Як отримати нуклеотидні послідовності ДНК з бази даних генетичного банку

Автор(и)

  • D. R. Duplij Інститут молекулярної біології і генетики image/svg+xml Автор
  • V. V. Kalashnikov Харківський національний економічний університет image/svg+xml Автор
  • N. A. Chashyn Інститут молекулярної біології і генетики image/svg+xml Автор

Ключові слова:

NCBI, локус, мРНК, нуклеотидні послідовності, інтрони, екзони

Анотація

Запропонований метод вилучення нуклеотидних послідовностей мРНК генів людини з даних
внутрішнього формату генетичного банку Національного центру біотехнологічної інформації США (NCBI [1]). Метод заснований на застосуванні регулярних виразів мови PERL на основі розширених нормальних форм Бэкуса-Науэра. Пропонований в роботі набір регулярних виразів, може бути використаний для аналізу послідовностей інших геномів, представлених у форматі "gbk" (Gene Bank flat format).

Завантажити

Дані для завантаження поки недоступні.

Біографії авторів

  • автор D. R. Duplij, афіліація Інститут молекулярної біології і генетики

    вул. Заболотного 150, Київ, duplijd@gmail.com

  • автор V. V. Kalashnikov, афіліація Харківський національний економічний університет

    ін. Ленина 9А, Харків 61001,

    hw@ksue.edu.ua

  • автор N. A. Chashyn, афіліація Інститут молекулярної біології і генетики

    вул. Заболотного 150, Київ, duplijd@gmail.com

Завантаження

Номер

Том 1 № 24 (2010): Біофізичний вісник

Розділ

Методи біофізичних досліджень

Ліцензія

Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:

  1. Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
  2. Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
  3. Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).

Як цитувати

Як отримати нуклеотидні послідовності ДНК з бази даних генетичного банку. (2010). Біофізичний вісник, 1(24). https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/4026

Статті цього автора (цих авторів), які найбільше читають