Порівняльний аналіз молекулярних механізмів релаксації вигибних деформацій ДНК
Ключові слова:
ДНК, молекулярна динаміка, білок-нуклеїнові взаємодії, структурні деформації, механізм релаксаціїАнотація
Порівняння механізмів релаксації вигибних деформацій ДНК було виконано методом молекулярної
динаміки для двох типів вигибів ДНК, а саме, з комплексу 434 репресору і пуринового репресору.
Було виконано порівняльний аналіз динаміки релаксації локальних структурних параметрів, які
характеризують структуру ДНК на рівні динуклеотидного контакту та параметрів, які описують
структуру ДНК в цілому. Отримані дані засвідчують, що релаксація проходить поетапно і кожний
етап характеризується однаковими часовими інтервалами для двох типів вигибу ДНК. Показано, що
характер релаксації на початкових стадіях динаміки залежить від типу вигибної деформації ДНК: для
плавного вигибу властива лінійна зміна параметрів; для різкого локалізованого вигибу зміна
параметрів відбувається стрибкоподібно.
Завантажити
Завантаження
Номер
Розділ
Ліцензія
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
