In silico аналіз ефекту зв’язування гему на утворення комплексу аргініл-тРНК-протеїнтрансферази 1 і протеїну LIAT1 миші
Ключові слова:
зв’язування гему, аргініл-тРНК-протеїнтрансфераза, LIAT1 протеїн, 3D-моделювання, докінгАнотація
Ab initio передбачення структури аргініл-тРНК-протеїнтрансферази 1 (R-трансфераза, КФ 2.3.2.8) і протеїну LIAT1 миші було проведено за допомогою серверу I-Tasser. Молекулярний докінг протеїнових моделей виявив, що потенційні сайти зв’язування гему не співпадають з сайтами взаємодії з протеїнами-партнерами як у R-трансферази, так і у LIAT1 протеїну. Докінг гему до комплексу двох протеїнів показав, що протеїн LIAT1 надає сайти зв’язування, яким гем віддає перевагу у порівнянні з R-трансферазою. Приєднання гему до порожнин в корі R-трансферази, які задіяні у каталізі, та зміни конформації протеїну LIAT1 можуть явитись додатковими механізмами інгібуючої дії гему на аргінілювання білків.
Завантаження
Номер
Розділ
КОРОТКІ ПОВІДОМЛЕННЯ
Ліцензія
Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої її публікації на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License 4.0 International (CC BY 4.0), яка дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи.
Автори мають право укладати додаткові невиключні угоди щодо поширення опублікованої версії роботи (наприклад, розміщення в інституційних репозитаріях або публікація у збірниках) за умови зазначення її первинної публікації в цьому журналі.
Як цитувати
In silico аналіз ефекту зв’язування гему на утворення комплексу аргініл-тРНК-протеїнтрансферази 1 і протеїну LIAT1 миші. (2016). Вісник Харківського національного університету імені В. Н. Каразіна. Серія «Біологія», 26, 194-198. https://periodicals.karazin.ua/biology/article/view/6605
