Interspecies and intraspecific molecular genetic variability and differentiation in speckled ground squirrels Spermophilus suslicus and S. odessanus (Rodentia, Sciuridae, Marmotini)
Abstract
Nucleotide sequences of the control region of mitochondrial DNA of 28 individuals of 2 species of speckled ground squirrels from 12 localities from Ukraine, Russia and Poland, as well as material from GenBank NCBI were studied. The differences between the 36- and 34-chromosome speckled ground squirrels by nucleotide substitutions was 4,4±0,5 %. Phylogenetic tree reflects the separation of chromosomal forms and intraspecific geographic differentiation. The role of the Dnieper in isolation of western and eastern forms of speckled ground squirrel in the early Holocene and the impact of hydro-geographic barriers in forming of their intraspecific variability were confirmed. Boundaries of three subspecies of S. suslicus were outlined. The existence of two genetically differentiated forms of S. odessanus in the Dnieper-Bug interfluve was shown.
Downloads
References
Власов А., Брандлер О. Крапчатый суслик исчез в Курской области? // Степной бюллетень. – 2011. – №33. – С.35. /Vlasov A., Brandler O. Krapchatyy suslik ischez v Kurskoy oblasti? // Stepnoy byulleten'. – 2011. – №33. – S. 35./
Громов И.М., Бибиков Д.И., Калабухов Н.И. и др. Фауна СССР. Млекопитающие. Т.3, В.2. – М.–Л.: Наука, 1965. – 453с. /Gromov I.M., Bibikov D.I., Kalabukhov N.I. i dr. Fauna SSSR. Mlekopitayushchiye. T.3, V.2. – M.–L.: Nauka, 1965. – 453s./
Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. – СПб, 1995. – 522с. /Gromov I.M., Yerbayeva M.A. Mlekopitayushchiye fauny Rossii i sopredel'nykh territoriy. Zaytseobraznyye i gryzuny. – SPb, 1995. – 522s./
Ермаков О.А., Сурин В.Л., Титов С.В. и др. Изучение гибридизации четырех видов сусликов (Spermophilus: Rodentia, Sciuridae) молекулярно-генетическими методами // Генетика. – 2002. – Т.38, №7. – С. 950–964. /Yermakov O.A., Surin V.L., Titov S.V. i dr. Izucheniye gibridizatsii chetyrekh vidov suslikov (Spermophilus: Rodentia, Sciuridae) molekulyarno-geneticheskimi metodami // Genetika. – 2002. – T.38, №7. – S. 950–964./
Ермаков О.А., Сурин В.Л., Титов С.В. Генетическая изменчивость и дифференциация крапчатого суслика по данным секвенирования контрольного региона мтДНК // Известия ПГПУ им. В.Г.Белинского. – 2011. – №25. – С. 176–180. /Yermakov O.A., Surin V.L., Titov S.V. Geneticheskaya izmenchivost' i differentsiatsiya krapchatogo suslika po dannym sekvenirovaniya kontrol'nogo regiona mtDNK // Izvestiya PGPU im. V.G. Belinskogo. – 2011. – № 25. – S. 176–180./
Загороднюк I., Кондратенко O. Сучасне поширення і стан популяцій ховрахів (Spermophilus) на сході України // Теріофауна сходу України (Праці Теріологічної школи, випуск 7). – Луганськ, 2006. – C. 211–214. /Zagorodnyuk I., Kondratenko O. Suchasne poshirennya і stan populyatsіy khovrakhіv (Spermophilus) na skhodі Ukrayiny // Terіofauna skhodu Ukrayiny (Pratsi Terіologіchnoyi shkoly, vypusk 7) – Lugans'k, 2006. – S. 211–214./
Загороднюк И.В., Федорченко А.А. Аллопатрические виды среди грызунов группы Spermophilus suslicus (Mammalia) // Вестник зоологии. – 1995. – Т.29, № 5–6. – С. 49–58. /Zagorodnyuk I.V., Fedorchenko A.A. Allopatricheskiye vidy sredi gryzunov gruppy Spermophilus suslicus (Mammalia) // Vestnik zoologii. – 1995. – T.29, №5–6. – S. 49–58./
Киндюк Б.В. Исследование происхождения и развития речной сети Украинских Карпат // Культура народов Причерноморья. – 2003. – №43. – С. 26–30. /Kindyuk B.V. Issledovaniye proiskhozhdeniya i razvitiya rechnoy seti Ukrainskikh Karpat // Kul'tura narodov Prichernomor'ya. – 2003. – №43. – S. 26–30./
Кораблев В.П., Сузуки Х., Ляпунова Е.А. и др. Молекулярно-генетическое изучение хромосомных форм крапчатого суслика Spermophilus suslicus Guld., 1770 // VI съезд Териологического об-ва. Тез. докл. – Москва, 1999. – С. 125. /Korablev V.P., Suzuki Kh., Lyapunova Ye.A. i dr. Molekulyarno-geneticheskoye izucheniye khromosomnykh form krapchatogo suslika Spermophilus suslicus Guld., 1770 // VI s’yezd Teriologicheskogo ob-va. Tez. dokl. – Moskva, 1999. – S. 125./
Матросова В.А., Савинецкая Л.Е., Шекарова О.Н. и др. Внутри- и межпопуляционный полиморфизм контрольного региона митохондриальной ДНК у крапчатого суслика (Spermophilus suslicus) // Доклады Академии наук. – 2014. – Т.455, №6. – С. 721–726. /Matrosova V.A., Savinetskaya L.Ye., Shekarova O.N. i dr . Vnutri- i mezhpopulyatsionnyy polimorfizm kontrol'nogo regiona mitokhondrial'noy DNK u krapchatogo suslika (Spermophilus suslicus) // Doklady Akademii nauk. – 2014. – T.455, №6. – S. 721–726.
Огнев С.И. Звери СССР и прилежащих стран. Т.5. Грызуны. – М.-Л.: Изд-во АН СССР, 1947. – 809с. /Ognev S.I. Zveri SSSR i prilezhashchikh stran. T. 5. Gryzuny. – M.-L.: Izd-vo AN SSSR, 1947. – 809s./
Смирнова О.В., Турубанова С.А., Бобровский М.В. и др. Реконструкция истории лесного пояса Восточной Европы и проблема поддержания биологического разнообразия // Успехи современной биологии. – 2001. – Т.121, №2. – С. 144–159. /Smirnova O.V., Turubanova S.A., Bobrovskiy M.V. i dr. Rekonstruktsiya istorii lesnogo poyasa Vostochnoy Yevropy i problema podderzhaniya biologicheskogo raznoobraziya // Uspekhi sovremennoy biologii. – 2001. – T.121, №2. – S. 144–159./
Титов С.В. Современное распространение и изменение численности крапчатого суслика, Spermophilus suslicus, в восточной части ареала // Зоологический журнал. – 2001. – Т.80, №2. – С. 230–235. /Titov S.V. Sovremennoye rasprostraneniye i izmeneniye chislennosti krapchatogo suslika, Spermophilus suslicus, v vostochnoy chasti areala // Zoologicheskiy zhurnal. – 2001. – T.80, №2. – S. 230–235./
Фрисман Л.В., Кораблев В.П., Ляпунова Е.А. и др. Аллозимная дифференциация разнохромосомных форм крапчатого суслика (Spermophilus suslicus Guld, 1770, Rodentia) // Генетика. – 1999. – Т.35, №3. – С.378–384. /Frisman L.V., Korablev V.P., Lyapunova Ye.A. i dr. Allozimnaya differentsiatsiya raznokhromosomnykh form krapchatogo suslika (Spermophilus suslicus Guld, 1770, Rodentia) // Genetika. – 1999. – T. 35, №3. – S. 378–384./
Цвирка М.В., Кораблев В.П., Челомина Г.Н. Исследование генетической изменчивости крапчатого суслика Spermophilus suslicus Güld, 1770 (Rodentia, Sciuridae) // Териофауна России и сопредельных территорий: Мат. межд. совещ. – Москва, 2003. – С.376. /Tsvirka M.V., Korablev V.P., Chelomina G.N. Issledovaniye geneticheskoy izmenchivosti krapchatogo suslika Spermophilus suslicus Güld, 1770 (Rodentia, Sciuridae) // Teriofauna Rossii i sopredel'nykh territoriy: Mat. mezhd. soveshch. – Moskva, 2003. – S.376./
Шилова С.А., Неронов В.В., Шекарова О.Н., Савинецкая Л.Е. Динамика поселений крапчатого суслика (Spermophilus suslicus Guld., 1770) на северной границе ареала // Известия РАН. Сер. биологическая. – 2010. – №5. – С. 619–624. /Shilova S.A., Neronov V.V., Shekarova O.N., Savinetskaya L.Ye. Dinamika poseleniy krapchatogo suslika (Spermophilus suslicus Guld., 1770) na severnoy granitse areala // Izvestiya RAN. Ser. biologicheskaya. – 2010. – №5. – S. 619–624./
Aljanabi S.M., Martinez I. Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques // Nucl. Acids Res. – 1997. – Vol.25. – P. 4692–4693.
Bandelt H-J., Forster P., Röhl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Mol. Biol. Evol. – 1999. – Vol.16, No1. – P. 37–48.
Biedrzycka A., Radwan J. Population fragmentation and major histocompatibility complex variation in the spotted suslik, Spermophilus suslicus // Molecular Ecology. – 2008. – Vol.17. – P. 4801–4811.
Ermakov O.A., Simonov E., Surin V.L. et al. Implications of hybridization, NUMTs, and overlooked diversity for DNA barcoding of Eurasian ground squirrels // PLoS ONE. – 2015. – Vol.10 (1). – e0117201.
Ford C.E., Hamerton J.L. A colchicine, hypotonic citrate, squash sequence for mammalian chromosomes // Stain Technol. – 1956. – Vol.31, №6. – P. 247–251.
Kocher T.D., Thomas W.K., Meyer A. Dynamics of mitochondrial DNA evolution in animals: amplification and sequencing with conserved primers // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 1989. – Vol.86. – P. 6196–6200.
Tamura K., Stecher G., Peterson D. et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. // Molecular Biology and Evolution. – 2013. – Vol.30. – P. 2725–2729.
Authors retain copyright of their work and grant the journal the right of its first publication under the terms of the Creative Commons Attribution License 4.0 International (CC BY 4.0), that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship.
