Іон-фосфатні коливання ДНК у В- та А-формах
Ключові слова:
ДНК, іони, низькочастотний спектр, коливання, частота, амплітуда
Анотація
Побудовано модель коливальної динаміки макромолекули ДНК з протиіонами, що нейтралізують фосфатні групи кістяка подвійної спіралі. Для В- і А-форм ДНК визначені параметри моделі, яка описує іон-фосфатні коливання. Розрахован спектр конформаційних коливань ДНК для іонів Li+, Na+, K+, Rb+ та Cs+. Показано, що частота іон-фосфатних коливань лежить в діапазоні від 90 до 250 см-1 і залежить від сорту протиіону. При переході подвійної спіралі з В -форми в А, частота іон-фосфатних коливань змінюється. Результати розрахунків якісно узгоджуються з експериментальними даними.
Завантаження
##plugins.generic.usageStats.noStats##
Посилання
1. Благой Ю. П., Галкин В. Л., Гладченко Г. О. Корнилова С. В., Сорокин В. А., Шкорбатов А. Г. Металлокомплексы нуклеиновых кислот в растворах. Киев: Наукова думка, 1991.
2. Weidlich T.et al. II Biopolymers. 1990. V. 30. P. 477 -480.
3. Perepelytsya S. M., Volkov S. N. // Ukr. J. Phys. 2004. T. 49. C. 1072 - 1077.
4. Волков С. Н. Косевич А. М. // Молекулярная биология 1987. Т. 21. С. 797 - 8 06.
5. Волков С. Н., Косевич А. М., Вайнреб Г.Е. // Биополимеры и клетка 1989. Т. 5. С. 32 - 39.
6. Volkov S. N., Kosevich A. M. // J. Biomolec. Struct. Dyn. 1991. V. 8. P. 1069 - 1083.
7. Зенгер В. Принципы структурной организации нуклеинових кислот. - Москва: Мир. 1987.
8. Moelwyn-Hughes E. A. Physical Chemistry. London-New York-Paris: Pergamon Press, 1961.
9. Ramstein J., Lavery R. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988. V. 85. P. 7231 - 7235.
10. Ivanov V. I., Vinchemkova L. E. et al. II Biopolymers 1973. V. 12. P. 89 -110.
11. Ахадов А. Ю. Диэлектрические свойства бинарных растворов. Москва: Наука, 1977.
12. Киттель Ч. Введение в физику твердого тела. - Москва: Государственное издательство физико-математической литературы, 1963.
13. Lindsay S. M., Powell J. W„ Rupprecht A. // Phys. Rev. Lett. 1984. V. 53. P. 1853 - 1855.
14. Demarco C. et al. II Biopolymers 1985. V. 24. P. 2035 - 2040.
15. Powell J. W. et al. II Phys. Rev A. 1987. V. 35. P. 3929 - 3939.
16. Weidlich T., Lindsay S. M., Ruprecht A. // Phys. Rev. Left. 1988. V. 61. P. 1674 - 677.
17. Lamba Om. P. ,Wang A. H.-J., Thomas G. J. Jr. // Biopolimers 1989. V. 28. P. 667 - 678.
18. Urabe H. et al. II J. Chem. Phys. 1990. V. 92. P. 768 - 774.
19. Weidich T. et al. // J. Biomolec. Struct. Dyn. 1990. V. 8. P. 139 -171.
2. Weidlich T.et al. II Biopolymers. 1990. V. 30. P. 477 -480.
3. Perepelytsya S. M., Volkov S. N. // Ukr. J. Phys. 2004. T. 49. C. 1072 - 1077.
4. Волков С. Н. Косевич А. М. // Молекулярная биология 1987. Т. 21. С. 797 - 8 06.
5. Волков С. Н., Косевич А. М., Вайнреб Г.Е. // Биополимеры и клетка 1989. Т. 5. С. 32 - 39.
6. Volkov S. N., Kosevich A. M. // J. Biomolec. Struct. Dyn. 1991. V. 8. P. 1069 - 1083.
7. Зенгер В. Принципы структурной организации нуклеинових кислот. - Москва: Мир. 1987.
8. Moelwyn-Hughes E. A. Physical Chemistry. London-New York-Paris: Pergamon Press, 1961.
9. Ramstein J., Lavery R. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988. V. 85. P. 7231 - 7235.
10. Ivanov V. I., Vinchemkova L. E. et al. II Biopolymers 1973. V. 12. P. 89 -110.
11. Ахадов А. Ю. Диэлектрические свойства бинарных растворов. Москва: Наука, 1977.
12. Киттель Ч. Введение в физику твердого тела. - Москва: Государственное издательство физико-математической литературы, 1963.
13. Lindsay S. M., Powell J. W„ Rupprecht A. // Phys. Rev. Lett. 1984. V. 53. P. 1853 - 1855.
14. Demarco C. et al. II Biopolymers 1985. V. 24. P. 2035 - 2040.
15. Powell J. W. et al. II Phys. Rev A. 1987. V. 35. P. 3929 - 3939.
16. Weidlich T., Lindsay S. M., Ruprecht A. // Phys. Rev. Left. 1988. V. 61. P. 1674 - 677.
17. Lamba Om. P. ,Wang A. H.-J., Thomas G. J. Jr. // Biopolimers 1989. V. 28. P. 667 - 678.
18. Urabe H. et al. II J. Chem. Phys. 1990. V. 92. P. 768 - 774.
19. Weidich T. et al. // J. Biomolec. Struct. Dyn. 1990. V. 8. P. 139 -171.
Опубліковано
2005-06-06
Цитовано
Як цитувати
Перепелиця, С. Н., & Волков , С. (2005). Іон-фосфатні коливання ДНК у В- та А-формах. Біофізичний вісник, 1(15), 5-10. вилучено із https://periodicals.karazin.ua/biophysvisnyk/article/view/17979
Розділ
Молекулярна біофізика
Авторське право (c) 2005 Биофизический вестник
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
