2-й Науковий семінар для студентів «Обчислювальна фізика ДНК»
DOI:
https://doi.org/10.26565/2075-3810-2024-51-06Ключові слова:
ДНК, обчислювальна фізика, науковий семінарАнотація
Стаття присвячена 2-му Науковому семінару для студентів «Обчислювальна фізика ДНК».
Завантажити
Посилання
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Sergiy Perepelytsya "Molecular dynamics: from the problem of hard spheres to the DNA macromolecule" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/_F0zRspVZEA?feature=shared
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Francesca Mocci "Force fields and molecular dynamics simulations: Applications to nucleic acids" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/L16GBc8Pa48?feature=shared
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Sergey Volkov "Conformational mechanics of DNA" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/T70o7JYlE2s?si=YgwABVkZQxgusaMe
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Anna Shestopalova "Computational methods of structural bioinformatics in studies of the indirect mechanism of protein-nucleic recognition" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/_Hx0Ju0JlwE?si=7pp35Lx6mYFNw7Rg
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Anna Shestopalova "Сomputer simulations of DNA-ligand intercalation complexes: some special features" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/9XNVgkQjHCw?si=QlEvsy1fFrz6DuYX
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Oleksii Zdorevskyi "Hybrid quantum-mechanics/molecular mechanics (QM/MM) simulation methods and their applications to studying charge transfer processes in redox proteins" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/-8W9uTPJu8U?si=IF_AYx_fwb_j-ubQ
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Tudor Vasiliu "Using ChatGpt in molecular dynamics simulations: Applications to nucleic acids" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/0szW_eLOyDU?si=B9Isyxj8KGNSKYbU
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Kęstutis Aidas "Modelling NMR properties of complex molecular materials ..." [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/VfYs8zzbRR8?si=wKByN_STNOsSRSZi
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Tetiana Bubon: Specific effects of alkali metal ions on the vibrational dynamics of DNA ion-hydration [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/ktS__VNjtXM?si=JX696Tb3jDJM3Hbe
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Tetiana Bubon: "Practical Lesson 1: Getting started with GROMACS and VMD program packages" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/Kx8LvsipRQs?si=bDC6THIy8XAtNWle
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Tetiana Bubon "Practical Lesson 2: MD simulations of the DNA double helix with GROMACS" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/GmqJZqdVA9E?si=5tXP9mcw56aBo4g6
Bogolyubov Institute for Theoretical Physics. Tetiana Bubon "Practical Lesson 3: Analyzing MD trajectories of DNA using GROMACS and VMD" [video on the Internet]. 2024 May 26. Available from: https://youtu.be/YZb0hmgmCFY?si=USm--arrWuk954h4
Завантаження
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
