Філогенія ортологів генів β-естераз за межами роду Drosophila

Автор(и)

  • С. Л. Пастернак Одеський національний університет імені І.І.Мечникова, вул. Дворянська, 2, Одеса, 65082, Україна, biopaster@gmail.com
  • А. М. Венгер Міжнародний гуманітарний університет, Фонтанська дорога, 33, Одеса, 65009, Україна, venger87@ukr.net
  • О. О. Колесник Селекційно-генетичний інститут – Національний центр насіннєзнавства та сортовивчення, Овідіопільська дорога, 3, Одеса, 65036, Україна, emerald-olga@ukr.net
  • В. О. Малиновський Міжнародний гуманітарний університет, Фонтанська дорога, 33, Одеса, 65009, Україна, vmalinovskii@rambler.ru

DOI:

https://doi.org/10.26565/2075-5457-2017-28-4

Ключові слова:

філогенія, гомологи, ортологи, кластер, Est-6, β-естерази, дрозофіли

Анотація

Гени β-естераз дрозофіл мають життєво важливі функції та присутні у всіх представників роду. Найбільш досліджений представник цих генів – Est-6 Drosophila melanogaster – грає важливу роль у репродукції. Але на даний час практично нічого не відомо про наявність та кількість цих генів у інших видів комах та їх молекулярну еволюцію. За допомогою пошукового інструменту BLAST знайдені нуклеотидні послідовності ортологів генів Est-6 D. melanogaster у 10 видів комах, що належать до 5 рядів. Показано, що послідовності β-естераз дрозофіл входять у один кластер з ортологічними послідовностями комарів Anopheles gambie, Aedes aegypti та Culex quinquefasciatus (ряд Diptera). Сестринський йому кластер утворюють ортологічні послідовності представників інших рядів інфракласу Neoptera. У представників таксонів Crustacea (Daphnia pulex), Myriapoda (Strigamia maritima) та Chelicerata (Tetranychus urticae) ортологи Est-6 не знайдені. За допомогою інструменту TimeTree обґрунтований ймовірний часовий проміжок виникнення генів, ортологічних генам β-естераз представників роду Drosophila. Обговорюється гіпотеза про виникнення предкових β-естеразам дрозофіл генів на ранніх етапах становлення класу Insecta.

Завантаження

Номер

Том 28 (2017)

Розділ

ГЕНЕТИКА

Ліцензія

Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої її публікації на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License 4.0 International (CC BY 4.0), яка дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи.

Автори мають право укладати додаткові невиключні угоди щодо поширення опублікованої версії роботи (наприклад, розміщення в інституційних репозитаріях або публікація у збірниках) за умови зазначення її первинної публікації в цьому журналі.

Як цитувати

Філогенія ортологів генів β-естераз за межами роду Drosophila. (2017). Вісник Харківського національного університету імені В. Н. Каразіна. Серія «Біологія», 28, 29-33. https://doi.org/10.26565/2075-5457-2017-28-4