Скільки конформерів має молекула метилдигідрофосфату? Детальне квантово-механічне дослідження
Ключові слова:
конформаційний аналіз, фосфатна група, ДНК, ab initio розрахунки, базисний набірАнотація
Методами обчислювальної квантової механіки одержано і охарактеризовано усі стійкі конформери молекули метилдигідрофосфату (МДФ) — моделі фосфатної групи нуклеотидів, структурних ланок нуклеїнових кислот. Виявлено 4 пари дзеркально-симетричних конформерів молекули МДФ, відносні енергії Гіббса яких у газовій фазі лежать у межах 0,0 ÷ 1,3 ккал/моль.Проаналізовано вплив базисного набору на значення електронних енергій, одержуваних методом теорії збурень Моллера-Плессета 2-го порядку і показано важливість включення у базисний набір функцій, що описують високі орбітальні моменти. Виявлено подібність п’яти із восьми конформації ізольованої молекули МДФ до конформацій фосфатної групи A,B і Z форм ДНК.
Завантажити
Завантаження
Номер
Розділ
Ліцензія
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
