Наведена катіоним порфірином агрегація гібридів вуглецева нанотрубка-олігонуклеотид: вплив температури на стабільність гібрида

Автор(и)

  • E. S. Zarudnev Фiзико-технiчний інститут низьких температур iм. Б.I. Вєркiна, НАН України Автор
  • V. V. Karachevtsev Фiзико-технiчний інститут низьких температур iм. Б.I. Вєркiна, НАН України Автор

Ключові слова:

олігонуклеотид, вуглецева нанотрубка, порфірин, π-стекінг взаємодія, молекулярна динаміка

Анотація

Контрольована агрегація вуглецевих нанотрубок, покритих одноланцюговою ДНК, дає
можливість одержання ізольованих нанотрубок високої щільності у водній суспензії й сприяє
їхній інтеграції в багатофункціональні структури й пристрої. Методом молекулярної динаміки
виконане моделювання (протягом 30 нс при 300 К) системи, що складається із двох нанотрубок
(хіральність (10,0)) з накрученими олігонуклеотидами (rС)30 і з'єднаних 4 молекулами катіонного
порфірина TМРуР4. Продемонстрована стабільність гібрида у воднім середовищі. Підвищення
температури системи до 373 К і подальше моделювання протягом 10 нс не призвело до розпаду
агрегату із двох нанотрубок. При цьому відзначається поява нових контактів, що підсилюють
зв'язування трубок, як за рахунок зсуву полімерів з основної трубки на сусідню трубку, так і
завдяки прояву зв'язування двох олігомерів через стекінг дімери/тримери цитозинів різних
полімерів і воднево-зв'язаних димерів цитозинів, що належать двом полімерам. Відзначимо, що
порфірини, розташовані на трубці між двома витками, зміцнюють полімер і стримують його
зміщення з нанотрубки

Завантажити

Дані для завантаження поки недоступні.

Біографії авторів

  • автор E. S. Zarudnev, афіліація Фiзико-технiчний інститут низьких температур iм. Б.I. Вєркiна, НАН України

    пр. Леніна,47, Харків, 61103

  • автор V. V. Karachevtsev, афіліація Фiзико-технiчний інститут низьких температур iм. Б.I. Вєркiна, НАН України

    пр. Леніна,47, Харків, 61103

Завантаження

Номер

Розділ

Молекулярна біофізика

Як цитувати