Молекулярна ідентифікація чотирьох штамів Dunaliella з України за допомогою маркера ITS2

Анотація

Види роду Dunaliella є модельними об’єктами у фізіології водоростей і широко використовуються у фікотехнологіях для промислового виробництва біологічно активних сполук, зокрема каротиноїдів (передусім β-каротину). Надійна видова ідентифікація ускладнена через низьку морфологічну варіабельність і відсутність чітких видоспецифічних ознак у Dunaliella. Такі ознаки, як розмір клітин, форма та пігментація, значною мірою залежать від умов середовища, що часто призводить до помилкової ідентифікації в колекціях культур і ускладнює порівняльні та прикладні дослідження. Тому молекулярні підходи стали необхідними для точної видової ідентифікації. Водночас молекулярні дані щодо Dunaliella з території України залишаються обмеженими. Ділянка внутрішнього транскрибованого спейсера 2 (ITS2) є особливо інформативною, оскільки поєднує консервативні елементи вторинної структури з швидко еволюціонуючими первинними послідовностями. У цьому дослідженні проведено молекулярну ідентифікацію чотирьох штамів Dunaliella з колекції мікроводоростей гербарію Черняєва (Cherniaev Herbarium MicroAlgae Culture Collection, CWU-MACC) Харківського національного університету імені В.Н. Каразіна з використанням маркера ITS2. Визначення видової належності здійснювали на основі подібності послідовностей і філогенетичного аналізу. Серед чотирьох українських штамів лише CWU-MACC-15 відповідав D. salina, тоді як решта, включно з CWU-MACC-16, який раніше був ідентифікований як D. salina, були віднесені до D. viridis. Послідовності ITS2 штамів CWU-MACC-16 і CWU-MACC-20 були ідентичними, тоді як ізолят з Генічеського солоного озера демонстрував незначну варіацію ITS2 у межах D. viridis. Отримані результати створюють молекулярну основу для таксономії штамів Dunaliella з України та підкреслюють необхідність розширення вибірки штамів і використання додаткових молекулярних маркерів для кращого розкриття видового різноманіття та філогенетичних зв’язків.