Комплекс Schistosoma japonicum: варіації COI-послідовностей паразитів та їх проміжних господарів, проаналізованих за допомогою BLAST

Анотація

У цьому дослідженні я розглядаю взаємозв'язок між S. ovuncatum, S. sinensium, S. japonicum, S. mekongi та S. malayensis. Крім того, я аналізую взаємозв'язок між п’ятьма видами роду Oncomelania та Neotricula aperta, Robertsiella spp. і Tricula spp. Також я описую формування роду Oncomelania з його попередніх форм. Результати нуклеотидного аналізу за допомогою BLAST показали, що S. japonicum має 99,45% ідентичності з S. malayensis, 98,77% з S. mekongi, 98,07% з S. sinensium і 97,85% з S. ovuncatum. Послідовність S. malayensis виявила 100% ідентичності з S. mekongi. Значення E було меншим за 0,01. У результатах вирівнювання амінокислотних послідовностей у комплексі S. japonicum не було виявлено замін. У S. malayensis і S. mekongi не зафіксовано замін основ, між S. malayensis і S. sinensium виявлено 37 замін основ, між S. malayensis і S. japonicum — 10 замін основ, між S. malayensis і S. ovuncatum — 5 замін основ. На кладограмі було показано, що S. sinensium є сестринським видом до S. ovuncatum. Від них відокремився S. japonicum. Schistosoma japonicum розділився на S. mekongi та S. malayensis. Результати також показали, що Oncomelania robertsoni має 86,12% ідентичності з Neotricula aperta, 85,88% з Robertsiella spp. і 85,28% з Tricula bollingi. Значення E було меншим за 0,01. У вирівнюванні O. robertsoni та N. aperta виявлено дві заміни амінокислот, чотири заміни амінокислот і 84 заміни основ між O. robertsoni та Robertsiella spp., а також дві заміни амінокислот і 88 замін основ між O. robertsoni та T. bollingi. На нахиленому кладограмі дерево показало, що Tricula spp. розділився на N. aperta та Robertsiella spp. Це дослідження показало, що Oncomelania виник з попередніх форм. Результати нуклеотидного BLAST підтвердили, що S. ovuncatum близький до S. sinensium. Schistosoma sinensium розділився на S. japonicum, S. mekongi і S. malayensis. Oncomelania robertsoni був ближчий до N. aperta, ніж до Robertsiella spp., і до Tricula spp. (Tricula bollingi). Види роду Oncomelania виникли з їхніх попередників.