. P. 35-49.

13. Stepanian S.G., Smorygo N.A., Sheina G.G. et al. // Spectrochimica Acta. 1990. V. 46A, N 3. P. 355-361.

14. Шеина Г.Г., Радченко Е.Д., Благой Ю.П. // Докл. Акад. Наук СССР. 1985. Т. 282. С. 1497.

15. Sheina G.G., Stepanian S.G., Radchenko E.D., Blagoi Yu.P. // J. Molec. Struct. 1987. V. 158. P. 275.

16. Szczepaniak K., Szczesniak M. // J. Molec. Struct. 1987. V. 156. P. 294.

17. Radchenko E.D., Sheina G.G., Smorygo N.A., Blagoi Yu.P.// J. Molec. Struct. 1984. V. 116. P. 387-396.

18. Szczesniak M., Szczepaniak K., Kwiatkowski J.S. et al. // J. Am. Chem. Soc. 1988. V. 110, N 25. P. 8319-8330.

19. Nowak M.J., Lapinski L., Fulara J. // Spectrochimica Acta. 1989. V. 45A, N 2. P. 229-242.


20. MacCarthy W., Smets J., Adamowicz L. et al.//Molec. Phys. 1997. V. 91, N3. P. 513-525.


21. MacCarthy W., Plokhotnichenko A.M., Radchenko E.D. et al. // J. Phys. Chem. 1997. V. 101A. P. 7208-7216.


22. Plokhotnichenko A.M., Radchenko E.D., Stepanian S.G. et al. // Resent Res. Devel. In Phys. Chem. 1998. V. 2. P. 1087.

23. Komarov V.M. //J. Biol. Phys. 1999. V. 24. P. 167-184.

24. Sponer J., Leszczynski J., Hobza P. // J. Biomol. Struct. Dynamics. 1996. V. 14. P. 117-135.

25. Sponer J., Leszczynski J., Hobza P. // J. Phys. Chem. 1996. V. 100. P. 1965-1974.

26. Sponer J.. Hobza P. // Chem. Phys. 1996. V. 204. P. 365-372.

27. Sponer J, Florian J., Hobza P., Leszczynski J. //J. Biomol. Struct. Dynamics. 1996. V. 13. P. 827-833.

28. Gould I.R., Kollman P.A. // J. Am. Chem. Soc. 1994. V. 116. P. 2493-2499.

29. Komarov V.M. // Biophysics. 1994. V. 39, N 5. P. 863-868.

30. Becke A.D. // Phys. Pev. B. 1988. V. 38. P. 3098.

31. Lee C, Yang W., Parr R.G. // Phys. Rev. В. 1988. V. 37. P.785.

32. Vosko S.H. Wilk L., Nusair M. // Can. J. Phys. 1980. V. 58. P. 1200.

33. Stepanian S.G., Reva I.D.. Rosado M.T.S. et al. //J. Phys. Chem. 1998. V. 102A. P. 1041-1054.

34. Leszczynski J. // Int. J. Quant Chem.: Quant. Biol. Symp. 1992. V. 19. 43-45.

35. Sponer J., Hobza P. // J. Phys. Chem. 1994. V. 98. P. 3161-3164.

36. Stepanian S.G., Reva I.D., Radchenko E.D., Adamowicz L. //J. Phys. Chem. 1998. V. 102A. P. 4623-4629.

37. Stepanian S.G., Reva I.D., Radchenko E.D., Adamowicz L. // J. Phys. Chem. 1999. V. 103А. P. 4404-4412.

38. Binklye J.S., Pople J.A., // Int. J. Quant. Chem. 1975. V. 9. P.229.

39. Pople J.A, Binkley J.S., Seeger R. // Int J. Quant Chem.: Quant Chem. Symp. 1976. V. 10. P. 1.


40. Boys S.F., Bernardi F. // Molec. Phys. 1970. V. 19. P. 553.

41. Frisch M.J., Trucks G.W,, Schlegel H.B. et al. Gaussian 94, Revision E.2. Gaussian Inc. Pittsburgh, PA, 1994.

42. Говорун Д.Н., Мищук Я.Р.. Кондратюк И.В. // Доповіді HAH України. 1995. Т. 11. С. 121-123.

43. Yanson I.K., Teplitsky A.B., Sukhodub L.F. // Biopolymers. 1979. V. 18. P. 1149-1179.

44. Galetich I., Kosevich M., Shelkovsky V., Stepanian S.G. // J. Molec. Struct. 1999. V. 478. P. 155-162.
Cited
How to Cite
Степаньян, С. Г. (1). КОЛЕБАТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ УОТСОН-КРИКОВСКОЙ ПАРЫ АДЕНИН-УРАЦИЛ. НЕЭМПИРИЧЕСКОЕ КВАНТОВОХИМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ. Biophysical Bulletin, 3(5). Retrieved from https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/2457